Trim13-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Trim13-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-13180

品系全称

C57BL/6JCya-Trim13em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-66597-Trim13-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Trim13-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-13180) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tripartite motif-containing 13
基因别称
3110001L12Rik,CAR,LEU5,RNF77,Rfp2
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001164220 | Ensembl: ENSMUST00000165015
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1913847Mice homozygous for a knock-out allele exhibit decreased lethality induced by EMCV infection and altered type I IFN production.
TRIM13,也称为Tripartite Motif 13,是一种包含RING结构域的E3泛素连接酶,属于TRIM家族。TRIM蛋白是一类广泛存在的蛋白质,具有多种生物学功能,包括参与细胞生长、凋亡、转录调控和致癌过程等。TRIM13在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括免疫应答、细胞增殖和凋亡等。

TRIM13在乳腺癌的发生和发展中具有重要作用。研究发现,TRIM13在乳腺癌组织中的表达水平低于正常组织,且与乳腺癌患者的预后相关。TRIM13的表达水平与雌激素受体和孕激素受体状态呈正相关,而与乳腺癌的Scarff-Bloom-Richardson分级、Nottingham预后指数、淋巴结状态、基底样状态和三阴性状态呈负相关。TRIM13低表达与乳腺癌患者的无远处转移生存期、无复发生存期、疾病特异性生存期和转移复发无病生存期较差相关。此外,TRIM13与RAB11FIP2基因的表达呈正相关[1]。

TRIM13在动脉粥样硬化的发生和发展中也发挥着重要作用。研究发现,TRIM13在动脉粥样硬化斑块的形成和发展中具有促进作用。TRIM13通过泛素化降解肝X受体(LXR)α/β,下调其靶基因ABCA1/G1的表达,从而抑制胆固醇外流。此外,TRIM13通过泛素化降解细胞因子信号抑制因子1/3(SOCS1/3),介导信号转导和转录激活因子1(STAT1)的激活、CD36的表达和泡沫细胞的形成。敲除TRIM13基因可以挽救胆固醇外流和抑制泡沫细胞形成,从而保护小鼠免受饮食诱导的动脉粥样硬化。在狭窄的人类冠状动脉中,TRIM13和CD36的水平升高,而LXRα/β、ABCA1/G1和SOCS3的水平降低。TRIM13及其下游信号分子的表达水平与狭窄病变的严重程度相关。这些发现揭示了TRIM13在饮食诱导的动脉粥样硬化中的作用,并表明其可能是治疗这种血管病变的潜在药物靶点[2]。

TRIM13在慢性阻塞性肺病(COPD)的发生和发展中也发挥着重要作用。研究发现,TRIM13在COPD患者的肺组织中表达水平显著降低。TRIM13基因过表达可以降低COPD模型中内质网应激(ERS)相关分子的表达,降低内质网自噬水平,改善内质网结构,降低LC3-II/LC3-I和Beclin1的表达水平,并增加自噬抑制分子Bcl-2的表达水平。TRIM13基因敲低则导致相反的结果。TRIM13的表达通过抑制ERS诱导的内质网自噬来减轻COPD中的肺泡上皮细胞损伤[3]。

TRIM13在免疫应答中也发挥着重要作用。研究发现,TRIM13在免疫细胞中表达,并在骨 marrow-derived macrophages (BMDMs)受到I型干扰素(IFN)诱导时上调。TRIM13与黑色素瘤相关基因5(MDA5)相互作用,并负调控MDA5介导的I型IFN的产生。敲除TRIM13基因的小鼠在受到脑心肌炎病毒(EMCV)攻击时,产生更高水平的I型IFN,并存活时间更长。TRIM13敲除的小鼠胚胎成纤维细胞(MEFs)受到EMCV或poly(I · C)刺激时,β IFN(IFN-β)水平显著增加,但受到RIG-I检测到的Sendai病毒刺激时,IFN-β反应减弱,表明TRIM13可能在增强RIG-I活性方面发挥作用。这些结果表明,TRIM13通过抑制MDA5活性调节I型IFN反应,并在EMCV感染期间非冗余地调节MDA5活性[4]。

