Crnkl1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Crnkl1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-13356

品系全称

C57BL/6JCya-Crnkl1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-66877-Crnkl1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Crnkl1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-13356) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
crooked neck pre-mRNA splicing factor 1
基因别称
1200013P10Rik,5730590A01Rik,crn
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025820 | Ensembl: ENSMUST00000001818
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CRNKL1,也称为Crooked neck-like 1,是一个重要的基因,其编码的蛋白质是细胞剪接体的一部分,参与调控基因表达。CRNKL1基因位于人类染色体20上,具有至少15个外显子,编码一个主要包含687个氨基酸残基的蛋白质。该基因编码的蛋白质具有独特的特征,包括16个拷贝的四肽重复(TPR)基序,这在酵母、果蝇和人类Crooked neck同源蛋白中是保守的,对于细胞中剪接体的组装至关重要[6]。CRNKL1在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞周期进展、前mRNA剪接和基因表达调控。

研究表明,CRNKL1在多种人类疾病中发挥重要作用。例如,CRNKL1在食管腺癌(EAC)中具有预后价值。研究发现,CRNKL1可以显著地将EAC患者分为高风险和低风险组,并且其预测能力优于传统的预后生物标志物,如PTGS2、EGFR、ERBB2和TP53[1]。此外,CRNKL1还与HIV-1的转录后调控有关。研究显示,CRNKL1的耗竭可以增强细胞质中未剪接的HIV-1 RNA水平,从而影响HIV-1的复杂剪接模式[2]。此外,CRNKL1在环境相关的二噁英(TCDD)诱导的多细胞选择性剪接和转录调控中也发挥着重要作用[3]。

此外,CRNKL1还与绝经后骨质疏松症(PMO)的发生有关。研究发现,CRNKL1的表达在绝经后女性中增加,并且与骨密度相关。功能富集分析表明,脂肪酸代谢途径在表达CRNKL1水平较高的样本中显著丰富[4]。CRNKL1还与基底细胞癌(BCC)的发生有关。研究显示,BCC中存在CRNKL1的突变热点,这表明CRNKL1在BCC的发生中发挥着重要作用[5]。

此外,CRNKL1与乳腺癌的预后价值也有关。研究发现,CRNKL1的表达与乳腺癌患者的生存率呈正相关,表明CRNKL1可能是一个潜在的乳腺癌预后生物标志物[7]。综上所述,CRNKL1在多种人类疾病中发挥重要作用,包括食管腺癌、HIV-1感染、环境毒素诱导的基因表达调控、绝经后骨质疏松症、基底细胞癌和乳腺癌。CRNKL1的研究有助于深入理解基因表达调控的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Li, Zhen, Yao, Qianlan, Zhao, Songjian, Wang, Zhen, Li, Yixue. 2017. Protein coding gene CRNKL1 as a potential prognostic biomarker in esophageal adenocarcinoma. In Artificial intelligence in medicine, 76, 1-6. doi:10.1016/j.artmed.2017.01.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28363284/
2. Xiao, Han, Wyler, Emanuel, Milek, Miha, Ensser, Armin, Überla, Klaus. 2021. CRNKL1 Is a Highly Selective Regulator of Intron-Retaining HIV-1 and Cellular mRNAs. In mBio, 12, . doi:10.1128/mBio.02525-20. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33468685/
3. Zhao, Bilin, Deng, Jiewei, Ma, Mei, Li, Xinyan, Luan, Tiangang. 2024. Environmentally relevant concentrations of 2,3,7,8-TCDD induced inhibition of multicellular alternative splicing and transcriptional dysregulation. In The Science of the total environment, 919, 170892. doi:10.1016/j.scitotenv.2024.170892. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38346650/
4. Qian, Guo-Feng, Yuan, Lu-Shun, Chen, Min, Vijayan, Vijith, Xiao, Yu. 2019. PPWD1 is associated with the occurrence of postmenopausal osteoporosis as determined by weighted gene co‑expression network analysis. In Molecular medicine reports, 20, 3202-3214. doi:10.3892/mmr.2019.10570. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31432133/
5. Jayaraman, Shyam S, Rayhan, David J, Hazany, Salar, Kolodney, Michael S. 2013. Mutational landscape of basal cell carcinomas by whole-exome sequencing. In The Journal of investigative dermatology, 134, 213-220. doi:10.1038/jid.2013.276. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23774526/
6. Lai, C H, Chiu, J Y, Lin, W. . Identification of the human crooked neck gene by comparative gene identification. In Biochimica et biophysica acta, 1517, 449-54. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11342225/
7. Eini, Maryam, Parsi, Sepideh, Barati, Mahmood, Azarnezhad, Assad, Hosseini, Arshad. . Bioinformatic Investigation of Micro RNA-802 Target Genes, Protein Networks, and Its Potential Prognostic Value in Breast Cancer. In Avicenna journal of medical biotechnology, 14, 154-164. doi:10.18502/ajmb.v14i2.8882. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35633990/