Zdhhc16-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Zdhhc16-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-15891

品系全称

C57BL/6JCya-Zdhhc16em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-74168-Zdhhc16-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Zdhhc16-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-15891) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
zinc finger, DHHC domain containing 16
基因别称
1500015N03Rik,Aph2
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_023740 | Ensembl: ENSMUST00000026154
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~1.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1921418Mice homozygous for a null mutation display prenatal and neonatal lethality with bradycardia, abnormal heart morphology and eye defects.
ZDHHC16,也称为Zinc finger, DHHC-type containing 16,是一种编码蛋白,属于DHHC家族的成员。DHHC家族蛋白是一类具有DHHC结构域的蛋白质,主要负责蛋白棕榈酰化,即通过将棕榈酸共价连接到蛋白质的特定氨基酸残基上,从而调节蛋白质的定位、稳定性和功能。棕榈酰化是蛋白质翻译后修饰的一种重要形式,参与多种生物学过程,包括细胞信号传导、膜蛋白定位、蛋白-蛋白相互作用和细胞骨架的组装等。

ZDHHC16在多种组织和细胞类型中表达,包括肺组织、神经组织、骨髓等。其功能与多种生物学过程相关,包括细胞增殖、分化、迁移、DNA损伤应答、神经发生和骨生成等。ZDHHC16通过棕榈酰化修饰其底物蛋白,从而影响这些蛋白的功能和活性,进而调节相关生物学过程。

根据参考文献内容,ZDHHC16在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中表达上调,并且其表达水平与NSCLC患者的预后相关。ZDHHC16的表达受到m6A甲基化的调节,m6A甲基化是一种RNA表观遗传修饰,参与调控RNA的稳定性和功能。在NSCLC中,METTL3介导的m6A修饰可以增强ZDHHC16的表达,从而抑制铁死亡并促进细胞增殖和转移[1]。

ZDHHC16还在DNA损伤应答中发挥重要作用。蛋白棕榈酰化是DNA损伤应答中的一个关键步骤,可以激活DNA损伤修复信号通路,促进细胞周期停滞和细胞凋亡。ZDHHC16作为棕榈酰转移酶,在DNA损伤应答中发挥重要作用,通过棕榈酰化修饰其底物蛋白,从而影响DNA损伤修复信号通路的激活和细胞凋亡的发生[2]。

在神经系统中,ZDHHC16参与神经干/祖细胞(NSPCs)的增殖和分化。ZDHHC16通过其棕榈酰转移酶活性调节NSPCs的增殖,并激活FGF/ERK信号通路,从而促进NSPCs的增殖和分化[3]。

ZDHHC16还在骨生成过程中发挥重要作用。在骨髓间充质干细胞(hBMSCs)的成骨分化过程中,ZDHHC16的表达下调,并且其表达水平与成骨分化的程度呈负相关。ZDHHC16通过抑制CREB的磷酸化,从而抑制成骨分化过程[4]。

此外,ZDHHC16还与发育障碍相关。在发育障碍患者中,ZDHHC16的编码变异与疾病的发生和进展相关。ZDHHC16的编码变异可以影响其棕榈酰转移酶活性,从而影响其底物蛋白的功能和活性,进而影响相关生物学过程[5]。

ZDHHC16还与肝细胞癌(HCC)的发生和发展相关。在HCC患者中,ZDHHC16的表达水平与患者的预后相关。ZDHHC16的表达受到可变剪接的调节,可变剪接是一种RNA加工过程,可以产生不同的mRNA和蛋白质,从而影响基因表达和生物学过程。ZDHHC16的可变剪接可以影响其底物蛋白的功能和活性,进而影响HCC的发生和发展[6]。

