Setd3-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Setd3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11550

品系全称

C57BL/6JCya-Setd3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-52690-Setd3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Setd3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11550) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SET domain containing 3
基因别称
2610102I01Rik,2610305M23Rik,6030490B17Rik,D12Ertd771e
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_028262 | Ensembl: ENSMUST00000071095
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~0.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1289184Mice homozygous for a knock-out allele exhibit impaired migration of MEFs, reduced litter size from female mice and primary dystocia. Homozygous KO also protects against enterovirus infection.
SETD3,也称为SET domain containing 3,是一种重要的蛋白质赖氨酸甲基转移酶(PKMT),催化将甲基团添加到赖氨酸残基上。SETD3在多种生物学事件中发挥关键作用,包括细胞分裂、细胞增殖、细胞周期、DNA损伤诱导的凋亡、VEGF表达调节、肌肉细胞分化和mRNA选择性剪接等。SETD3的异常调控与多种疾病的发生和发展密切相关,包括肝细胞癌(HCC)、结直肠癌和神经母细胞瘤等。

SETD3在肝细胞癌的发生和发展中发挥重要作用。研究表明,SETD3的表达上调与HCC的发生密切相关。SETD3通过调节PLK1的表达促进HCC的发生。PLK1是一种丝氨酸/苏氨酸激酶,参与细胞分裂和细胞周期调控。SETD3能够招募到PLK1基因的启动子区域,促进PLK1的转录。此外,SETD3的表达上调还能够促进肿瘤细胞的增殖和迁移,而抑制PLK1的活性则能够减弱SETD3引起的这些表型变化。这些研究表明,SETD3可能作为HCC治疗的一个潜在靶点[1]。

SETD3的表达水平受到多种因素的调控。研究发现,去泛素化酶USP27能够与SETD3相互作用,抑制其泛素化,从而增强其稳定性。USP27的表达上调与SETD3的表达上调呈正相关,并且USP27和SETD3的表达上调预示着HCC患者的不良预后。这些结果表明,USP27依赖的机制控制着SETD3蛋白水平,并促进其在肝肿瘤发生中的致癌作用[2]。

SETD3还参与DNA损伤诱导的凋亡过程。研究发现,SETD3是DNA损伤诱导的凋亡的正向调节因子。SETD3的耗竭能够抑制结肠癌细胞在多柔比星处理后的凋亡。SETD3与肿瘤抑制因子p53相互作用,并在多柔比星处理下正调节p53靶基因的激活。SETD3的存在和催化活性对于p53招募到其靶基因是必需的。这些结果表明,SETD3在调节p53依赖的凋亡中发挥重要作用[3]。

SETD3还参与VEGF表达的调节。研究表明,SETD3与转录因子FoxM1相互作用并甲基化FoxM1,从而负向调节VEGF的表达。在缺氧条件下,SETD3的表达下调,而VEGF的表达上调。SETD3和FoxM1在VEGF启动子区域的富集与VEGF的表达下调相关。这些结果表明,SETD3通过染色质相关甲基化途径调节VEGF的表达[4]。

SETD3还参与肌肉细胞分化的调节。研究发现,miR-15b和miR-322能够抑制SETD3的表达,从而抑制肌肉细胞分化。SETD3的耗竭能够恢复miR-15b或miR-322抑制的肌肉细胞分化表型。转录因子E2F1和FAM3B分别正向和负向调节miR-15b和miR-322的表达,进而影响SETD3的表达。这些结果表明,SETD3在肌肉细胞分化中发挥重要作用[5]。

SETD3还参与mRNA选择性剪接的调节。研究发现,SETD3与许多剪接因子相互作用,并且调节pre-mRNA的剪接事件,主要影响外显子跳跃。SETD3与hnRNPK相互作用,共同调节外显子跳跃。SETD3和hnRNPK对于FNIP1基因外显子7跳跃的保留是必需的,这促进了FNIP1介导的转录因子TFEB的核转位和溶酶体和线粒体生物合成。这些结果表明,SETD3在调节mRNA选择性剪接中发挥重要作用[6]。

综上所述,SETD3是一种重要的蛋白质赖氨酸甲基转移酶,参与多种生物学事件,包括细胞分裂、细胞增殖、细胞周期、DNA损伤诱导的凋亡、VEGF表达调节、肌肉细胞分化和mRNA选择性剪接等。SETD3的异常调控与多种疾病的发生和发展密切相关,包括肝细胞癌、结直肠癌和神经母细胞瘤等。SETD3的研究有助于深入理解SETD3的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cheng, Meng, Yang, Qingmiao, Liu, Yafei, Xu, Ximing, Du, Hai-Ning. 2022. SETD3 Methyltransferase Regulates PLK1 Expression to Promote In Situ Hepatic Carcinogenesis. In Frontiers in oncology, 12, 882202. doi:10.3389/fonc.2022.882202. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35912180/
2. Zou, Tingting, Wang, Yang, Dong, Ling, Yan, Xiaohua, Lin, Zhenghong. 2022. Stabilization of SETD3 by deubiquitinase USP27 enhances cell proliferation and hepatocellular carcinoma progression. In Cellular and molecular life sciences : CMLS, 79, 70. doi:10.1007/s00018-021-04118-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35018513/
3. Abaev-Schneiderman, Elina, Admoni-Elisha, Lee, Levy, Dan. 2019. SETD3 is a positive regulator of DNA-damage-induced apoptosis. In Cell death & disease, 10, 74. doi:10.1038/s41419-019-1328-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30683849/
4. Cohn, Ofir, Feldman, Michal, Weil, Lital, Kublanovsky, Margarita, Levy, Dan. 2016. Chromatin associated SETD3 negatively regulates VEGF expression. In Scientific reports, 6, 37115. doi:10.1038/srep37115. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27845446/
5. Zhao, Meng-Jie, Xie, Jun, Shu, Wen-Jie, Jiang, Wei, Du, Hai-Ning. 2019. MiR-15b and miR-322 inhibit SETD3 expression to repress muscle cell differentiation. In Cell death & disease, 10, 183. doi:10.1038/s41419-019-1432-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30796205/
6. Kong, Yue-Yu, Shu, Wen-Jie, Wang, Shuang, Li, Ke, Du, Hai-Ning. 2024. The methyltransferase SETD3 regulates mRNA alternative splicing through interacting with hnRNPK. In Cell insight, 3, 100198. doi:10.1016/j.cellin.2024.100198. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39391005/