Krr1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Krr1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11552

品系全称

C57BL/6JCya-Krr1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-52705-Krr1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krr1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11552) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
KRR1, small subunit (SSU) processome component, homolog (yeast)
基因别称
2610511F02Rik,D10Ertd773e,Hrb2
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178610.4 | Ensembl: ENSMUST00000163048
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~673 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Krr1基因编码一种蛋白质,该蛋白质对细胞存活至关重要,并参与核糖体的生物合成过程。在酵母中,Krr1基因(YCL059c)编码的蛋白质Krr1p定位于核仁,并负责18S rRNA的合成和40S核糖体亚基的组装。研究表明,Krr1p具有一个保守的碱性氨基酸基序,在进化上与人类等物种中的类似蛋白质高度相似。当Krr1p在体内耗尽时,会导致40S核糖体亚基的急剧减少,这是由于18S rRNA合成的缺陷。因此,Krr1p被认为是正确处理前rRNA和组装前核糖体40S亚基所必需的[1]。

Krr1基因不仅在酵母中存在,也在其他真核生物中存在。例如,在无核仁的真核生物贾第虫(Giardia lamblia)中,已经发现了酵母Krr1基因的同源基因。尽管贾第虫缺乏核仁,但Krr1基因仍然活跃转录。贾第虫Krr1基因编码的蛋白质序列与酵母KRR1p高度相似,都包含一个单一的KH结构域,并具有保守的KR(K)R基序。这表明,尽管贾第虫缺乏核仁,但其前rRNA处理机制可能与其他真核生物相似。此外,数据库搜索显示,Krr1基因在多种真核生物和古菌中存在,表明Krr1基因可能在生物界中普遍存在,并具有保守的功能[2]。

Krr1基因的产物Krr1p与其他核糖体蛋白相互作用,共同参与核糖体的生物合成过程。例如,Krr1p与EF-1α、核糖甲基转移酶和多种核糖体蛋白存在功能性和物理性相互作用。这些相互作用表明,Krr1p和与之相互作用的核糖体蛋白可能在转录水平上被协调调节[5]。此外,Krr1p还与一个名为Kri1p的蛋白质相互作用,形成复合物,共同参与40S核糖体亚基的生物合成。Krr1p和Kri1p的缺陷都会导致18S rRNA的合成减少,并影响40S核糖体亚基的形成[7]。

Krr1基因在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞增殖、发育和代谢。研究表明,Krr1基因的表达在细胞分裂旺盛的时期较高,而在细胞进入静止期时几乎完全停止。这表明Krr1基因可能参与调控细胞周期和细胞增殖。此外,Krr1基因的表达还受到多种上游调控因素的影响,例如甲状腺激素和生长因子。这些调控因素可能通过影响Krr1基因的表达来调节核糖体的生物合成和细胞的功能[3]。

Krr1基因的突变或缺陷与多种疾病的发生和发展有关。例如,在多囊卵巢综合征(PCOS)患者中,KRR1基因附近的基因表达存在差异,表明KRR1基因可能参与PCOS的发病机制[6]。此外,Krr1基因的突变还与某些癌症的发生有关,例如乳腺癌。研究表明,乳腺癌患者血清中KRR1基因的抗体水平升高,表明KRR1基因可能作为乳腺癌的潜在标志物[4]。

综上所述,Krr1基因编码的蛋白质Krr1p在核糖体的生物合成过程中发挥重要作用,参与调控细胞的增殖、发育和代谢。Krr1基因的表达受到多种上游调控因素的影响,并与多种疾病的发生和发展有关。对Krr1基因的研究有助于深入理解核糖体的生物合成机制和疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Gromadka, R, Rytka, J. . The KRR1 gene encodes a protein required for 18S rRNA synthesis and 40S ribosomal subunit assembly in Saccharomyces cerevisiae. In Acta biochimica Polonica, 47, 993-1005. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11996121/
2. Xin, De-Dong, Wen, Jian-Fan, He, De, Lu, Si-Qi. 2004. Identification of a Giardia krr1 homolog gene and the secondarily anucleolate condition of Giaridia lamblia. In Molecular biology and evolution, 22, 391-4. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15548749/
3. Gromadka, R, Kaniak, A, Slonimski, P P, Rytka, J. . A novel cross-phylum family of proteins comprises a KRR1 (YCL059c) gene which is essential for viability of Saccharomyces cerevisiae cells. In Gene, 171, 27-32. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8675026/
4. Dyachenko, Lada, Havrysh, Kristina, Lytovchenko, Anita, Filonenko, Valeriy, Kiyamova, Ramziya. 2016. Autoantibody Response to ZRF1 and KRR1 SEREX Antigens in Patients with Breast Tumors of Different Histological Types and Grades. In Disease markers, 2016, 5128720. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27847402/
5. Gromadka, Robert, Karkusiewicz, Iwona, Rempoła, Bozenna, Rytka, Joanna. . Functional and physical interactions of Krr1p, a Saccharomyces cerevisiae nucleolar protein. In Acta biochimica Polonica, 51, 173-87. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15094838/
6. Pau, Cindy T, Mosbruger, Tim, Saxena, Richa, Welt, Corrine K. 2017. Phenotype and Tissue Expression as a Function of Genetic Risk in Polycystic Ovary Syndrome. In PloS one, 12, e0168870. doi:10.1371/journal.pone.0168870. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28068351/
7. Sasaki, T, Toh-E, A, Kikuchi, Y. . Yeast Krr1p physically and functionally interacts with a novel essential Kri1p, and both proteins are required for 40S ribosome biogenesis in the nucleolus. In Molecular and cellular biology, 20, 7971-9. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11027267/