TPRG1L,全称为Tumor protein p63-regulated gene 1-like,是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。TPRG1L的表达与多种疾病相关,包括癌症、炎症和疼痛。近年来,随着生物信息学技术的不断发展,对TPRG1L的研究也逐渐深入。
在癌症领域,TPRG1L的表达与肿瘤的发生和发展密切相关。例如,在胆囊癌中,tRNA-derived fragments (tRFs) 是一类新发现的非编码RNA,通过多种分子机制调节肿瘤进展。研究发现,tRF-3013b在胆囊癌组织中显著下调,且其表达与患者总生存期相关。Dicer蛋白调节tRF-3013b的产生,其表达与tRF-3013b在胆囊癌组织中呈正相关。功能实验表明,tRF-3013b通过结合AGO3对TPRG1L发挥RNA沉默效应,进而抑制NF-κB信号通路,从而抑制胆囊癌细胞的增殖和诱导细胞周期停滞[1]。
此外,TERC是一种RNA成分,也是端粒酶的组成部分。然而,TERC也在大多数没有端粒酶活性的终末分化细胞中普遍表达。研究发现,TERC通过刺激NK-κB信号通路,以端粒酶非依赖性方式增强炎症细胞因子的表达和分泌。通过全基因组筛选,研究者发现14个基因受TERC转录调控,其中TPRG1L等四个基因被证实可以刺激NK-κB通路的激活。机制上,TERC通过与这些基因的启动子形成RNA-DNA三联体,从而增强它们的转录。在炎症相关疾病如2型糖尿病和多发性硬化症患者中,TERC及其靶基因(如TPRG1L)的表达水平上调[2]。
在人巨细胞病毒(HCMV)感染中,RNA1.2是HCMV表达的一种长链非编码RNA(lncRNA)。研究发现,RNA1.2通过阻断NF-κB激活,抑制炎症细胞因子IL-6的细胞外释放。与野生型病毒相比,缺乏RNA1.2基因的突变病毒感染的人成纤维细胞中,TPRG1L基因的表达上调。TPRG1L已知可以通过刺激NF-κB信号通路来上调IL-6的表达。RNA1.2突变病毒感染的成纤维细胞中,TPRG1L和IL-6的表达上调,这表明RNA1.2在HCMV感染期间操纵了内在的NF-κB依赖性细胞因子和趋化因子释放,从而影响下游免疫反应[3]。
在疼痛领域,TPRG1L的表达与抑郁症患者的疼痛特征相关。研究发现,与普通人群相比,抑郁症患者的疼痛具有更复杂的生物学机制。通过全基因组关联研究(GWAS)和蛋白质组关联研究(PWAS)以及转录组关联研究(TWAS),研究者发现TPRG1L是与抑郁症患者慢性疼痛相关的候选基因之一[4]。
综上所述,TPRG1L在多种生物学过程中发挥重要作用,包括癌症、炎症和疼痛。TPRG1L的表达与胆囊癌、炎症相关疾病和抑郁症患者的疼痛特征相关。TPRG1L可能成为治疗这些疾病的新靶点。
参考文献:
1. Zou, Lu, Yang, Yang, Zhou, Biyu, Bao, Runfa, Liu, Yingbin. 2022. tRF-3013b inhibits gallbladder cancer proliferation by targeting TPRG1L. In Cellular & molecular biology letters, 27, 99. doi:10.1186/s11658-022-00398-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36401185/
2. Liu, Haiying, Yang, Yiding, Ge, Yuanlong, Liu, Juanhong, Zhao, Yong. . TERC promotes cellular inflammatory response independent of telomerase. In Nucleic acids research, 47, 8084-8095. doi:10.1093/nar/gkz584. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31294790/
3. Lau, Betty, Kerr, Karen, Gu, Quan, Weekes, Michael P, Davison, Andrew J. 2020. Human Cytomegalovirus Long Non-coding RNA1.2 Suppresses Extracellular Release of the Pro-inflammatory Cytokine IL-6 by Blocking NF-κB Activation. In Frontiers in cellular and infection microbiology, 10, 361. doi:10.3389/fcimb.2020.00361. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32793512/
4. Zhang, Zhen, Liu, Li, Zhang, Huijie, Wen, Yan, Zhang, Feng. 2022. The genetic structure of pain in depression patients: A genome-wide association study and proteome-wide association study. In Journal of psychiatric research, 156, 547-556. doi:10.1016/j.jpsychires.2022.10.059. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36368244/