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Sox2ot-flox 基因敲除小鼠

Sox2ot-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Sox2ot-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-17447

品系全称

C57BL/6JCya-Sox2otem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-320478-Sox2ot-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Sox2ot-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-17447) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SOX2 overlapping transcript (non-protein coding)
基因别称
B230215L15Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NR_015580 | Ensembl: ENSMUST00000197977
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~3.7 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
SOX2OT，也称为Sox2 overlapping transcript，是一种重要的长非编码RNA（lncRNA）。SOX2OT基因位于人染色体3q26.3区域，其结构包括10个外显子和两个以上的转录起始位点。SOX2OT在胚胎干细胞中高度表达，并在分化过程中下调。它携带一个主要的多能性调节因子——SOX2基因，SOX2基因位于SOX2OT基因的第三个内含子区域。因此，SOX2OT在细胞多能性和分化过程中可能发挥重要作用[5]。

近年来，研究发现SOX2OT在多种癌症中表达异常，包括肺癌、胃癌、食管癌、乳腺癌、肝细胞癌、卵巢癌、胰腺导管腺癌、喉鳞状细胞癌、胆管癌、骨肉瘤、鼻咽癌和胶质母细胞瘤。在这些癌症中，SOX2OT通常作为致癌基因发挥作用，也可能作为肿瘤抑制基因。SOX2OT的失调涉及多个因素和信号通路，其确切机制尚不完全清楚。然而，已有研究表明，SOX2OT通过多种途径影响癌症的发生和发展，包括调节细胞周期、促进细胞增殖、抑制细胞凋亡和影响肿瘤微环境[2]。

为了研究SOX2OT在神经管闭合和胚胎发育中的作用，研究人员利用CRISPR-Cas9基因编辑技术删除了小鼠中的SOX2OT启动子，导致SOX2OT基因表达截断。研究发现，SOX2OT启动子删除小鼠的神经管闭合和胚胎发育没有受到影响，这表明SOX2OT可能不是神经管闭合和胚胎发育所必需的[1]。

此外，SOX2OT的剪接变异体在脑肿瘤中也表现出不同的表达模式。在胶质瘤、脑膜瘤和垂体腺瘤中，SOX2OT的两个剪接变异体（SOX2OT-S1和SOX2OT-S2）以及SOX2的表达模式不同，这表明它们可能在脑肿瘤的发生和发展中发挥不同的作用。因此，SOX2OT及其剪接变异体可能是脑肿瘤分子诊断和分类的潜在生物标志物[3]。

SOX2OT的敲低还会影响癌细胞的基因表达网络，特别是细胞周期和有丝分裂调控基因的表达。例如，SOX2OT敲低会改变CDK2、CDK2AP2、ACTR3和与染色体结构相关的基因（如SMC4、INCENP和GNL3L）的表达。这些结果表明，SOX2OT可能通过调节细胞周期和有丝分裂调控基因的表达来影响癌细胞增殖[4]。

SOX2OT的表达失调还与心肌纤维化（MF）有关。研究发现，在心力衰竭（HF）小鼠和ISO诱导的心肌成纤维细胞（CFs）中，SOX2OT表达上调。SOX2OT的敲低可以减少HF小鼠的心肌损伤和胶原沉积，抑制胶原蛋白I、α-SMA、TGF-β1和p-Smad3的表达。此外，SOX2OT可以与Smad3相互作用，形成正反馈回路，进一步促进MF。因此，SOX2OT可能是HF中MF治疗的潜在靶点[6]。

在膀胱癌中，SOX2OT的表达水平与高组织学分级、晚期TNM分期和不良预后相关。SOX2OT的敲低可以抑制膀胱癌干细胞（BCSCs）的干细胞表型，包括抑制肿瘤球的形成和紫杉醇耐药性。机制研究表明，SOX2OT主要分布在细胞质中，并通过海绵化miR-200c来正向调节SOX2的表达。因此，SOX2OT可能是膀胱癌的潜在诊断生物标志物和治疗靶点[7]。