TRIM13还与STING信号通路相关。研究发现,TRIM13是一种跨膜内质网定位的E3泛素连接酶,对于抑制病原性DNA触发的炎症反应至关重要。TRIM13缺失增强了病原性DNA触发的炎症细胞因子产生,抑制了DNA病毒复制,并导致与年龄相关的自身炎症。机制上,TRIM13通过跨膜结构域(TM)与STING相互作用,催化STING的Lys6连接多聚泛素化,导致STING的ER输出减慢和ER启动的降解加速。STING缺失逆转了TRIM13敲除小鼠中增强的先天抗DNA病毒反应。这项研究确定了一种通过跨膜内质网相关TRIM13控制STING稳态的潜在策略,在病原性DNA触发的炎症反应中[5]。

TRIM13还参与调节NF-κB信号通路。研究发现,TRIM13是内质网(ER)膜锚定的E3连接酶,在调节NF-κB信号通路中发挥作用。TRIM13的表达抑制了TNF诱导的NF-κB激活,而敲低TRIM13则具有相反的效果。E3连接酶活性和ER定位对于NF-κB抑制至关重要,而TRIM13调节的自噬不是必需的。TRIM13与NEMO相互作用,并调节其泛素化和周转,从而可能调节IKK复合物活性。TRIM13介导的NF-κB抑制对于细胞克隆形成能力的负调节至关重要。这项研究首次证明了TRIM13作为内质网驻留的RING E3连接酶在调节NEMO泛素化、NF-κB信号通路负调节因子和肿瘤抑制因子的作用[6]。

TRIM13还通过K29连接多聚泛素化增强TRAF6的泛素化,从而促进NF-κB活性。研究发现,TRIM13在巨噬细胞受到TLR2配体刺激时上调。TRIM13的敲低减弱了TLR2介导的细胞因子/趋化因子产生和泡沫细胞形成,以及NF-κB的激活。TRIM13与肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)相互作用,并通过泛素化TRAF6增强NF-κB活性。过表达TRIM13的无活性突变体(C10/13A)或RING缺失突变体并不能增强TRAF6的泛素化或NF-κB的激活。这些结果表明,TRIM13的作用依赖于其E3连接酶活性。TRIM13使用K29连接的多聚泛素链对TRAF6进行泛素化,以促进NF-κB活性,从而增强TLR2介导的免疫反应[7]。

TRIM13在多发性骨髓瘤(MM)的发生和发展中也发挥着重要作用。研究发现,TRIM13在MM中的表达水平降低,与染色体13q14缺失和较差的临床预后相关。TRIM13下调减少了肿瘤细胞存活以及MM细胞的细胞周期进展和增殖。此外,还提供了TRIM13下调抑制NFκB通路和20S蛋白酶活性的证据。尽管这些数据不支持TRIM13作为肿瘤抑制基因的作用,但它们证实了TRIM13在MM肿瘤存活和增殖中的重要作用,突出了其作为治疗干预新靶点的潜力[8]。

TRIM13还与HCC进展相关。研究发现,circELMOD3在HCC组织中下调,并与HCC患者的临床病理特征相关。circELMOD3是区分HCC和健康对照的高度敏感和非侵入性生物标志物。功能实验表明,circELMOD3在体外和体内抑制HCC细胞的增殖并诱导凋亡。机制上,RNA反义纯化(RAP)和荧光素酶报告基因实验证实circELMOD3作为miR-6864-5p的海绵,导致其靶基因TRIM13的表达增加。有趣的是,RNA稳定性测试表明,circELMOD3过表达导致其直接结合的TRIM13 mRNA的稳定性增强,进而共激活p53信号通路[9]。

TRIM13在非小细胞肺癌(NSCLC)的发生和发展中也发挥着重要作用。研究发现,TRIM13在NSCLC组织中的表达水平低于正常组织。TRIM13的过表达抑制了NCI-H1975和SPC-A-1细胞的细胞增殖。此外,TRIM13的过表达增加了cleaved caspase-3的水平。TRIM13诱导的NSCLC细胞凋亡被caspase-3抑制剂Ac-DEVD-CHO减弱,表明TRIM13通过部分caspase-3依赖途径诱导细胞凋亡。此外,还发现TRIM13可以调节NF-κB活性。数据表明,TRIM13的过表达使NF-κB失活,如细胞质NF-κB增加和核NF-κB减少所示。暴露于NF-κB抑制剂PDTC显著阻止了TRIM13敲低对细胞增殖和凋亡的影响,表明TRIM13在NSCLC细胞中的作用是通过NF-κB通路介导的。最后,通过异种移植小鼠模型证明,TRIM13的过表达在体内抑制了肿瘤生长并诱导了细胞凋亡。这些结果表明,TRIM13作为NSCLC中的肿瘤抑制因子,通过调节NF-κB通路发挥作用。这些发现可能为NSCLC提供一个新的有希望的治疗靶点[10]。