ZDHHC16还与葡萄膜黑色素瘤的发生和发展相关。在葡萄膜黑色素瘤细胞中,ZDHHC16的表达受到SF3B1突变的影响。SF3B1是一种剪接因子,参与RNA剪接过程。SF3B1突变可以影响RNA剪接过程,从而导致ZDHHC16的表达水平发生改变。ZDHHC16的表达水平与葡萄膜黑色素瘤细胞的增殖和生存相关[7]。

最后,ZDHHC16还与急性肾损伤(AKI)的发生和发展相关。在AKI患者中,ZDHHC16的表达水平发生变化,并且其表达水平与AKI的严重程度相关。ZDHHC16的表达受到RNA结合蛋白RBFOX1的调控。RBFOX1是一种RNA结合蛋白,参与RNA的剪接和转运过程。RBFOX1可以与ZDHHC16的mRNA结合,从而影响ZDHHC16的表达水平[8]。

综上所述,ZDHHC16是一种重要的DHHC家族蛋白,参与多种生物学过程,包括细胞增殖、分化、迁移、DNA损伤应答、神经发生和骨生成等。ZDHHC16在多种疾病中发挥重要作用,包括NSCLC、DNA损伤应答、NSPCs的增殖和分化、骨生成、发育障碍、HCC、葡萄膜黑色素瘤和AKI等。ZDHHC16的研究有助于深入理解DHHC家族蛋白的功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Zeyu, Jing, Chuanqing, Zhang, Wei. 2024. METTL3-mediated m6A modification enhances ZDHHC16 expression in nonsmall- cell lung cancer patients, attenuating ferroptosis by suppressing CREB ubiquitination. In Cellular and molecular biology (Noisy-le-Grand, France), 70, 30-37. doi:10.14715/cmb/2024.70.2.5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38430044/
2. Cao, Na, Li, Jia-Kai, Rao, Yu-Qing, Zeng, Li, Li, Jing. 2016. A potential role for protein palmitoylation and zDHHC16 in DNA damage response. In BMC molecular biology, 17, 12. doi:10.1186/s12867-016-0065-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27159997/
3. Shi, Wei, Chen, Xueran, Wang, Fen, He, Kun, Hao, Aijun. 2016. ZDHHC16 modulates FGF/ERK dependent proliferation of neural stem/progenitor cells in the zebrafish telencephalon. In Developmental neurobiology, 76, 1014-28. doi:10.1002/dneu.22372. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26663717/
4. Li, Zhiwei, Cheng, Yuan, Jin, Xiangyun, Liu, Shenghe, Zhang, Chao. 2023. ZDHHC16 restrains osteogenic differentiation of bone marrow mesenchymal stem cells by inhibiting phosphorylation of CREB. In Heliyon, 9, e12788. doi:10.1016/j.heliyon.2022.e12788. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36685387/
5. Chundru, V Kartik, Zhang, Zhancheng, Walter, Klaudia, Ustach, Vincent D, Martin, Hilary C. 2024. Federated analysis of autosomal recessive coding variants in 29,745 developmental disorder patients from diverse populations. In Nature genetics, 56, 2046-2053. doi:10.1038/s41588-024-01910-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39313616/
6. Xu, Qianhui, Xu, Hao, Deng, Rongshan, Weng, Di, Huang, Wen. 2021. Immunological significance of prognostic alternative splicing signature in hepatocellular carcinoma. In Cancer cell international, 21, 190. doi:10.1186/s12935-021-01894-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33794886/
7. Xu, Dongmei, Liu, Hua, Deng, Xiaoyu, Fu, Jifan. . ZDHHC16 promoted neurocyte ferroptosis by suppression of CREB in a cerebral apoplexy model. In Folia neuropathologica, 62, 386-395. doi:10.5114/fn.2024.145878. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39963033/
8. Lv, Zhenyi, Gao, Wenqi, Du, Zhiwei, Hao, Chenjun, Xue, Dongbo. 2023. Alternative splicing of IRF3 plays an important role in the development of hepatocarcinoma. In Epigenetics, 18, 2276371. doi:10.1080/15592294.2023.2276371. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37926963/