Arfgap3-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Arfgap3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-12970

品系全称

C57BL/6JCya-Arfgap3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-66251-Arfgap3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Arfgap3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-12970) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ARF GTPase activating protein 3
基因别称
0610009H19Rik,1810004P07Rik,1810035F16Rik,9130416J18Rik,Arfgap1
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025445 | Ensembl: ENSMUST00000067215
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Arfgap3(ADP核糖基化因子GTP酶激活蛋白3)是一种与高尔基体相关联的GTP酶激活蛋白,参与调节囊泡运输途径。Arfgap3在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、迁移、葡萄糖摄取和蛋白质运输等。本文将结合参考文献,对Arfgap3的功能和作用进行综述。

Arfgap3在前列腺癌细胞生物学中发挥重要作用。研究表明,Arfgap3的表达受雄激素调节,并在雄激素敏感的LNCaP细胞中促进细胞增殖和迁移。Arfgap3与黏着斑蛋白相互作用,而黏着斑蛋白是细胞迁移和移动的重要蛋白。通过siRNA介导的Arfgap3敲低,发现Arfgap3的缺失显著降低了LNCaP细胞的生长。同时,Arfgap3与paxillin的表达协同促进雄激素受体依赖的PSA增强子的转录激活,提示Arfgap3与paxillin共同促进前列腺癌细胞的增殖和迁移[1]。

Arfgap3还参与肌肉损伤修复和肌细胞分化过程。在骨骼肌损伤修复过程中,Arfgap3的表达上调,并与COPI相关基因表达呈正相关。在C2C12肌母细胞中,Arfgap3与COPA、COPB、COPG蛋白和GLUT4共定位。Arfgap3表达下调导致细胞内囊泡运输和葡萄糖摄取受阻,肌母细胞在低葡萄糖培养条件下的增殖受损,凋亡比例增加,肌管分化受损。这表明Arfgap3通过调节COPI相关囊泡和GLUT4储存囊泡的运输,影响肌母细胞的增殖和分化,从而调节骨骼肌损伤后的修复过程[2]。

Arfgap3还参与后高尔基体区室中阳离子不依赖的甘露糖-6-磷酸受体(CIMPR)的运输。Arfgap3定位于反高尔基网络和早期内体。Arfgap3的表达下调导致CIMPR在细胞周缘定位,并且这种效应特异性地依赖于Arfgap3的GAP活性。Arfgap3的表达下调还导致组织蛋白酶D成熟减慢,分泌加速,以及内源性CIMPR从内体到反高尔基网络的逆向运输受损。此外,Arfgap3表达下调还导致表皮生长因子受体(EGFR)从早期内体中的出胞和EGF刺激后的降解减慢。Arfgap3与高尔基定位的、γ-耳结构域含有的、ADP核糖基化因子结合蛋白(GGAs)相关联,Arfgap3敲低减少GGAs的膜结合。这表明Arfgap3可能通过调节从早期内体到晚期内体的运输,影响后高尔基体区室中的蛋白质运输[3]。

Arfgap3还参与整合素αvβ6的内部化和运输。整合素αvβ6在大多数正常健康组织中表达水平较低,但在癌症和纤维化等疾病背景下表达上调。整合素αvβ6的内部化和运输对其表面表达和功能调节至关重要。通过siRNA筛选,发现Arfgap3等15个基因在dynamin依赖途径中显著降低了αvβ6的内部化。抑制dynamin依赖途径显著降低了αvβ6依赖的迁移。αvβ6与内体标记共定位研究表明,在配体结合后6小时,αvβ6仍然存在于Rab11阳性的内体中,并且在A20FMDV2暴露后48小时内没有降解的证据。此外,60%的配体结合的αvβ6在6小时内被循环回表面。这表明Arfgap3在αvβ6的内部化和运输中发挥重要作用,对于癌症和纤维化等疾病中αvβ6靶向治疗具有重要意义[4]。

Arfgap3与多种ArfGAPs协同参与COPI介导的运输。ArfGAP1是ARFs的GTP酶激活蛋白的原型,被认为参与从高尔基体到内质网的逆向运输,通过调节COPI包裹的囊泡的脱壳。然而,ArfGAP1的RNA干扰导致的COPI定位和高尔基体到内质网的逆向运输没有明显的表型改变。因此,研究者还考察了ArfGAP1的紧密相关同源物ArfGAP2和ArfGAP3。ArfGAP1、ArfGAP2和ArfGAP3同时敲低导致GTP结合的ARF水平升高。同时,这些细胞中在顺高尔基体中驻留或循环的蛋白质,包括ERGIC-53、beta-COP和GM130,在ER-高尔基中间区室中积累,高尔基体到内质网的逆向运输受阻。ArfGAP敲低细胞中观察到的表型与beta-COP耗竭细胞中观察到的表型相似。ArfGAP耗竭细胞和beta-COP耗竭细胞都积累了特征性的空泡结构,在电子显微镜下可见。此外,COPI在ArfGAP耗竭细胞的空泡结构边缘聚集。这些观察结果表明,ArfGAP1、ArfGAP2和ArfGAP3在调节COPI功能和高尔基体到内质网的逆向运输中具有重叠的作用[5]。

