Cyp2w1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Cyp2w1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11810

品系全称

C57BL/6JCya-Cyp2w1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-545817-Cyp2w1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Cyp2w1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11810) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cytochrome P450, family 2, subfamily w, polypeptide 1
基因别称
Gm455
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001160265.2 | Ensembl: ENSMUST00000031521
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~9
敲除长度
~2230 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CYP2W1是一种细胞色素P450酶,属于CYP2家族。细胞色素P450酶是一类重要的酶,参与内源性和外源性物质的代谢。CYP2W1在胚胎发育过程中表达,在出生后肠道和结肠中沉默,但在结直肠癌(CRC)中重新激活。研究表明,CYP2W1的表达水平与CRC的恶性程度呈正相关,在转移灶中更高,并且与结肠癌患者的生存相关。此外,CYP2W1的mRNA在肝细胞癌、肾上腺皮质癌、儿童横纹肌肉瘤和乳腺癌中也有检测到,但蛋白表达尚未得到证实。CYP2W1酶在细胞内质网膜中的方向与其它细胞色素P450s相反,其直接电子供体尚不清楚。几种脂质配体被认为是内源性底物,其中视黄醇衍生物似乎具有最高的亲和力。然而,CYP2W1在视黄醇衍生物的肿瘤定位代谢中的作用还有待阐明。吲哚类化合物是高亲和力外源性化合物,其中特定的氯甲基吲哚类化合物已在体外和体内被CYP2W1激活为细胞毒性产物,抑制小鼠异种移植模型中人类结肠肿瘤的生长。CYP2W1在CRC中的特异性定位及其有效的药物前体激活使其成为未来癌症治疗药物开发的非常有前景的靶点[1]。

CYP2W1的表达和基因甲基化在人类结肠癌中已被分析。研究显示,在所有(n=39)分析的肿瘤样本中检测到CYP2W1 mRNA,而且,在60%(12/20)的结肠癌中,CYP2W1 mRNA水平比相应的正常组织高得多。CYP2W1蛋白在大多数分析的结肠肿瘤样本中被检测到(n=16),显示出两种明显的表型:一种是CYP2W1诱导五到十倍(大约50%的肿瘤),另一种是低表达,含有与周围对照组织相似或仅略高量的CYP2W1。CYP2W1基因外显子1-内含子1连接处的CpG岛甲基化分析表明,去甲基化的CpG二核苷酸似乎是高CYP2W1基因表达的要求。CYP2W1的表达是结肠肿瘤特异性的,与CYP2W1基因的甲基化状态相关,这表明基因低甲基化与其增强表达之间存在潜在的因果关系[2]。

在中国维吾尔族和汉族人群中,CYP2W1基因的遗传多态性已被研究。在385名中国受试者(包括223名汉族和162名维吾尔族)中,通过双脱氧链终止法对所有9个外显子和外显子-内含子连接处进行测序。结果显示,检测到40个单核苷酸多态性(SNPs)(外显子中有14个,内含子中有26个),其中10个是中国人的新变异。外显子中有7个新SNPs,其他3个新SNPs在内含子中。外显子中的6个新非同义变异,包括131T>C(Leu44Pro)、1289C>A(Ala88Glu)、2027G>A(Arg187Gln)和5070C>T(Thr383Met),通过计算预测会影响CYP2W1蛋白功能,尽管这些变异是杂合子。此外,分析了6个已知SNPs的等位基因频率,包括CYP2W1*2(2008G>A)和CYP2W1*3(173A>C),发现汉族(分别为2.9%和0.0%)和维吾尔族(分别为5.2%和0.0%)个体的等位基因频率显著低于之前报道的高加索人(分别为9.1%和33.1%,P<0.05)。这些数据为中国和其他民族人群CYP2W1的药物遗传学研究提供了有用的信息[3]。

