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C57BL/6JCya-Rrp1bem1flox/Cya 条件性基因敲除小鼠
复苏/繁育服务
产品名称:
Rrp1b-flox
产品编号:
S-CKO-15478
品系背景:
C57BL/6JCya
小鼠资源库
* 使用本品系发表的文献需注明:Rrp1b-flox mice (Strain S-CKO-15478) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
基本信息
品系名称
C57BL/6JCya-Rrp1bem1flox/Cya
品系编号
CKOCMP-72462-Rrp1b-B6J-VA
产品编号
S-CKO-15478
基因名
Rrp1b
品系背景
C57BL/6JCya
基因别称
Kiaa0179;mKIAA0179;D030064A17;2600005C20Rik
NCBI号
修饰方式
条件性基因敲除
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
小鼠表型
质控标准
精子检测
① 冷冻前验证精子活力观察
② 冷冻验证每批次进行复苏验证
品系状态
活体
环境标准
SPF
供应地区
中国
品系详情
Rrp1b位于小鼠的17号染色体,采用基因编辑技术,通过高通量电转受精卵方式,获得Rrp1b基因条件性敲除小鼠,性成熟后取精子冻存。
Rrp1b-flox小鼠模型由赛业生物(Cyagen)构建,该模型采用基因编辑技术进行条件性基因敲除。Rrp1b基因位于小鼠17号染色体上,由16个外显子组成,其中ATG起始密码子在1号外显子,TGA终止密码子在16号外显子。条件性敲除区域(cKO区域)位于2号外显子,包含83个碱基对的编码序列。删除该区域会导致小鼠Rrp1b基因功能的丧失。Rrp1b-flox小鼠模型的构建过程包括将核糖核蛋白(RNP)和靶向载体共同注入受精卵。随后,对出生的小鼠进行PCR和测序分析进行基因型鉴定。此外,5'-loxP位点的插入位于第一个内含子,大小为9324 bp,而3'-loxP位点的插入位于第二个内含子,大小为1662 bp。有效的cKO区域大小约为1.8 kb。Rrp1b-flox小鼠模型可用于研究Rrp1b基因在小鼠体内的功能。
基因研究概述
Rrp1b,也称为ribosomal RNA processing 1 homolog B,是一种重要的基因。Rrp1b在多种癌症中发挥重要作用,包括乳腺癌、多发性骨髓瘤和胃癌。Rrp1b通过调节基因表达和染色质结构,影响肿瘤的生长、转移和预后。
Rrp1b在乳腺癌中是一种新的候选转移修饰基因。Rrp1b与Sipa1(一种已知的转移修饰基因)存在物理和功能上的相互作用,导致肿瘤生长和转移潜能的降低。此外,Rrp1b的表达可以调节多种与肿瘤抑制相关的转移预测细胞外基质(ECM)基因。研究发现,Rrp1b基因中的单核苷酸多态性(SNP)1307T>C与乳腺癌的发展和进展相关。携带T等位基因的个体患乳腺癌的风险增加了1.75倍。此外,Rrp1b基因中的T等位基因与肥胖、晚期疾病、肿瘤大小增加、淋巴结阳性状态和Her2阴性受体状态相关。Rrp1b基因中的T等位基因和TT基因型与乳腺癌的发展和进展相关[1]。
Rrp1b还与多发性骨髓瘤的预后相关。研究发现,Rrp1b的表达与多发性骨髓瘤患者的总生存期相关。Rrp1b表达水平较高的患者预后较差。此外,Rrp1b的表达与多种细胞外基质基因的表达相关,这些基因在肿瘤转移中发挥重要作用。因此,Rrp1b可能是一种新的多发性骨髓瘤易感基因[2]。
在胃癌中,Rrp1b的表达也与肿瘤转移相关。研究发现,Rrp1b的表达与胃癌患者的远端转移和肿瘤-淋巴结-转移(TNM)分期相关。Rrp1b表达水平较高的患者预后较差。此外,Rrp1b的表达与血浆中的表达水平相关,提示Rrp1b可能是一种潜在的胃癌诊断生物标志物[3]。
Rrp1b在调节基因表达和染色质结构方面发挥着重要作用。研究发现,Rrp1b与多种核小体结合因子相互作用,包括组蛋白H1X、多聚(ADP-核糖)聚合酶1、TRIM28和CSDA。此外,Rrp1b还与异染色质蛋白1α和乙酰化组蛋白H4赖氨酸5相互作用。这些发现表明,Rrp1b是一种潜在的转录和染色质结构的动态调节因子[4]。
Rrp1b还通过调节选择性mRNA剪接来影响基因表达。研究发现,Rrp1b与SRSF1(一种重要的剪接调节因子)相互作用,并调节选择性mRNA剪接。Rrp1b敲低细胞中,超过600个基因的剪接异构体表达发生显著改变。这些发现表明,Rrp1b通过调节选择性mRNA剪接来影响基因表达[5]。
Rrp1b还通过调节组蛋白甲基化来影响基因表达。研究发现,Rrp1b与TRIM28和CBX5/HP1α等异染色质相关蛋白共同占据基因位点,导致组蛋白H3赖氨酸9三甲基化(H3K9me3)水平升高,进而抑制基因表达。此外,Rrp1b过表达还导致组蛋白甲基化水平发生全局变化。这些发现表明,Rrp1b通过异染色质化和转录抑制来调节基因表达[6]。
综上所述,Rrp1b是一种重要的基因,在多种癌症中发挥重要作用。Rrp1b通过调节基因表达和染色质结构,影响肿瘤的生长、转移和预后。Rrp1b的研究有助于深入理解肿瘤发生和进展的机制,为肿瘤的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Nanchari, Santhoshi Rani, Cingeetham, Anuradha, Meka, Phannibhushann, Digumarthi, Raghunadha Rao, Satti, Vishnupriya. 2014. Rrp1B gene polymorphism (1307T>C) in metastatic progression of breast cancer. In Tumour biology : the journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine, 36, 615-21. doi:10.1007/s13277-014-2613-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25277657/
2. Crawford, Nigel P S, Qian, Xiaolan, Ziogas, Argyrios, Anton-Culver, Hoda, Hunter, Kent W. 2007. Rrp1b, a new candidate susceptibility gene for breast cancer progression and metastasis. In PLoS genetics, 3, e214. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18081427/
3. Sun, Cheng, Zhang, Wanqiu, Liu, Hao, Zhai, Zhimin, Hu, Wei. 2024. Identification of a novel lactylation-related gene signature predicts the prognosis of multiple myeloma and experiment verification. In Scientific reports, 14, 15142. doi:10.1038/s41598-024-65937-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38956267/
4. Lee, M, Dworkin, A M, Gildea, D, Moorhead, G B, Crawford, N P S. 2013. RRP1B is a metastasis modifier that regulates the expression of alternative mRNA isoforms through interactions with SRSF1. In Oncogene, 33, 1818-27. doi:10.1038/onc.2013.133. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23604122/
5. Salemi, Michele, Barone, Concetta, Romano, Corrado, Salluzzo, Maria Grazia, Bosco, Paolo. 2012. Gene expression profiling and qRT-PCR expression of RRP1B, PCNT, KIF21A and ADRB2 in leucocytes of Down's syndrome subjects. In Journal of genetics, 91, e18-23. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22552340/
6. Lu, Qin, Yu, Ting, Ou, Xilong, Xie, Ting, Chen, Xia. 2017. Potential lncRNA diagnostic biomarkers for early gastric cancer. In Molecular medicine reports, 16, 9545-9552. doi:10.3892/mmr.2017.7770. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29039538/
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