Mrpl48-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Mrpl48-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11510

品系全称

C57BL/6JCya-Mrpl48em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-52443-Mrpl48-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Mrpl48-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11510) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
mitochondrial ribosomal protein L48
基因别称
1810030E20Rik,2610028L11Rik,CGI-118,D4Ertd786e,L48mt,MRP-L48
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_198831.3 | Ensembl: ENSMUST00000150042
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 6
敲除长度
~603 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MRPL48,也称为线粒体核糖体蛋白L48,是线粒体核糖体蛋白(MRPs)家族的成员。MRPs是线粒体核糖体的重要组成部分,对于线粒体核糖体的结构和功能的完整性至关重要。在哺乳动物中,线粒体核糖体通过获得新的Mrp基因来补偿核糖体RNA的丢失。目前,哺乳动物中已经鉴定出超过80种MRPs。研究表明,Mrp基因在早期胚胎发生过程中持续表达,且表达模式没有明显的阶段或组织特异性。此外,MRP蛋白之间的氨基酸序列差异较大,表明它们可能具有独特的生物学功能。大多数Mrp基因对于胚胎发育至关重要,如果缺失会导致早期胚胎死亡,这表明Mrp基因之间没有功能冗余。因此,Mrp基因不是由单个祖先基因进化而来,每个MRP在线粒体核糖体复合体中都有其独特的、不可或缺的作用。线粒体核糖体对于细胞和生物体的存活至关重要,因此Mrp基因的缺乏功能性冗余令人惊讶。进一步的研究表明,Mrp基因的基因组变异可能导致早期妊娠丢失,因此应该从临床角度进行评估[1]。

在乳腺癌中,NRG1基因融合可能具有临床意义,因为携带融合转录本的癌症可能对酪氨酸激酶抑制剂敏感。NRG1基因编码HER2(ERBB2)-ERBB3异源二聚体受体酪氨酸激酶的配体,基因融合被认为会导致受体自分泌刺激。然而,NRG1融合的肿瘤发生机制和结构尚未完全阐明,且在乳腺癌中关于此类融合的数据有限。研究发现,乳腺癌细胞系MDA-MB-175中表达的NRG1融合蛋白实际上是一个双重融合,即PPP6R3-TENM4-NRG1,产生多个转录本,其中一些包含NRG1的细胞质尾。NRG1融合可能具有致癌性,并不是因为缺乏细胞质结构域,而是因为它们不编码NRG1的核定位形式。MDA-MB-175中的融合是由非常复杂的基因组重排造成的,这种重排还会产生其他表达的基因融合,如RSF1-TENM4、TPCN2-RSF1和MRPL48-GAB2。此外,在571例乳腺癌中,发现4例(0.7%)存在NRG1重排,分别为WRN-NRG1、FAM91A1-NRG1、ARHGEF39-NRG1和ZNF704-NRG1,它们都在与MDA-MB-175中NRG1相同的内含子上拼接。然而,WRN-NRG1和ARHGEF39-NRG1融合是移码的。在许多乳腺癌病例中,NRG1的重排更可能使NRG1失活而不是激活,或者由于重排复杂,其结果无法预测。这并不奇怪,因为NRG1可以促进细胞凋亡,并且在某些乳腺癌中被失活。因此,需要对NRG1重排进行仔细的解释,以便对患者进行适当的管理[2]。

MRPL48在肝细胞癌(HCC)中高表达,与HCC的发展与预后相关。与正常组织相比,HCC组织中MRPL48的表达显著升高。生存和回归分析表明,MRPL48表达对于HCC具有重要的临床预后价值。ROC曲线和列线图分析表明,MRPL48是HCC的强有力预测指标。MRPL48甲基化与MRPL48表达呈负相关,低甲基化水平患者的总生存期较差。GSEA分析表明,MRPL48的表达与姐妹染色单体凝聚的解决、有丝分裂前期、视网膜母细胞瘤基因在癌症中的作用、RHO Gtpases激活形式、有丝分裂中期和后期、以及细胞周期检查点相关。免疫细胞浸润分析显示,MRPL48与免疫细胞浸润亚群之间存在显著关联,这影响HCC患者的生存。此外,MRPL48敲低可以降低HCC细胞的增殖、迁移和侵袭能力。这些发现表明,MRPL48的表达可能与HCC的发生和预后相关,为HCC的治疗研究提供了新的方向和机会[3]。

在结直肠癌中,使用CRISPR-Cas9技术检测了与西妥昔单抗(CTX)敏感性相关的基因。研究发现,敲除MMP15、MRPL48、CALN1和HADHB这四个基因中的任何一个,都可以增强Caco-2细胞对CTX的敏感性。这表明,MMP15、MRPL48、CALN1和HADHB基因与CRC中介导CTX敏感性相关[4]。