最后，SOX2OT还可以通过介导EZH2/Nrf-2/NLRP3信号通路抑制细胞焦亡，从而减轻脓毒症引起的心肌损伤。研究发现，SOX2OT的敲低会加剧LPS诱导的炎症因子和降钙素原（PCT）的水平，增加与焦亡相关的蛋白质和LDH的表达。SOX2OT的过表达可以减轻脓毒症心肌病（SIMD）的症状，改善心肌结构的完整性，减少炎症细胞的浸润。因此，SOX2OT可能是脓毒症心肌损伤治疗的潜在靶点[8]。

综上所述，SOX2OT是一种重要的lncRNA，在细胞多能性、分化、癌症发生和发展、心肌纤维化和脓毒症心肌损伤等多种生物学过程中发挥重要作用。SOX2OT通过多种途径和信号通路影响这些生物学过程，包括调节细胞周期、促进细胞增殖、抑制细胞凋亡、影响肿瘤微环境、介导染色质修饰和调节细胞焦亡。因此，SOX2OT可能是多种疾病治疗的潜在靶点，其研究有助于深入理解lncRNA的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Li, Pu-Yu, Li, San-Qiang, Gao, She-Gan, Dong, Dao-Yin. 2021. CRISPR/Cas9-mediated gene editing on Sox2ot promoter leads to its truncated expression and does not influence neural tube closure and embryonic development in mice. In Biochemical and biophysical research communications, 573, 107-111. doi:10.1016/j.bbrc.2021.08.029. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34403806/
2. Wang, Ying, Wu, Nayiyuan, Luo, Xia, Liao, Qianjin, Wang, Jing. 2019. SOX2OT, a novel tumor-related long non-coding RNA. In Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie, 123, 109725. doi:10.1016/j.biopha.2019.109725. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31865145/
3. Fouani, Youssef, Gholipour, Akram, Oveisee, Maziar, Mowla, Seyed Javad, Malakootian, Mahshid. . Distinct gene expression patterns of SOX2 and SOX2OT variants in different types of brain tumours. In Journal of genetics, 102, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37017197/
4. Saghaeian Jazi, Marie, Samaei, Nader Mansour, Mowla, Seyed Javad, Arefnezhad, Babak, Kouhsar, Morteza. 2018. SOX2OT knockdown derived changes in mitotic regulatory gene network of cancer cells. In Cancer cell international, 18, 129. doi:10.1186/s12935-018-0618-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30202240/
5. Shahryari, Alireza, Jazi, Marie Saghaeian, Samaei, Nader M, Mowla, Seyed J. 2015. Long non-coding RNA SOX2OT: expression signature, splicing patterns, and emerging roles in pluripotency and tumorigenesis. In Frontiers in genetics, 6, 196. doi:10.3389/fgene.2015.00196. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26136768/
6. Ou, Yali, Liao, Chunfeng, Li, He, Yu, Guolong. 2020. LncRNA SOX2OT/Smad3 feedback loop promotes myocardial fibrosis in heart failure. In IUBMB life, 72, 2469-2480. doi:10.1002/iub.2375. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32959533/
7. Zhan, Yonghao, Chen, Zhicong, He, Shiming, Li, Xuesong, Zhou, Liqun. 2020. Long non-coding RNA SOX2OT promotes the stemness phenotype of bladder cancer cells by modulating SOX2. In Molecular cancer, 19, 25. doi:10.1186/s12943-020-1143-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32019566/
8. Bai, Xue, Yang, LiTing, Liu, Ruxin, Chen, MengFei, Zhang, Ling. 2024. Long Noncoding RNA SOX2OT Ameliorates Sepsis-Induced Myocardial Injury by Inhibiting Cellular Pyroptosis Through Mediating the EZH2/Nrf-2/NLRP3 Signaling Pathway. In Journal of inflammation research, 17, 3115-3127. doi:10.2147/JIR.S451643. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38774445/

资料下载

S-CKO-17447_6J_320478_Sox2ot_Exon 5_strategy.pdf
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