Ddx21-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddx21-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11975

品系全称

C57BL/6NCya-Ddx21em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6NCya

品系编号

CKOCMP-56200-Ddx21-B6N-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx21-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11975) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DExD box helicase 21
基因别称
D10Ertd645e,D10Wsu42e
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019553 | Ensembl: ENSMUST00000045866
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~3.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1860494Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit embryonic lethality. Mice homozygous for a knock-out allele show embryonic growth retardation and complete embryonic lethality prior to organogenesis, with morula-like embryos failing to hatch from the zona pellucida and to form in vitro outgrowths.
DDX21,也称为DEAD-box RNA解旋酶21,是DEAD-box RNA解旋酶家族中的一种。DEAD-box RNA解旋酶家族是一类广泛存在于生物体内的RNA解旋酶,它们在RNA代谢的多个环节中发挥重要作用,包括RNA的加工、转运、翻译和降解。DDX21作为一种RNA解旋酶,其主要功能包括促进DNA损伤修复、维持基因组稳定性、调节转录和RNA代谢等。

在基因组稳定性方面,DDX21通过促进DNA损伤修复和解决R-loop来发挥作用。在转录调节方面,DDX21可以与启动子区域直接结合,与转录因子相互作用,并通过非编码RNA增强转录。此外,DDX21还参与RNA代谢的各个方面,如RNA加工、翻译和降解。有趣的是,DDX21的活性和功能受到翻译后修饰的调控,这会影响DDX21的定位和降解。

除了RNA解旋酶的功能外,DDX21还作为非酶功能发挥作用,通过解开RNA来调节转录后修饰和促进转录。DDX21在健康和疾病中的角色是多方面的,它在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。

最近的研究表明,葡萄糖可以结合DDX21的ATP结合域,改变其蛋白构象,抑制其解旋酶活性,并使其二聚体解离。在分化过程中,葡萄糖水平的升高与DDX21从核仁到核浆的重新定位相关,DDX21在核浆中组装成更大的蛋白质复合物,包含RNA剪接因子。葡萄糖依赖性地将DDX21定位到mRNA内含子中的特定SCUGSDGC基序,并促进关键促分化基因的剪接,包括GRHL3、KLF4、OVOL1和RBPJ[1]。

DDX21蛋白在结直肠癌中高表达,这导致结直肠癌细胞在体外迁移和侵袭,以及体内结直肠到肝脏和肺的转移。DDX21对结直肠癌转移的影响与上皮-间质转化(EMT)通路的激活相关。此外,DDX21蛋白在体外和结直肠癌细胞中发生相分离,这控制着结直肠癌的转移。相分离的DDX21高度结合在MCM5基因位点,当其内在无序区域(IDR)发生突变导致相分离被破坏时,这种结合显著减少。结直肠癌中DDX21缺失的侵袭能力受损,可以通过MCM5的外源表达得到恢复,这表明MCM5是DDX21在结直肠癌转移中的关键下游靶点。此外,DDX21和MCM5共高表达与III期和IV期结直肠癌患者的预后不良显著相关,这表明这一机制在结直肠癌晚期和转移阶段的重要性[2]。

DDX21是一种重要的RNA解旋酶,参与RNA代谢的多个环节,包括RNA加工、转运、翻译和降解。DDX21在维持基因组稳定性、调节转录和RNA代谢方面发挥重要作用。此外,DDX21在多种疾病中发挥作用,包括结直肠癌、急性髓系白血病和癌症。研究表明,DDX21在结直肠癌中高表达,并与不良预后相关。此外,DDX21的活性和功能受到翻译后修饰的调控,这会影响其定位和降解。DDX21的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Miao, Weili, Porter, Douglas F, Lopez-Pajares, Vanessa, Nolan, Garry P, Khavari, Paul A. . Glucose dissociates DDX21 dimers to regulate mRNA splicing and tissue differentiation. In Cell, 186, 80-97.e26. doi:10.1016/j.cell.2022.12.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36608661/
2. Gao, Huabin, Wei, Huiting, Yang, Yang, Wang, Jia, Han, Anjia. 2023. Phase separation of DDX21 promotes colorectal cancer metastasis via MCM5-dependent EMT pathway. In Oncogene, 42, 1704-1715. doi:10.1038/s41388-023-02687-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37029300/