Patz1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Patz1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11986

品系全称

C57BL/6JCya-Patz1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-56218-Patz1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Patz1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11986) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
POZ (BTB) and AT hook containing zinc finger 1
基因别称
8430401L15Rik,Mazr,Patz,Zfp278
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019574.3 | Ensembl: ENSMUST00000057089
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1531 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1891832Mice homozygous for a null allele exhibit some embryonic and fetal lethality, exencephaly, nervous system defects, outflow defects, transposition of great arteries, postnatal growth retardation and male and female infertility.
Patz1基因,也称为POZ/BTB和AT-钩锌指蛋白1,是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的转录因子。Patz1蛋白属于BTB-ZF(broad-complex, tramtrack and bric-à-brac -zinc finger)家族,其含有POZ/BTB结构域和AT-钩结构域,能够直接调节Pou5f1和Nanog的表达,并通过抑制神经分化来维持干细胞的特性。Patz1在神经发生、生殖细胞发育、脂肪生成等过程中发挥着关键作用。

在神经系统中,Patz1融合基因与某些神经上皮肿瘤的发生发展密切相关。研究发现,Patz1融合基因主要出现在儿童和青少年的神经上皮肿瘤中,包括室管膜瘤、胶质母细胞瘤、胶质神经元肿瘤等。这些肿瘤的原始组织学诊断涵盖了广泛的肿瘤类型和恶性程度。尽管Patz1融合肿瘤最常见的是胶质母细胞瘤,但其临床数据显示,与典型的胶质母细胞瘤相比,其预后更好,尽管有频繁的复发。RNA测序揭示了与染色体22上的拷贝数变异相关的MN1:PATZ1或EWSR1:PATZ1融合基因的重复出现,其中Patz1和两个融合伙伴位于染色体22上。这些融合基因以前仅在少数神经胶质/神经胶质瘤和颅外肉瘤中被报道过。研究表明,它们比以前认为的更常见,共同定义了一种具有高表达神经发育标记如PAX2、GATA2和IGF2的生物独特的中枢神经系统肿瘤类型。对含有MN1:PATZ1融合的KS-1脑肿瘤细胞系进行的药物筛选揭示了初步的研究候选药物[1]。

Patz1融合基因不仅在神经系统中发挥作用,还与某些软组织肉瘤的发生有关。研究发现,EWSR1-PATZ1基因融合可能在定义一种新的胶质神经元肿瘤类型方面发挥作用,与胶质神经元瘤不同。研究人员对一例室管囊肿性胶质神经元瘤进行了RNA测序,发现了EWSR1-PATZ1融合转录本。通过RT-PCR和Sanger测序证实了EWSR1-PATZ1融合。Patz1蛋白属于BTB-ZF家族,直接调节Pou5f1和Nanog的表达,并通过抑制神经分化来维持干细胞的特性。EWSR1-PATZ1融合在肿瘤中是一种罕见的事件,仅在六例圆形细胞肉瘤和三例胶质瘤中被报道过。在研究中,研究人员使用EWSR1断裂分离探针对四十例BRAFV600E阴性胶质神经元瘤进行了FISH检测。对索引病例和十例FISH阳性病例中的七例进行了甲基化分析。索引病例与其他儿童低度胶质神经元实体分离,特别是与明确的胶质神经元瘤甲基化组分离。另外一例儿童室管内胶质神经元瘤与胶质神经元瘤组略有更紧密的相关性,但与主要胶质神经元瘤组有所不同,与索引病例相似。这两个病例都携带Patz1位点的拷贝数变异。EWSR1-PATZ1基因融合可能定义了一种新的胶质神经元瘤类型,与胶质神经元瘤不同[2]。

除了在神经系统和软组织肉瘤中的作用,Patz1还与生殖细胞发育有关。研究发现,Patz1基因在精子发生和睾丸肿瘤中起着关键作用。通过基因敲除小鼠模型,研究人员发现Patz1基因缺失导致雄性小鼠不育,提示该基因在精子发生中的重要作用。此外,Patz1基因在睾丸生殖细胞肿瘤中的表达也发生了改变,表明其在睾丸肿瘤发生发展中的作用。Patz1基因在正常男性配子发生中起着重要作用,其上调和错位可能与睾丸生殖细胞肿瘤的发生发展相关[3]。

除了在神经系统和生殖系统中的作用,Patz1还在脂肪生成中发挥重要作用。研究发现,Patz1作为转录因子,通过控制脂肪生成因子的启动子调控位点,促进脂肪生成。Patz1在人和小鼠的脂肪前体细胞和脂肪细胞中表达。在细胞模型中,Patz1通过蛋白质-蛋白质相互作用和DNA结合促进脂肪生成。Patz1在脂肪细胞和脂肪前体细胞中的敲除导致脂肪前体细胞池减少、脂肪量减少和脂肪细胞肥大。ChIP-Seq和RNA-seq分析表明,Patz1通过在关键早期脂肪生成因子的启动子区域与转录机制相互作用来支持脂肪生成。质谱结果显示,Patz1与GTF2I相关,GTF2I调节Patz1在分化过程中的功能。这些发现强调了Patz1在脂肪细胞分化和脂肪生成中的调控作用,为脂肪组织发育提供了见解[4]。

综上所述,Patz1基因是一种重要的转录因子,参与调控神经发生、生殖细胞发育、脂肪生成等生物学过程。Patz1融合基因与某些神经上皮肿瘤和软组织肉瘤的发生发展密切相关,并可能成为新的诊断和治疗靶点。此外,Patz1还在脂肪生成中发挥重要作用,为肥胖和代谢疾病的治疗提供了新的思路。对Patz1基因的深入研究有助于我们更好地理解其生物学功能和在疾病发生发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的策略。

参考文献:
1. Alhalabi, Karam T, Stichel, Damian, Sievers, Philipp, Sahm, Felix, Jones, David T W. 2021. PATZ1 fusions define a novel molecularly distinct neuroepithelial tumor entity with a broad histological spectrum. In Acta neuropathologica, 142, 841-857. doi:10.1007/s00401-021-02354-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34417833/
2. Siegfried, Aurore, Rousseau, Audrey, Maurage, Claude-Alain, Figarella-Branger, Dominique, Uro-Coste, Emmanuelle. 2018. EWSR1-PATZ1 gene fusion may define a new glioneuronal tumor entity. In Brain pathology (Zurich, Switzerland), 29, 53-62. doi:10.1111/bpa.12619. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29679497/
3. Fedele, M, Franco, R, Salvatore, G, Fusco, A, Chieffi, P. . PATZ1 gene has a critical role in the spermatogenesis and testicular tumours. In The Journal of pathology, 215, 39-47. doi:10.1002/path.2323. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18241078/
4. Patel, Sanil, Ganbold, Khatanzul, Cho, Chung Hwan, Tontonoz, Peter, Rajbhandari, Prashant. 2024. Transcription factor PATZ1 promotes adipogenesis by controlling promoter regulatory loci of adipogenic factors. In Nature communications, 15, 8533. doi:10.1038/s41467-024-52917-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39358382/