一项研究旨在调查橙皮苷处理的LGG细胞上清液对Caco2结肠癌细胞活力和CYP2W1基因表达的影响。研究发现,五倍稀释的橙皮苷处理的细胞上清液浓度显著降低了Caco2结肠癌细胞活力。此外,CYP2W1基因表达在CFS处理后也显著降低,在益生菌细菌CFS处理下几乎沉默。CYP2W1基因表达被来自LGG培养的细胞上清液显著降低,无论是否添加橙皮苷。这表明抑制可能是由于细菌代谢物,而不是橙皮苷。因此,这些代谢物的失调可能导致CYP2W1相关的结肠癌细胞增殖[4]。

一项研究旨在调查CYP2W1等位基因变异与结直肠癌(CRC)风险之间的可能关联及其功能特性。研究确定了1785例CRC患者和1761名健康献血者中三种不同CYP2W1等位基因(CYP2W1*1、CYP2W1*2和CYP2W1*6)的分布,并使用TaqMan(®)(Applied Biosystems,CA,美国)等位基因区分分析或等位基因特异性扩增。在转染的SW480细胞中表达相应的基因产物(CYP2W1.1、CYP2W1.2和CYP2W1.6),并监测其对两种不同底物,即双环霉素类似物ICT2706和ICT2726的活性。在CRC患者和对照组中,CYP2W1*1、CYP2W1*2和CYP2W1*6等位基因的分布没有显著差异。CYP2W1.1、CYP2W1.2和CYP2W1.6变异酶在转染的SW480细胞中表达水平相似,并且在双环霉素ICT2726的代谢以及在ICT2706的生物活化成细胞毒性产物方面具有可比的动力学。这些来自大量CRC患者和对照组的流行病学数据不能证实先前提出的CYP2W1*2携带者CRC风险降低。在分子水平上,CYP2W1.1、CYP2W1.2和CYP2W1.6变异体的相似催化特性进一步支持了这一结论[5]。

CYP2W1基因在日本人群中的遗传多态性和单倍型结构已被研究。基于对PCR产物的变性高效液相色谱分析,分析了200名日本受试者DNA样本中基因的9个外显子和外显子-内含子连接处。鉴定了6个单核苷酸多态性(SNP)。三个新的非同义SNP如下:外显子1中的173A>C(Glu58Ala)和外显子9中的5432G>A(Val432Ile)和5584G>C(Gln482His)。还发现了两个已知的非同义SNP,即外显子4中的2008G>A(Ala181Thr)和外显子9中的5601C>T(Pro488Leu)。单倍型分析显示,除了野生型CYP2W1*1A(频率,0.295)等位基因外,还鉴定了其他等位基因,即CYP2W1*1B(0.318)、CYP2W1*2(0.005)、CYP2W1*3(0.005)、CYP2W1*4(0.008)、CYP2W1*5(0.003)和CYP2W1*6(0.368)。最常见的等位基因CYP2W1*6表现出氨基酸替代Pro488Leu。这些结果与使用Hardy-Weinberg方程计算得出的预期基因型分布相符。关于变异等位基因和全面单倍型结构的数据对于预测日本人群CYP2W1底物的代谢表型非常有用[6]。

一项研究调查了KRT13、FAIM2和CYP2W1 mRNA在具有风险习惯的口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者中的表达。从41例具有和不具有风险习惯的OSCC样本中提取cDNA,用于本项研究。使用定量实时PCR分析OSCC中的KRT13、FAIM2和CYP2W1。管家基因(GAPDH)用作内源性对照。在41例OSCC样本中,KRT13在40例样本中下调(97.6%),而FAIM2和CYP2W1分别在61.0%和48.8%的样本中下调。总体而言,KRT13、FAIM2和CYP2W1的表达与风险习惯、选择的临床病理参数和患者生存之间没有关联。尽管这项研究未能显示出统计学意义,但KRT13、FAIM2和CYP2W1在OSCC中的表达与选择的临床病理参数和生存之间存在一些关联趋势[7]。

