Taf11-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Taf11-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-14301

品系全称

C57BL/6JCya-Taf11em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-68776-Taf11-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Taf11-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-14301) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA-box binding protein associated factor 11
基因别称
1110038O14Rik,PRO214,TAF2I,TAFII28
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026836 | Ensembl: ENSMUST00000114848
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
TAF11,也称为TATA-box-binding protein-associated factor 11,是一种重要的TBP(TATA-box binding protein)相关因子,在真核生物的基因转录调控中发挥着关键作用。TAF11属于TAF家族,该家族是一组与转录因子TFIID(Transcription Factor IID)复合物相关的蛋白,TFIID是RNA聚合酶II转录起始的关键组成部分。TAF11具有保守的组蛋白折叠结构域,能够与TBP结合,并与其他TAFs一起形成TFIID复合物,从而在基因转录调控中发挥重要作用。

TAF11在基因转录调控中的作用主要体现在以下几个方面:

1. TAF11与TFIIA的相互作用:TFIIA是另一个转录因子,通过与TBP和TAF11的相互作用,参与TFIID复合物的形成。研究发现,TAF11与TFIIA的相互作用涉及两个不同的区域:高度保守的组蛋白折叠结构域和N端区域。细胞表达与TFIIA相互作用缺陷的TAF11突变体表现出条件生长表型,并存在转录缺陷。此外,TAF11还能改变TFIIA-DNA和TBP-DNA的接触,从而增强TFIIA-TBP-DNA复合物的形成和稳定[2]。

2. TAF11与TBP的相互作用:TAF11与TBP结合,形成TFIID复合物。研究发现,TAF11/TAF13与TBP竞争结合TATA-box DNA,并与之前被认为与TATA-box模拟相关的TAF1 N端结构域竞争结合。通过晶体结构、生物化学分析和交联质谱法(CLMS)数据,确定了TAF11/TAF13/TBP复合物的结构,揭示了TAF11/TAF13与TBP DNA结合表面的相互作用。此外,还发现TAF13中存在一个高度保守的C端TBP相互作用结构域(CTID),对于支持细胞生长至关重要[3]。

3. TAF11在RNA干扰(RNAi)中的作用:研究发现,TAF11在细胞质中与Dicer-2/R2D2复合物相互作用,并定位于D2体。通过遗传筛选,确定了TAF11为RNA干扰复合物(RISC)加载复合物(RLC)的缺失因子。TAF11四聚体促进Dicer-2-R2D2四聚化,从而增强siRNA结合和RISC加载活性。这些研究揭示了果蝇RLC的分子本质,阐明了TAF11在组织RLC组装以增强RNAi效率中的细胞质功能[1]。

4. TAF11在骨骼肌相关性状中的作用:研究发现,TAF11与骨骼肌相关性状有关。在猪基因组中,TAF11基因的功能性变异与生长率、肉品质和胴体性能的表型变异有关。此外,TAF11与其他TAFs和TBP形成TFIID复合物,参与调控基因表达和染色体结构,从而影响骨骼肌发育和性状[4]。

5. TAF11在病毒转录调控中的作用:研究发现,TAF11参与EB病毒(EBV)超增强子(ESE)的活性调控。TAF11与TAF家族其他成员(如TAF8和TAF3)和MEF2C协同作用,促进ESE的活性和MYC表达,从而影响EBV相关淋巴母细胞瘤的生长。这表明TAF11在病毒转录调控中发挥重要作用,可能成为EBV相关癌症治疗的新靶点[7]。

6. TAF11在X染色体宏卫星重复CT47的表观遗传调控中的作用:研究发现,TAF11-like宏卫星重复在人类基因组中表达,并且在某些情况下与疾病发生有关。例如,CT47基因位于Xq24,编码一种癌症/睾丸抗原,在正常情况下主要在睾丸中表达,但在某些类型的癌症中也有表达。研究发现,CT47的表达受到表观遗传调控的影响,包括DNA甲基化和组蛋白修饰。TAF11-like宏卫星重复在细胞分化和发育过程中表达,并受到表观遗传调控的严格控制,这表明TAF11-like宏卫星重复在维持基因组稳定性和正常生理功能中发挥重要作用[6]。

7. TAF11在神经功能和智力障碍中的作用:研究发现,TAF11与神经功能和智力障碍有关。在两个独立的近亲结婚家庭中,研究人员发现TAF11基因的两个同源突变(c.119T>A [p.Met40Lys]和c.92T>A [p.Leu31His])与轻度智力障碍和微头畸形有关。这些突变通过破坏TAF13与TAF11的相互作用而发挥致病作用。TAF13和TAF11形成组蛋白样异源二聚体,对于其招募进入TFIID复合物至关重要。研究发现,TAF11在神经元功能和智力发育中发挥重要作用[5]。

综上所述,TAF11作为一种重要的TBP相关因子,在基因转录调控、RNA干扰、病毒转录调控、骨骼肌发育和神经功能等方面发挥着重要作用。TAF11的变异和表达异常与多种疾病发生有关,包括智力障碍、微头畸形和癌症等。深入研究TAF11的生物学功能和调控机制,有助于揭示疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liang, Chunyang, Wang, Yibing, Murota, Yukiko, Siomi, Mikiko C, Liu, Qinghua. 2015. TAF11 Assembles the RISC Loading Complex to Enhance RNAi Efficiency. In Molecular cell, 59, 807-18. doi:10.1016/j.molcel.2015.07.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26257286/
2. Robinson, M M, Yatherajam, G, Ranallo, R T, Paule, M R, Stargell, L A. . Mapping and functional characterization of the TAF11 interaction with TFIIA. In Molecular and cellular biology, 25, 945-57. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15657423/
3. Gupta, Kapil, Watson, Aleksandra A, Baptista, Tiago, Tora, Làszlò, Berger, Imre. 2017. Architecture of TAF11/TAF13/TBP complex suggests novel regulation properties of general transcription factor TFIID. In eLife, 6, . doi:10.7554/eLife.30395. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29111974/
4. Li, Jingjin, Xiang, Yue, Zhang, Lu, Fu, Liangliang, Zhao, Shuhong. 2022. Enhancer-promoter interaction maps provide insights into skeletal muscle-related traits in pig genome. In BMC biology, 20, 136. doi:10.1186/s12915-022-01322-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35681201/
5. Tawamie, Hasan, Martianov, Igor, Wohlfahrt, Natalie, Colombo, Roberto, Abou Jamra, Rami. . Hypomorphic Pathogenic Variants in TAF13 Are Associated with Autosomal-Recessive Intellectual Disability and Microcephaly. In American journal of human genetics, 100, 555-561. doi:10.1016/j.ajhg.2017.01.032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28257693/
6. Tremblay, Deanna C, Alexander, Graham, Moseley, Shawn, Chadwick, Brian P. 2010. Expression, tandem repeat copy number variation and stability of four macrosatellite arrays in the human genome. In BMC genomics, 11, 632. doi:10.1186/1471-2164-11-632. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21078170/
7. Wang, Chong, Jiang, Sizun, Zhang, Luyao, Teng, Mingxiang, Zhao, Bo. 2019. TAF Family Proteins and MEF2C Are Essential for Epstein-Barr Virus Super-Enhancer Activity. In Journal of virology, 93, . doi:10.1128/JVI.00513-19. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31167905/