Rrp1b,也称为ribosomal RNA processing 1 homolog B,是一种重要的基因。Rrp1b在多种癌症中发挥重要作用,包括乳腺癌、多发性骨髓瘤和胃癌。Rrp1b通过调节基因表达和染色质结构,影响肿瘤的生长、转移和预后。
Rrp1b在乳腺癌中是一种新的候选转移修饰基因。Rrp1b与Sipa1(一种已知的转移修饰基因)存在物理和功能上的相互作用,导致肿瘤生长和转移潜能的降低。此外,Rrp1b的表达可以调节多种与肿瘤抑制相关的转移预测细胞外基质(ECM)基因。研究发现,Rrp1b基因中的单核苷酸多态性(SNP)1307T>C与乳腺癌的发展和进展相关。携带T等位基因的个体患乳腺癌的风险增加了1.75倍。此外,Rrp1b基因中的T等位基因与肥胖、晚期疾病、肿瘤大小增加、淋巴结阳性状态和Her2阴性受体状态相关。Rrp1b基因中的T等位基因和TT基因型与乳腺癌的发展和进展相关[1]。
Rrp1b还与多发性骨髓瘤的预后相关。研究发现,Rrp1b的表达与多发性骨髓瘤患者的总生存期相关。Rrp1b表达水平较高的患者预后较差。此外,Rrp1b的表达与多种细胞外基质基因的表达相关,这些基因在肿瘤转移中发挥重要作用。因此,Rrp1b可能是一种新的多发性骨髓瘤易感基因[2]。
在胃癌中,Rrp1b的表达也与肿瘤转移相关。研究发现,Rrp1b的表达与胃癌患者的远端转移和肿瘤-淋巴结-转移(TNM)分期相关。Rrp1b表达水平较高的患者预后较差。此外,Rrp1b的表达与血浆中的表达水平相关,提示Rrp1b可能是一种潜在的胃癌诊断生物标志物[3]。
Rrp1b在调节基因表达和染色质结构方面发挥着重要作用。研究发现,Rrp1b与多种核小体结合因子相互作用,包括组蛋白H1X、多聚(ADP-核糖)聚合酶1、TRIM28和CSDA。此外,Rrp1b还与异染色质蛋白1α和乙酰化组蛋白H4赖氨酸5相互作用。这些发现表明,Rrp1b是一种潜在的转录和染色质结构的动态调节因子[4]。
Rrp1b还通过调节选择性mRNA剪接来影响基因表达。研究发现,Rrp1b与SRSF1(一种重要的剪接调节因子)相互作用,并调节选择性mRNA剪接。Rrp1b敲低细胞中,超过600个基因的剪接异构体表达发生显著改变。这些发现表明,Rrp1b通过调节选择性mRNA剪接来影响基因表达[5]。
Rrp1b还通过调节组蛋白甲基化来影响基因表达。研究发现,Rrp1b与TRIM28和CBX5/HP1α等异染色质相关蛋白共同占据基因位点,导致组蛋白H3赖氨酸9三甲基化(H3K9me3)水平升高,进而抑制基因表达。此外,Rrp1b过表达还导致组蛋白甲基化水平发生全局变化。这些发现表明,Rrp1b通过异染色质化和转录抑制来调节基因表达[6]。
综上所述,Rrp1b是一种重要的基因,在多种癌症中发挥重要作用。Rrp1b通过调节基因表达和染色质结构,影响肿瘤的生长、转移和预后。Rrp1b的研究有助于深入理解肿瘤发生和进展的机制,为肿瘤的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献:
1. Nanchari, Santhoshi Rani, Cingeetham, Anuradha, Meka, Phannibhushann, Digumarthi, Raghunadha Rao, Satti, Vishnupriya. 2014. Rrp1B gene polymorphism (1307T>C) in metastatic progression of breast cancer. In Tumour biology : the journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine, 36, 615-21. doi:10.1007/s13277-014-2613-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25277657/
2. Crawford, Nigel P S, Qian, Xiaolan, Ziogas, Argyrios, Anton-Culver, Hoda, Hunter, Kent W. 2007. Rrp1b, a new candidate susceptibility gene for breast cancer progression and metastasis. In PLoS genetics, 3, e214. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18081427/
3. Sun, Cheng, Zhang, Wanqiu, Liu, Hao, Zhai, Zhimin, Hu, Wei. 2024. Identification of a novel lactylation-related gene signature predicts the prognosis of multiple myeloma and experiment verification. In Scientific reports, 14, 15142. doi:10.1038/s41598-024-65937-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38956267/
4. Lee, M, Dworkin, A M, Gildea, D, Moorhead, G B, Crawford, N P S. 2013. RRP1B is a metastasis modifier that regulates the expression of alternative mRNA isoforms through interactions with SRSF1. In Oncogene, 33, 1818-27. doi:10.1038/onc.2013.133. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23604122/
5. Salemi, Michele, Barone, Concetta, Romano, Corrado, Salluzzo, Maria Grazia, Bosco, Paolo. 2012. Gene expression profiling and qRT-PCR expression of RRP1B, PCNT, KIF21A and ADRB2 in leucocytes of Down's syndrome subjects. In Journal of genetics, 91, e18-23. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22552340/
6. Lu, Qin, Yu, Ting, Ou, Xilong, Xie, Ting, Chen, Xia. 2017. Potential lncRNA diagnostic biomarkers for early gastric cancer. In Molecular medicine reports, 16, 9545-9552. doi:10.3892/mmr.2017.7770. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29039538/