智鼠故事 
C57BL/6JCya-Atg16l2em1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称：
Atg16l2-flox
产品编号：
S-CKO-15740
品系背景：
C57BL/6JCya
* 使用本品系发表的文献需注明：Atg16l2-flox mice (Strain S-CKO-15740) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
只
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Atg16l2em1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-73683-Atg16l2-B6J-VA
产品编号
S-CKO-15740
基因名
Atg16l2
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
2410118P20Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
MGI:1920933 Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit lymphopenia.
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Atg16l2位于小鼠的7号染色体，采用基因编辑技术，通过高通量电转受精卵方式，获得Atg16l2基因条件性敲除小鼠，性成熟后取精子冻存。
Atg16l2-flox小鼠模型是由赛业生物（Cyagen）采用基因编辑技术构建的条件性敲除小鼠。Atg16l2基因位于小鼠7号染色体上，由18个外显子组成，其中ATG起始密码子在1号外显子，TGA终止密码子在18号外显子。条件性敲除区域（cKO区域）位于3号外显子，包含103个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Atg16l2基因功能的丧失。Atg16l2-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白（RNP）和靶向载体共同注入受精卵。随后，对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外，携带敲除等位基因的小鼠表现出淋巴减少症。3号外显子覆盖了编码区域的5.51%。5'-loxP位点的插入需要2号内含子1003bp，3'-loxP位点的插入需要3号内含子1772bp。有效的cKO区域大小约为0.6kb。这种策略是基于现有数据库中的遗传信息设计的。由于生物过程的复杂性，所有关于loxP插入对基因转录、RNA剪接和蛋白质翻译的风险都无法在现有技术水平上预测。该模型可用于研究Atg16l2基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
ATG16L2，也称为Autophagy-related 16 like 2，是一种重要的自噬相关基因。自噬是一种细胞内降解和回收受损细胞器、大分子聚集体和长寿蛋白的过程，对于维持细胞稳态和功能至关重要。ATG16L2在自噬过程中发挥关键作用，参与自噬小体的形成和自噬通量的调控。
ATG16L2的基因多态性与多种疾病相关。例如，有研究表明，ATG16L2的rs11235604位点的单核苷酸多态性（SNP）与克罗恩病（CD）的发病风险相关。在中国汉族人群中，CD患者中TT基因型的比例显著高于健康对照组，T等位基因是CD的风险等位基因[1]。此外，ATG16L2的表达水平也与CD的发病相关，CD患者的ATG16L2 mRNA表达水平显著低于健康对照组[1]。
除了与CD相关外，ATG16L2还与其他疾病相关。例如，有研究表明，ATG16L2的rs10898880位点的SNP与非小细胞肺癌（NSCLC）患者的放射 pneumonitis（RP）和临床预后相关。NSCLC患者中，ATG16L2的rs10898880 CC基因型与更好的局部无复发生存率（LRFS）、无进展生存率（PFS）和总生存率（OS）相关，但与严重RP的发生风险增加相关[4]。此外，ATG16L2的表达水平也与胰腺癌的预后相关。有研究表明，ATG16L2的表达水平与胰腺癌患者的预后相关，ATG16L2的表达水平越高，患者的预后越差[3]。
ATG16L2在细胞内的表达和功能受到多种因素的调控。例如，NR3C1/Glucocorticoid受体激活可以促进胰腺β细胞在葡萄糖毒性条件下的过度自噬，导致胰岛素分泌受损和糖尿病的发生。研究发现，NR3C1激活可以上调RNA脱甲基酶FTO的表达，导致ATG16L2等自噬相关基因的mRNA上的m6A修饰减少，进而导致过度自噬[2]。此外，ATG16L2的表达还受到转录调控。例如，ATG16L2基因启动子区域的AUG序列与起始密码子的距离会影响ATG16L2的蛋白质表达水平。研究发现，当AUG序列靠近起始密码子时，ATG16L2的蛋白质表达水平会降低[5]。
综上所述，ATG16L2是一种重要的自噬相关基因，参与自噬通量的调控。ATG16L2的基因多态性和表达水平与多种疾病相关，包括CD、NSCLC和胰腺癌。ATG16L2的表达和功能受到多种因素的调控，包括基因多态性、转录调控和表观遗传调控。深入研究ATG16L2的生物学功能和疾病相关机制，有助于开发针对相关疾病的治疗策略。
参考文献：
1. Ma, T, Wu, S, Yan, W, Xie, R, Zhou, C. . A functional variant of ATG16L2 is associated with Crohn's disease in the Chinese population. In Colorectal disease : the official journal of the Association of Coloproctology of Great Britain and Ireland, 18, O420-O426. doi:10.1111/codi.13507. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27611316/
2. Wu, Tijun, Shao, Yixue, Li, Xirui, Chen, Fang, Han, Xiao. 2023. NR3C1/Glucocorticoid receptor activation promotes pancreatic β-cell autophagy overload in response to glucolipotoxicity. In Autophagy, 19, 2538-2557. doi:10.1080/15548627.2023.2200625. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37039556/
3. Zhou, Qing, Chen, Xi, Chen, Qiuyan, Liu, Haosheng, Hao, Lu. . A Four Autophagy-Related Gene-Based Prognostic Signature for Pancreatic Cancer. In Critical reviews in eukaryotic gene expression, 31, 89-100. doi:10.1615/CritRevEukaryotGeneExpr.2021038733. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34587439/
4. Wen, Juyi, Liu, Hongliang, Wang, Lili, Liao, Zhongxing, Wei, Qingyi. 2018. Potentially Functional Variants of ATG16L2 Predict Radiation Pneumonitis and Outcomes in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer after Definitive Radiotherapy. In Journal of thoracic oncology : official publication of the International Association for the Study of Lung Cancer, 13, 660-675. doi:10.1016/j.jtho.2018.01.028. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29454863/
5. Al-Ali, Ruslan, González-Sarmiento, Rogelio. 2016. Proximity of AUG sequences to initiation codon in genomic 5' UTR regulates mammalian protein expression. In Gene, 594, 268-271. doi:10.1016/j.gene.2016.08.052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27613142/