Arfgap3与家畜生产性状相关。全基因组关联分析发现,Arfgap3与Nellore牛的胴体性状相关。Arfgap3与胴体性状相关的其他基因包括CLSTN2、DPYD、OSBPL3、SUDS3、RARRES1和VEPH1。这些基因涉及脂质代谢、蛋白质翻译后修饰和信号转导等生物学过程[6]。此外,Arfgap3在丹麦泽西牛的产奶性状中也发挥了重要作用。全基因组关联分析发现,Arfgap3与产奶指数、脂肪指数和蛋白质指数相关。这些QTL可能与DGAT1、酪蛋白、ARFGAP3、CYP11B1和CDC样激酶4等基因的遗传变异有关[7]。

Arfgap3在家畜的选育过程中受到正选择。通过Tajima's D、XP-CLR和XP-EHH种群统计方法,发现Holstein、Hanwoo和N'Dama牛品种中存在选择信号。在Holstein、Hanwoo和N'Dama牛品种中,分别发现了441、512和461个受到选择的基因。在这些基因中,ARFGAP3、SNORA70和其他RNA基因在三个品种中均存在。这些基因的显著功能注释聚类术语包括牛奶蛋白和甲状腺激素信号通路(Holstein)、组蛋白乙酰转移酶活性(Hanwoo)和肾素分泌(N'Dama)。这表明Arfgap3在家畜的选育过程中受到正选择,可能与牛奶生产、肌肉生长和脂肪沉积等性状相关[8]。

综上所述,Arfgap3是一种重要的GTP酶激活蛋白,参与调节囊泡运输途径。Arfgap3在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、迁移、葡萄糖摄取、蛋白质运输和家畜生产性状等。Arfgap3的研究有助于深入理解囊泡运输的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略,并为家畜的选育提供理论依据。

参考文献:
1. Obinata, Daisuke, Takayama, Ken-ichi, Urano, Tomohiko, Takahashi, Satoru, Inoue, Satoshi. 2011. ARFGAP3, an androgen target gene, promotes prostate cancer cell proliferation and migration. In International journal of cancer, 130, 2240-8. doi:10.1002/ijc.26224. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21647875/
2. Li, Suting, Wang, Zhi, Chen, Mao, Tang, Jianming, Hong, Li. 2022. ArfGAP3 regulates vesicle transport and glucose uptake in myoblasts. In Cellular signalling, 103, 110551. doi:10.1016/j.cellsig.2022.110551. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36476390/
3. Shiba, Yoko, Kametaka, Satoshi, Waguri, Satoshi, Presley, John F, Randazzo, Paul Agostino. 2013. ArfGAP3 regulates the transport of cation-independent mannose 6-phosphate receptor in the post-Golgi compartment. In Current biology : CB, 23, 1945-51. doi:10.1016/j.cub.2013.07.087. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24076238/
4. Meecham, Amelia, Cutmore, Lauren C, Protopapa, Pantelitsa, Rigby, Lauren G, Marshall, John F. 2022. Ligand-bound integrin αvβ6 internalisation and trafficking. In Frontiers in cell and developmental biology, 10, 920303. doi:10.3389/fcell.2022.920303. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36092709/
5. Saitoh, Akina, Shin, Hye-Won, Yamada, Akane, Waguri, Satoshi, Nakayama, Kazuhisa. 2009. Three homologous ArfGAPs participate in coat protein I-mediated transport. In The Journal of biological chemistry, 284, 13948-13957. doi:10.1074/jbc.M900749200. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19299515/
6. Santana, M H A, Ventura, R V, Utsunomiya, Y T, Leme, P R, Ferraz, J B S. 2015. A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. In Journal of animal breeding and genetics = Zeitschrift fur Tierzuchtung und Zuchtungsbiologie, 132, 420-7. doi:10.1111/jbg.12167. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26016521/
7. Wakeham, D E, Ybe, J A, Brodsky, F M, Hwang, P K. . Molecular structures of proteins involved in vesicle coat formation. In Traffic (Copenhagen, Denmark), 1, 393-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11208125/
8. Liu, Xin, Wang, Xiaohui, Xu, Tingna, Liu, Xia, Li, Lingge. 2023. Effects of Different Delivery Modes on the Expression of Vesicle Transport-Related Genes in Female Pelvic Floor Muscle Repair After Injury. In Applied biochemistry and biotechnology, 196, 667-678. doi:10.1007/s12010-023-04510-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37171760/