Ddx21-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ddx21-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11974

品系全称

C57BL/6JCya-Ddx21em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-56200-Ddx21-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx21-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11974) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
每周秒杀
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DExD box helicase 21
基因别称
D10Ertd645e,D10Wsu42e
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019553 | Ensembl: ENSMUST00000045866
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~2.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1860494Mice homozygous for an ENU-induced allele exhibit embryonic lethality. Mice homozygous for a knock-out allele show embryonic growth retardation and complete embryonic lethality prior to organogenesis, with morula-like embryos failing to hatch from the zona pellucida and to form in vitro outgrowths.
Ddx21基因编码的蛋白是一种DEAD-box RNA解旋酶,属于RNA解旋酶DDX家族。这个家族的成员在RNA代谢中发挥着重要作用,包括RNA的合成、加工、转运、翻译和降解等过程。Ddx21在维持基因组稳定性方面也发挥着重要作用,它能够促进DNA损伤修复和解决R环。此外,Ddx21还参与了转录调控,通过与启动子区域的直接结合、与转录因子的相互作用以及通过非编码RNA来增强转录。

Ddx21的活性受到多种因素的调节,包括转录后修饰、蛋白与蛋白之间的相互作用以及细胞内环境的改变。例如,葡萄糖可以与Ddx21的ATP结合域结合,改变蛋白构象,抑制解旋酶活性,并解离Ddx21二聚体。在细胞分化过程中,葡萄糖水平升高与Ddx21的重新定位有关,从核仁转移到核质,形成包含RNA剪接因子的更大蛋白复合物。Ddx21在葡萄糖依赖性方式下定位于mRNA内含子中的特定SCUGSDGC基序,并促进关键分化基因的剪接,包括GRHL3、KLF4、OVOL1和RBPJ[1]。

在癌症发生发展中,Ddx21也发挥着重要作用。Ddx21在结直肠癌细胞中高度表达,导致细胞迁移和侵袭,并在体内促进结直肠癌的肝转移和肺转移。Ddx21在结直肠癌中的这种作用与上皮-间质转化(EMT)途径的激活有关。此外,Ddx21蛋白在体外和结直肠癌细胞中发生相分离,控制结直肠癌的转移。相分离的Ddx21高度结合在MCM5基因位点上,当其内源性无序区域(IDR)发生突变导致相分离被破坏时,这种结合显著减少。结直肠癌中Ddx21的缺失导致的转移能力受损可以通过MCM5的异位表达得到恢复,这表明MCM5是Ddx21在结直肠癌转移中的关键下游靶点。此外,Ddx21和MCM5的共同高表达与III期和IV期结直肠癌患者的生存率显著相关,表明这种机制在结直肠癌晚期和转移阶段的重要性[2]。

Ddx21还与急性髓细胞性白血病(AML)的进展有关。在AML中,Ddx21通过超增强子驱动的IGF2BP2和IGF2BP3的m6A依赖性上调,促进了AML的进展。IGF2BP2和IGF2BP3通过m6A修饰增强Ddx21 mRNA的稳定性。在AML患者中,Ddx21的高表达预示着不良的生存预后。功能研究表明,Ddx21的敲低抑制了细胞的增殖,促进了细胞的凋亡,并导致了细胞周期的阻滞。机制研究表明,Ddx21招募转录因子YBX1协同触发ULK1的表达。此外,沉默ULK1可以逆转Ddx21过表达在AML细胞中的促进作用。SE-IGF2BP2/IGF2BP3-DDX21轴的失调促进了AML的进展[3]。

Ddx21在调节细胞生长和肿瘤发生中发挥着重要作用。例如,在N-Myc扩增的神经母细胞瘤细胞中,N-Myc蛋白结合到DDX21基因启动子并上调DDX21的mRNA和蛋白表达。基因组范围差异基因表达研究确定了中心体蛋白CEP55是DDX21敲低后最显著下调的基因之一。敲低DDX21或CEP55减少了神经母细胞瘤细胞的细胞骨架稳定性、细胞增殖,几乎消除了克隆形成能力。重要的是,DDX21敲低最初在神经母细胞瘤小鼠模型中诱导肿瘤消退并抑制肿瘤进展。在人神经母细胞瘤组织中,DDX21的高表达与N-Myc的高表达和CEP55的高表达相关,并且独立地预示着患者的预后不良。这些数据表明,DDX21通过诱导CEP55表达、N-Myc扩增的神经母细胞瘤细胞增殖和肿瘤发生,DDX21和CEP55是治疗MYCN扩增的神经母细胞瘤的有效治疗靶点[4]。

综上所述,Ddx21作为一种RNA解旋酶,在RNA代谢和基因组稳定性方面发挥着重要作用。Ddx21的失调与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症。因此,深入研究Ddx21的生物学功能和调控机制,有助于揭示疾病的发病机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Miao, Weili, Porter, Douglas F, Lopez-Pajares, Vanessa, Nolan, Garry P, Khavari, Paul A. . Glucose dissociates DDX21 dimers to regulate mRNA splicing and tissue differentiation. In Cell, 186, 80-97.e26. doi:10.1016/j.cell.2022.12.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36608661/
2. Gao, Huabin, Wei, Huiting, Yang, Yang, Wang, Jia, Han, Anjia. 2023. Phase separation of DDX21 promotes colorectal cancer metastasis via MCM5-dependent EMT pathway. In Oncogene, 42, 1704-1715. doi:10.1038/s41388-023-02687-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37029300/
3. Zhao, Yanchun, Zhou, Yutong, Qian, Yu, Sun, Jie, Jin, Jie. . m6A-dependent upregulation of DDX21 by super-enhancer-driven IGF2BP2 and IGF2BP3 facilitates progression of acute myeloid leukaemia. In Clinical and translational medicine, 14, e1628. doi:10.1002/ctm2.1628. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38572589/
4. Putra, Vina, Hulme, Amy J, Tee, Andrew E, Liu, Tao, Liu, Pei Y. 2021. The RNA-helicase DDX21 upregulates CEP55 expression and promotes neuroblastoma. In Molecular oncology, 15, 1162-1179. doi:10.1002/1878-0261.12906. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33497018/