Pcdhb6-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pcdhb6-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-17194

品系全称

C57BL/6JCya-Pcdhb6em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-93877-Pcdhb6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pcdhb6-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-17194) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
protocadherin beta 6
基因别称
Pcdhb5B,PcdhbF
染色体号
Chr 18 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_053131 | Ensembl: ENSMUST00000061717
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~3.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Pcdhb6,即钙黏蛋白基因家族中的基因,属于钙黏蛋白基因簇的一部分,该基因簇在细胞粘附和细胞通讯中起着关键作用。钙黏蛋白是一类细胞表面分子,介导细胞间的粘附和通讯,对细胞生长、发育和组织形态的维持至关重要。Pcdhb6基因编码的蛋白属于钙黏蛋白家族的成员,这一家族的蛋白在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括胚胎发育、神经系统的形成和功能、以及肿瘤的发生和发展。

Pcdhb6基因在肝脏肿瘤组织中的表达与肝癌的分子分类有关。研究发现,肝癌可以分为不同的分子亚型,这些亚型具有不同的临床特征、预后和免疫浸润情况。在基于Wnt-Hippo信号通路相关基因的表达所建立的新分类系统中,Pcdhb6基因的表达水平与肝癌的某些亚型相关。例如,在参考文献1中,研究者通过对100名肝癌患者的肝肿瘤组织进行RNA测序,并分析272个Wnt-Hippo信号通路相关基因的表达数据,发现Pcdhb6基因在HCCW4亚型中的表达水平最高,这一亚型与较差的预后相关,并且表现出Th1细胞、NKT细胞和类转换记忆B细胞的相对高丰度,以及cDC、iDC和CD4+记忆T细胞的相对低富集[1]。

此外,Pcdhb6基因的表达还与缺血性脑卒中的DNA甲基化模式有关。在参考文献2中,研究者发现7个基因的DNA甲基化水平与缺血性脑卒中的风险相关,其中包括Pcdhb6基因。这些基因的甲基化水平与缺血性脑卒中的风险呈正相关,提示DNA甲基化可能在这一疾病的发生发展中发挥着重要作用[2]。

Pcdhb6基因还与神经认知健康有关。在参考文献3中,研究者发现母体叶酸缺乏会导致成年小鼠大脑中Art3基因的DNA低甲基化,而Pcdhb6基因的DNA甲基化水平在母体叶酸缺乏组中未发现显著差异。这表明Pcdhb6基因的DNA甲基化可能与神经认知健康有关,但其具体作用机制尚需进一步研究[3]。

在动物模型中,Pcdhb6基因的缺失也与多种生物学过程相关。在参考文献4中,研究者发现Ms5Yah小鼠模型中,Pcdhb6基因的缺失导致细胞粘附相关途径的基因剂量效应,表现为生长迟缓、运动协调障碍和空间学习和记忆障碍。这表明Pcdhb6基因在维持正常的生理功能中发挥着重要作用[4]。

在奶牛中,Pcdhb6基因的变异与牛奶蛋白的组成相关。在参考文献5中,研究者通过对614头中国荷斯坦奶牛进行全基因组关联分析,发现Pcdhb6基因的变异与牛奶蛋白的组成相关,这表明Pcdhb6基因可能在牛奶蛋白的合成中发挥作用[5]。

最后,在山羊中,Pcdhb6基因与神经发育和繁殖性状相关。在参考文献6中,研究者发现Pcdhb6基因在Baiyu黑山羊和Chuanzhong黑山羊中的表达水平存在差异,且与神经发育和繁殖性状相关。这表明Pcdhb6基因可能在山羊的生长发育和繁殖过程中发挥着重要作用[6]。

综上所述,Pcdhb6基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括肝脏肿瘤的发生发展、缺血性脑卒中的风险、神经认知健康、动物的生长发育和繁殖等。Pcdhb6基因的表达水平和DNA甲基化状态与这些生物学过程密切相关,但其具体作用机制尚需进一步研究。

参考文献:
1. Chang, Ya-Sian, Chou, Yu-Pao, Chung, Chin-Chun, Jeng, Long-Bin, Chang, Jan-Gowth. 2022. Molecular Classification of Hepatocellular Carcinoma Using Wnt-Hippo Signaling Pathway-Related Genes. In Cancers, 14, . doi:10.3390/cancers14194580. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36230503/
2. Sun, Hongwei, Xu, Jia, Hu, Bifeng, Tang, Ying, Zhao, Jingbo. 2022. Association of DNA Methylation Patterns in 7 Novel Genes With Ischemic Stroke in the Northern Chinese Population. In Frontiers in genetics, 13, 844141. doi:10.3389/fgene.2022.844141. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35480311/
3. Kok, Dieuwertje E, Saunders, Rachael, Nelson, Andrew, Mathers, John C, McKay, Jill A. . Influence of maternal folate depletion on Art3 DNA methylation in the murine adult brain; potential consequences for brain and neurocognitive health. In Mutagenesis, 39, 196-204. doi:10.1093/mutage/geae007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38417824/
4. Arbogast, Thomas, Raveau, Matthieu, Chevalier, Claire, Duchon, Arnaud, Herault, Yann. 2015. Deletion of the App-Runx1 region in mice models human partial monosomy 21. In Disease models & mechanisms, 8, 623-34. doi:10.1242/dmm.017814. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26035870/
5. Zhou, Chenghao, Li, Cong, Cai, Wentao, Zhang, Qin, Zhang, Shengli. 2019. Genome-Wide Association Study for Milk Protein Composition Traits in a Chinese Holstein Population Using a Single-Step Approach. In Frontiers in genetics, 10, 72. doi:10.3389/fgene.2019.00072. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30838020/
6. Luo, Jing, Min, Qi, Sun, Xueliang, Han, Yanguo, Li, Li. 2024. Comparative Whole-Genome Analysis of Production Traits and Genetic Structure in Baiyu and Chuanzhong Black Goats. In Animals : an open access journal from MDPI, 14, . doi:10.3390/ani14243616. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39765520/