在肾上腺皮质癌中,11q13染色体的杂合性缺失是最常见的遗传改变。由于11q13染色体上的基因可能在肾上腺皮质癌的发生中发挥重要作用,因此研究人员比较了良性肾上腺皮质组织和恶性肾上腺皮质组织之间这些基因的表达谱。研究发现,在肾上腺皮质癌中,25个位于11q13染色体上的基因表达下调,其中21个基因通过RT-PCR验证为差异表达。六种基因(SERPING1、MRPL48、TM7SF2、DDB1、NDUSF8和PRDX5)在良性肾上腺皮质肿瘤和恶性肾上腺皮质肿瘤之间存在显著差异表达,且具有很高的诊断准确性。这些基因可能成为肾上腺皮质癌的候选诊断标记物和肿瘤抑制基因[5]。

在荷斯坦奶牛中,通过评估与繁殖性状相关的基因中的单核苷酸多态性(SNPs)来预测繁殖遗传优势。研究发现,39个SNPs与繁殖性状相关,其中MRPL48基因的SNPs与女儿妊娠率(DPR)相关。这些基因的SNPs的纳入可以提高基因组估计的可靠性,从而改善繁殖性状的遗传评价[6]。

在肾上腺皮质癌细胞中,DNA启动子甲基化抑制剂地西他滨可以恢复染色体11q13上沉默基因的表达,并具有抗肿瘤作用。研究发现,地西他滨可以抑制肾上腺皮质癌细胞的增殖、皮质醇分泌和细胞侵袭。地西他滨恢复表达了11q13染色体上的NDUFS8和PRDX5基因。这表明,地西他滨在肾上腺皮质癌细胞中具有抗肿瘤作用,可能是晚期疾病患者的有效辅助治疗。地西他滨恢复11q13染色体上沉默基因的表达,表明表观遗传基因沉默可能在肾上腺皮质癌的发生中发挥作用[7]。

综上所述,MRPL48是一种重要的线粒体核糖体蛋白,参与线粒体核糖体的结构和功能的完整性。MRPL48在多种癌症中发挥重要作用,包括乳腺癌、肝细胞癌、结直肠癌和肾上腺皮质癌。此外,MRPL48还与繁殖性状相关,在荷斯坦奶牛中与女儿妊娠率相关。MRPL48的研究有助于深入理解线粒体核糖体的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cheong, Agnes, Lingutla, Ranjana, Mager, Jesse. 2020. Expression analysis of mammalian mitochondrial ribosomal protein genes. In Gene expression patterns : GEP, 38, 119147. doi:10.1016/j.gep.2020.119147. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32987154/
2. Howarth, Karen D, Mirza, Tashfina, Cooke, Susanna L, Caldas, Carlos, Edwards, Paul A W. 2021. NRG1 fusions in breast cancer. In Breast cancer research : BCR, 23, 3. doi:10.1186/s13058-020-01377-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33413557/
3. Lin, Yu-Xiang, Pan, Jun-Yong, Feng, Wen-Du, Huang, Tian-Cong, Li, Cheng-Zong. 2023. MRPL48 is a novel prognostic and predictive biomarker of hepatocellular carcinoma. In European journal of medical research, 28, 589. doi:10.1186/s40001-023-01571-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38093387/
4. Hu, Ting-Ting, Yang, Jia-Wen, Yan, Ye, Xiang, You-Qun, Ye, Le-Chi. . Detection of genes responsible for cetuximab sensitization in colorectal cancer cells using CRISPR-Cas9. In Bioscience reports, 40, . doi:10.1042/BSR20201125. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33048115/
5. Fernandez-Ranvier, Gustavo G, Weng, Julie, Yeh, Ru-Fang, Clark, Orlo H, Kebebew, Electron. . Candidate diagnostic markers and tumor suppressor genes for adrenocortical carcinoma by expression profile of genes on chromosome 11q13. In World journal of surgery, 32, 873-81. doi:10.1007/s00268-008-9521-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18324346/
6. Ortega, M S, Denicol, A C, Cole, J B, Null, D J, Hansen, P J. 2016. Use of single nucleotide polymorphisms in candidate genes associated with daughter pregnancy rate for prediction of genetic merit for reproduction in Holstein cows. In Animal genetics, 47, 288-97. doi:10.1111/age.12420. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26923315/
7. Suh, Insoo, Weng, Julie, Fernandez-Ranvier, Gustavo, Clark, Orlo H, Kebebew, Electron. . Antineoplastic effects of decitabine, an inhibitor of DNA promoter methylation, in adrenocortical carcinoma cells. In Archives of surgery (Chicago, Ill. : 1960), 145, 226-32. doi:10.1001/archsurg.2009.292. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20231622/