Zcrb1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Zcrb1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-13558

品系全称

C57BL/6JCya-Zcrb1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-67197-Zcrb1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Zcrb1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-13558) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1
基因别称
2700088M22Rik,Madp-1
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026025 | Ensembl: ENSMUST00000076070
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
ZCRB1,全称为锌指CCHC型和RNA结合基序1,是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接和稳定性,影响基因表达和生物学过程。ZCRB1基因位于12q12染色体上,编码一种核蛋白,由217个氨基酸残基组成。ZCRB1蛋白具有RNA结合基序和CCHC锌指基序,后者与核衣壳的核心核苷酸基序重叠。ZCRB1在从斑马鱼到人类的物种中保守,与冷诱导RNA结合蛋白具有同源性。ZCRB1基因表达受到多种因素的调控,例如 morphine、温度等[2]。

ZCRB1蛋白是U12型小核RNA(snRNA)次要剪接体的核心成分,参与U12型内含子的剪接。U12型内含子占人类内含子的0.5%,虽然数量较少,但对基因表达具有广泛的影响。研究表明,ZCRB1在细胞分化和发育过程中发挥重要作用,其表达异常与多种疾病的发生发展相关。

在细胞研究中,ZCRB1表达下调导致U12型基因的剪接和表达异常,进而影响细胞纤毛发生和WNT信号通路。在斑马鱼胚胎中,ZCRB1敲低导致发育异常、纤毛发生障碍和WNT信号通路激活,与人类细胞研究结果一致[1]。这表明ZCRB1在细胞和发育过程中发挥保守和关键作用,调节剪接、纤毛发生和WNT信号通路之间的复杂关系。

ZCRB1在多种癌症中表达异常,与患者预后相关。在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中,ZCRB1表达升高与患者预后不良相关,ZCRB1敲低导致HNSCC细胞存活率下降,肿瘤细胞增殖受到抑制[3]。在胶质母细胞瘤(GBM)中,ZCRB1和circHEATR5B表达下调,ZCRB1过表达促进circHEATR5B的形成,circHEATR5B编码的HEATR5B-881aa蛋白与JMJD5相互作用,降低其稳定性,进而影响GBM细胞的糖酵解和增殖[4]。此外,ZCRB1在肝细胞癌(HCC)中表达下调,其敲低导致HCC细胞增殖、侵袭、迁移和集落形成受到抑制[6]。

ZCRB1与病毒感染也有关联。研究发现,ZCRB1可以与冠状病毒RNA的5'-非翻译区(5'-UTR)相互作用,促进病毒复制和转录[7]。此外,ZCRB1基因表达受到SARS-CoV-2感染相关基因的调控,影响个体对病毒的易感性[5]。

综上所述,ZCRB1是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接和稳定性,影响基因表达和生物学过程。ZCRB1在细胞分化和发育过程中发挥重要作用,其表达异常与多种疾病的发生发展相关,包括癌症和病毒感染。深入研究ZCRB1的功能和调控机制,有助于揭示RNA剪接和稳定性在疾病发生发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Powell-Rodgers, Geralle, Pirzada, Mujeeb Ur Rehman, Richee, Jahmiera, Stratman, Amber N, Djuranovic, Sergej. 2024. Role of U11/U12 minor spliceosome gene ZCRB1 in Ciliogenesis and WNT Signaling. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.08.09.607392. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39149385/
2. Wang, Haoran, Gao, Mary X, Li, Linda, Hori, Naohiro, Sato, Kenzo. 2006. Isolation, expression, and characterization of the human ZCRB1 gene mapped to 12q12. In Genomics, 89, 59-69. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16959469/
3. Chen, Chaoqun, Huang, Fang, Li, Xiaojie, Qi, Yangfan, Wang, Yang. 2024. Identification of splicing factors signature predicting prognosis risk and the mechanistic roles of novel oncogenes in HNSCC. In Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease, 1870, 167115. doi:10.1016/j.bbadis.2024.167115. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38458543/
4. Song, Jian, Zheng, Jian, Liu, Xiaobai, Zhang, Mengyang, Liu, Yunhui. 2022. A novel protein encoded by ZCRB1-induced circHEATR5B suppresses aerobic glycolysis of GBM through phosphorylation of JMJD5. In Journal of experimental & clinical cancer research : CR, 41, 171. doi:10.1186/s13046-022-02374-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35538499/
5. Cotroneo, Chiara E, Mangano, Nunzia, Dragani, Tommaso A, Colombo, Francesca. 2021. Lung expression of genes putatively involved in SARS-CoV-2 infection is modulated in cis by germline variants. In European journal of human genetics : EJHG, 29, 1019-1026. doi:10.1038/s41431-021-00831-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33649539/
6. Ma, Yun-Long, Yang, Ya-Fei, Wang, Han-Chao, Wang, Dong-Xu, Li, Tao. 2023. A novel prognostic scoring model based on copper homeostasis and cuproptosis which indicates changes in tumor microenvironment and affects treatment response. In Frontiers in pharmacology, 14, 1101749. doi:10.3389/fphar.2023.1101749. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36909185/
7. Tan, Yong Wah, Hong, Wanjin, Liu, Ding Xiang. 2012. Binding of the 5'-untranslated region of coronavirus RNA to zinc finger CCHC-type and RNA-binding motif 1 enhances viral replication and transcription. In Nucleic acids research, 40, 5065-77. doi:10.1093/nar/gks165. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22362731/