Ykt6-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ykt6-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-12083

品系全称

C57BL/6JCya-Ykt6em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-56418-Ykt6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ykt6-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-12083) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
YKT6 v-SNARE homolog (S. cerevisiae)
基因别称
0610042I15Rik,1810013M05Rik
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019661 | Ensembl: ENSMUST00000002818
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~4.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1927550Mice homozygous for a knock-out allele show complete embryonic lethality prior to organogenesis. In vitro, blastocysts fail to hatch from the zona pellucida and die after 3 days in culture.
Ykt6,也称为SNARE蛋白,是一种重要的膜融合蛋白,参与多种细胞内囊泡转运过程。SNARE蛋白是一类保守的蛋白质,主要分为三种类型:v-SNARE、t-SNARE和R-SNARE。Ykt6属于R-SNARE,它与v-SNARE和t-SNARE共同形成SNARE复合物,在膜融合过程中发挥关键作用。Ykt6的膜锚定功能是通过其构象转变从闭合状态到开放状态实现的。这种构象转变可以受到C端脂化和SNARE核心的磷酸化的调节。尽管Ykt6在不同物种中具有许多共同属性,但它在酵母、哺乳动物和蠕虫等不同物种中的细胞定位和功能行为却有所不同。Ykt6的这种结构-功能关系在不同物种中的差异,目前仍不清楚[4]。

Ykt6在肿瘤发生和进展中发挥着重要作用。在多种肿瘤中,Ykt6的表达显著上调,并且与不良预后相关。例如,在肺癌中,Ykt6的表达与临床特征、吸烟、淋巴结转移和TP53突变相关,并且与不良预后相关。此外,Ykt6还与细胞增殖、迁移和侵袭有关,抑制Ykt6的表达可以抑制细胞增殖和促进细胞凋亡,并降低细胞迁移和侵袭的能力。此外,Ykt6相关的基因主要涉及细胞周期。Ykt6表达升高与LUAD患者的不良预后相关,Ykt6可以作为LUAD诊断和预后的新型生物标志物[2]。

在肝癌中,Ykt6的高表达率高于邻近组织,并且与肿瘤大小、Edmondson分级、转移、微血管侵袭和AFP水平相关。Kaplan-Meier生存分析显示,Ykt6表达水平高的HCC患者预后较差。多因素Cox回归分析显示,Edmondson分级、转移和Ykt6表达是HCC不良预后的独立危险因素。因此,Ykt6的高表达与HCC的进展密切相关,可能作为HCC不良预后的潜在生物标志物[3]。

在口腔鳞状细胞癌中,Ykt6的过表达与不良预后相关。Ykt6的表达与细胞侵袭、转移和CD8+ T细胞浸润有关。此外,Ykt6的表达与肿瘤微环境和免疫浸润相关。Ykt6的过表达与CD8+ T细胞水平的降低和免疫治疗的潜在反应相关。因此,Ykt6是口腔鳞状细胞癌预后和免疫治疗的潜在候选生物标志物[5]。

Ykt6还参与肿瘤微环境的调节。肿瘤衍生的外泌体(TDEs)可以极化巨噬细胞向免疫抑制表型转变,其特征是PD-L1表达增加,并通过NF-κB依赖性、糖酵解优势的代谢重编程。TDEs通过TLR2和NF-κB信号通路导致葡萄糖摄取增加,并刺激NOS2升高,抑制线粒体氧化磷酸化,导致丙酮酸转化为乳酸增加。乳酸反馈到NF-κB,进一步增加PD-L1的表达。在非小细胞肺癌患者的无转移淋巴结中,巨噬细胞PD-L1与原发性肿瘤中GLUT-1和囊泡释放基因YKT6的水平呈正相关。因此,Ykt6在肿瘤微环境中发挥重要作用,参与调节免疫抑制表型的形成[1]。

Ykt6的表达和功能还受到表观遗传调控。例如,miR-134和miR-135b可以靶向Ykt6,抑制Ykt6的表达,从而降低外泌体的释放。此外,Ykt6的表达还受到基因突变、甲基化和拷贝数改变的影响。这些表观遗传调控机制可能影响Ykt6在肿瘤发生和进展中的作用[6]。

综上所述,Ykt6是一种重要的SNARE蛋白,参与多种细胞内囊泡转运过程。Ykt6在肿瘤发生和进展中发挥着重要作用,其表达与多种肿瘤的不良预后相关。Ykt6还参与肿瘤微环境的调节,影响免疫抑制表型的形成。此外,Ykt6的表达和功能受到表观遗传调控。因此,Ykt6是一个具有潜在临床应用价值的生物标志物和治疗靶点。

参考文献:
1. Morrissey, Samantha M, Zhang, Fan, Ding, Chuanlin, Huang, Jian, Yan, Jun. 2021. Tumor-derived exosomes drive immunosuppressive macrophages in a pre-metastatic niche through glycolytic dominant metabolic reprogramming. In Cell metabolism, 33, 2040-2058.e10. doi:10.1016/j.cmet.2021.09.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34559989/
2. Zhang, Liming, Wang, Shaoqiang, Wang, Lina. 2024. Comprehensive analysis identifies YKT6 as a potential prognostic and diagnostic biomarker in lung adenocarcinoma. In BMC cancer, 24, 1235. doi:10.1186/s12885-024-12975-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39375639/
3. Xu, Jia-Ze, Jiang, Jun-Jie, Xu, Hao-Jie, Liu, Zheng-Chuang, Hu, Zhi-Ming. 2021. High expression of YKT6 associated with progression and poor prognosis of hepatocellular carcinoma. In Scandinavian journal of gastroenterology, 56, 1349-1354. doi:10.1080/00365521.2021.1961305. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34396876/
4. Ji, Jie, Yu, Yiping, Wu, Shaowen, Weng, Jingwei, Wang, Wenning. 2023. Different conformational dynamics of SNARE protein Ykt6 among yeast and mammals. In The Journal of biological chemistry, 299, 104968. doi:10.1016/j.jbc.2023.104968. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37380075/
5. Yang, Zongcheng, Yan, Guangxing, Zheng, Lixin, Fu, Yue, Xu, Xin. 2021. YKT6, as a potential predictor of prognosis and immunotherapy response for oral squamous cell carcinoma, is related to cell invasion, metastasis, and CD8+ T cell infiltration. In Oncoimmunology, 10, 1938890. doi:10.1080/2162402X.2021.1938890. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34221701/
6. Liu, Jiamin, Zhang, Qiang, He, Ling, Wang, Yixuan, Xie, Ping. 2025. Pan-Cancer Analysis Identifies YKT6 as a Prognostic and Immunotherapy Biomarker, with an Emphasis on Cervical Cancer. In OncoTargets and therapy, 18, 107-127. doi:10.2147/OTT.S491310. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39867862/