CYP2W1的肿瘤特异性表达及其在癌症治疗中的潜在药物靶点已被综述。CYP2W1酶在转化组织和胎儿生活中表达,而在人类成人组织中仅检测到低水平表达。CYP2W1已被证明可以代谢花生四烯酸和苯甲恶嗪,以及代谢激活几种前致癌物,包括多环芳烃二氢二醇、黄曲霉毒素B1和棒曲霉素。基因表达受基因甲基化调控。在一些癌症中的选择性表达和在正常组织中的低表达使CYP2W1成为癌症治疗中的潜在药物靶点。作者综述了目前可用的关于这种酶的数据,并讨论了其作为药物靶点的潜力[8]。

PLAG家族基因PLAGL1和PLAGL2的扩增是新型肿瘤类型CNS胚胎肿瘤的关键特征。研究使用基于DNA甲基化的CNS肿瘤分类,结合拷贝数、RNA-seq和ChIP-seq分析来表征新发现的CNS肿瘤类型。此外,还报告了这种肿瘤类型的组织学、患者特征和生存数据。描述了一种生物学上独特的儿科CNS肿瘤类型(n=31例),其特征是局灶性高水平扩增和PLAGL1或PLAGL2的过表达,以及缺乏其他儿科CNS肿瘤类型特征性的复发遗传改变。这两种基因都作为印记基因(IGs)的转录因子,这些印记基因是Wnt/β-Catenin通路的组成部分,以及潜在的药物靶点RET和CYP2W1,这些基因也特别在这种肿瘤类型中过表达。PLAGL特异性基因表达特征表明印记控制失调和分化/发育。这些肿瘤发生在神经轴的各个部位,包括大脑半球、小脑和脑干,主要由缺乏胶质或神经元分化标记(如GFAP、OLIG2和突触素)的原始胚胎样细胞组成。PLAGL1扩增的肿瘤通常在青春期诊断(中位年龄10.5岁),而PLAGL2扩增的肿瘤在幼儿期诊断(中位年龄2岁)。PLAGL1扩增肿瘤的10年总生存率为66%,PLAGL2扩增肿瘤为25%,男性患者为18%,女性患者为82%。总之,描述了一种新型生物学上独特的CNS肿瘤,特征是PLAGL1/2扩增,主要发生在婴儿和幼儿(PLAGL2)或青少年(PLAGL1),我们将其归类为CNS胚胎肿瘤,并伴有中等生存率。细胞起源和最佳治疗策略仍有待确定[9]。

一项研究旨在评估CYP2W1在人类肝细胞癌(HCC)中的表达和预后意义。使用实时定量逆转录聚合酶链反应(qRT-PCR)检测41对新鲜冷冻HCC组织和相邻非癌组织中的CYP2W1信使RNA(mRNA)表达。此外,通过免疫组织化学分析了133例临床病理特征明确的HCC病例中的CYP2W1表达。使用适当的统计学方法分析了CYP2W1表达与临床病理特征之间的关系。使用Kaplan-Meier分析和Cox比例风险回归模型研究了CYP2W1表达与HCC患者预后的相关性。CYP2W1的相对mRNA表达在HCC组织中显著高于相邻非癌组织(P<0.001)。此外,CYP2W1表达与肿瘤大小(P=0.023)、组织学分化(P=0.04)和肿瘤分期(P=0.014)显著相关。Kaplan-Meier生存曲线表明,CYP2W1高表达的患者比低表达的患者总生存期更短(P<0.001)。此外,Cox回归分析表明,CYP2W1表达是总生存率的独立预测因子。这些数据表明,CYP2W1可能在HCC中发挥重要作用,并可能作为有价值的预后标志物和HCC基因治疗的潜在靶点[10]。