综上所述,TRIM13在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括免疫应答、细胞增殖和凋亡等。TRIM13在多种疾病中具有潜在的治疗价值,包括乳腺癌、动脉粥样硬化、COPD、多发性骨髓瘤和NSCLC等。进一步的研究将有助于深入理解TRIM13的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Chen, Wei-Xian, Cheng, Lin, Xu, Ling-Yun, Qian, Qi, Zhu, Yu-Lan. 2019. Bioinformatics analysis of prognostic value of TRIM13 gene in breast cancer. In Bioscience reports, 39, . doi:10.1042/BSR20190285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30837324/
2. Govatati, Suresh, Kumar, Raj, Boro, Monoranjan, Lusis, Aldons J, Rao, Gadiparthi N. 2024. TRIM13 reduces cholesterol efflux and increases oxidized LDL uptake leading to foam cell formation and atherosclerosis. In The Journal of biological chemistry, 300, 107224. doi:10.1016/j.jbc.2024.107224. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38537695/
3. Xiang, Yaling, Li, Chuntao, Wang, Zhiyuan, Zhou, Jinbiao, Zhang, Jianqing. 2024. TRIM13 Reduces Damage to Alveolar Epithelial Cells in COPD by Inhibiting Endoplasmic Reticulum Stress-Induced ER-Phagy. In Lung, 202, 821-830. doi:10.1007/s00408-024-00753-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39382594/
4. Narayan, Kavitha, Waggoner, Lisa, Pham, Serena T, Fitzgerald, Katherine A, Kang, Joonsoo. 2014. TRIM13 is a negative regulator of MDA5-mediated type I interferon production. In Journal of virology, 88, 10748-57. doi:10.1128/JVI.02593-13. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25008915/
5. Li, Xuelian, Yu, Zhou, Fang, Qian, Wang, Jianli, Chen, Taoyong. 2022. The transmembrane endoplasmic reticulum-associated E3 ubiquitin ligase TRIM13 restrains the pathogenic-DNA-triggered inflammatory response. In Science advances, 8, eabh0496. doi:10.1126/sciadv.abh0496. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35080984/
6. Tomar, Dhanendra, Singh, Rajesh. 2014. TRIM13 regulates ubiquitination and turnover of NEMO to suppress TNF induced NF-κB activation. In Cellular signalling, 26, 2606-13. doi:10.1016/j.cellsig.2014.08.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25152375/
7. Huang, Bin, Baek, Suk-Hwan. 2017. Trim13 Potentiates Toll-Like Receptor 2-Mediated Nuclear Factor κB Activation via K29-Linked Polyubiquitination of Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 6. In Molecular pharmacology, 91, 307-316. doi:10.1124/mol.116.106716. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28087809/
8. Gatt, Moshe E, Takada, Kohichi, Mani, Mala, Anderson, Kenneth C, Carrasco, Daniel R. 2013. TRIM13 (RFP2) downregulation decreases tumour cell growth in multiple myeloma through inhibition of NF Kappa B pathway and proteasome activity. In British journal of haematology, 162, 210-20. doi:10.1111/bjh.12365. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23647456/
9. Lai, Mingshuang, Liu, Meiliang, Li, Deyuan, Nan, Aruo, Zeng, Xiaoyun. 2023. circELMOD3 increases and stabilizes TRIM13 by sponging miR-6864-5p and direct binding to inhibit HCC progression. In iScience, 26, 107818. doi:10.1016/j.isci.2023.107818. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37752955/
10. Xu, Ling, Wu, Qi, Zhou, Xifa, Wu, Qiyong, Fang, Mingming. 2019. TRIM13 inhibited cell proliferation and induced cell apoptosis by regulating NF-κB pathway in non-small-cell lung carcinoma cells. In Gene, 715, 144015. doi:10.1016/j.gene.2019.144015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31357025/