综上所述,CYP2W1是一种在多种癌症中表达的细胞色素P450酶,其表达受基因甲基化调控。CYP2W1在结肠癌、肝细胞癌等癌症中的表达与肿瘤的恶性程度和患者生存相关,使其成为潜在的药物靶点。此外,CYP2W1的遗传多态性在不同人群中存在差异,这可能影响其对药物的反应。进一步的研究将有助于深入了解CYP2W1在癌症发生和发展中的作用,并为癌症治疗提供新的策略和靶点。

参考文献:
1. Guo, Jia, Johansson, Inger, Mkrtchian, Souren, Ingelman-Sundberg, Magnus. 2016. The CYP2W1 enzyme: regulation, properties and activation of prodrugs. In Drug metabolism reviews, 48, 369-78. doi:10.1080/03602532.2016.1188939. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27257736/
2. Gomez, Alvin, Karlgren, Maria, Edler, David, Mkrtchian, Souren, Ingelman-Sundberg, Magnus. . Expression of CYP2W1 in colon tumors: regulation by gene methylation. In Pharmacogenomics, 8, 1315-25. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17979506/
3. Qi, Guang-Zhao, Wang, Xin, Miao, Xiao-Jie, Lou, Ya-Qing, Zhang, Guo-Liang. 2015. Novel single nucleotide polymorphisms (SNPs) of CYP2W1 gene in Chinese Uygur and Han populations. In Drug metabolism and pharmacokinetics, 30, 449-52. doi:10.1016/j.dmpk.2015.11.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26683388/
4. Akkulak, Merve, Evin, Emre, Durukan, Ozlem, Celebioglu, Hasan Ufuk, Adali, Orhan. . Modulation of Caco-2 Colon Cancer Cell Viability and CYP2W1 Gene Expression by Hesperidin-treated Lacticaseibacillus rhamnosus GG (LGG) Cell-free Supernatants. In Anti-cancer agents in medicinal chemistry, 24, 372-378. doi:10.2174/0118715206271514231124111026. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38058098/
5. Stenstedt, Kristina, Travica, Sandra, Guo, Jia, Johansson, Inger, Ingelman-Sundberg, Magnus. . CYP2W1 polymorphism: functional aspects and relation to risk for colorectal cancer. In Pharmacogenomics, 14, 1615-22. doi:10.2217/pgs.13.136. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24088132/
6. Hanzawa, Yoshiyuki, Sasaki, Takamitsu, Mizugaki, Michinao, Ishikawa, Masaaki, Hiratsuka, Masahiro. 2007. Genetic polymorphisms and haplotype structures of the human CYP2W1 gene in a Japanese population. In Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals, 36, 349-52. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17998294/
7. Hartanto, Firstine Kelsi, Karen-Ng, Lee Peng, Vincent-Chong, Vui King, Tay, Keng Kiong, Zain, Rosnah Binti. . KRT13, FAIM2 and CYP2W1 mRNA expression in oral squamous cell carcinoma patients with risk habits. In Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP, 16, 953-8. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25735388/
8. Karlgren, Maria, Ingelman-Sundberg, Magnus. . Tumour-specific expression of CYP2W1: its potential as a drug target in cancer therapy. In Expert opinion on therapeutic targets, 11, 61-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17150034/
9. Keck, Michaela-Kristina, Sill, Martin, Wittmann, Andrea, Solomon, David A, Jones, David T W. 2022. Amplification of the PLAG-family genes-PLAGL1 and PLAGL2-is a key feature of the novel tumor type CNS embryonal tumor with PLAGL amplification. In Acta neuropathologica, 145, 49-69. doi:10.1007/s00401-022-02516-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36437415/
10. Zhang, Ke, Jiang, Li, He, Rong, Huang, Rong-Hai, Mu, Yi. 2014. Prognostic value of CYP2W1 expression in patients with human hepatocellular carcinoma. In Tumour biology : the journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine, 35, 7669-73. doi:10.1007/s13277-014-2023-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24801906/