Lsm4-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Lsm4-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11395

品系全称

C57BL/6JCya-Lsm4em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-50783-Lsm4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Lsm4-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11395) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
LSM4 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated
基因别称
-
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_015816.4 | Ensembl: ENSMUST00000034311
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~2948 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1354692Embryos homozygous for a gene trap mutation in this gene die in the peri-implantation stage.
Lsm4,也称为SM-LIKE PROTEIN 4,是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接、稳定性和翻译。Lsm4在许多生物过程中发挥作用,包括细胞凋亡、自噬、植物免疫反应和肿瘤发生。

在酵母中,Lsm4是LSM复合物的一个组成部分,参与mRNA的脱帽和降解。Lsm4的缺失会导致细胞凋亡和自噬缺陷。研究发现,酵母中的Lsm4突变体表现出细胞凋亡的典型标记,如活性氧(ROS)的产生和氧化RNA的积累。此外,Lsm4突变体在氮饥饿或低剂量的雷帕霉素处理下对自噬过程敏感,并在氮饥饿和衰老过程中积累细胞质自噬相关结构。这表明Lsm4在自噬过程的后期步骤中发挥作用[1]。

在植物中,Lsm4参与调控RNA的剪接和稳定性。研究发现,Lsm4的精氨酸甲基化在植物对生物和非生物胁迫的响应中发挥重要作用。Lsm4的精氨酸甲基化影响选择性剪接,特别是在与胁迫响应相关的基因中。野生型Lsm4和无法进行甲基化的Lsm4突变体可以互补Lsm4-1突变体,表明甲基化对于正常环境下的生长并不是必需的。然而,在非生物胁迫下,Lsm4的甲基化水平增加,并且对于植物在胁迫条件下的生长是必要的。相反,细菌感染会降低Lsm4的甲基化水平,而表达无法进行甲基化的Lsm4的植物比表达野生型Lsm4的植物对假单胞菌的抵抗力更强。这表明精氨酸甲基化以相反的方式调整Lsm4在mRNA剪接中的作用,以响应生物和非生物胁迫[2]。

在人类中,Lsm4的过度表达与多种癌症的发生和进展相关。研究发现,在肝细胞癌(HCC)组织中,Lsm4的表达水平升高。高表达的Lsm4与HCC的临床分期、肿瘤分级和淋巴结转移状态相关。此外,高表达的Lsm4与HCC患者的总生存期(OS)较差相关。Lsm4的过度表达可能通过调节细胞周期、细胞黏附和代谢相关途径来促进HCC细胞的生长和转移[3]。

此外,研究发现长链非编码RNA(lncRNA)LINC01419通过miR-485-5p/LSM4轴促进HCC的恶性行为。LINC01419和LSM4在HCC组织和细胞中表达上调,而miR-485-5p的表达下调。LINC01419通过海绵作用抑制miR-485-5p的表达,从而上调LSM4的表达。这表明LINC01419和LSM4在HCC的发生和进展中发挥重要作用[4]。

在植物中,Lsm4与植物免疫反应相关。研究发现,拟南芥中的AtMC1与Lsm4相互作用,共同调节植物对细菌病原体的免疫反应。AtMC1和Lsm4蛋白水平在共表达时增加,与单独表达相比。AtMC1和Lsm4都负向调节植物对番茄青枯菌DC3000感染的免疫反应。RNA测序分析表明,AtMC1可以调节许多pre-mRNA的剪接,包括4CL3,它是植物免疫反应的负调节因子。这表明AtMC1通过调节pre-mRNA的剪接来调节植物免疫反应[5]。

综上所述,Lsm4是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的剪接、稳定性和翻译。Lsm4在细胞凋亡、自噬、植物免疫反应和肿瘤发生中发挥重要作用。Lsm4的过度表达与多种癌症的发生和进展相关,包括肝细胞癌和乳腺癌。此外,Lsm4的精氨酸甲基化在植物对生物和非生物胁迫的响应中发挥重要作用。Lsm4的研究有助于深入理解RNA的剪接和稳定性调控机制,以及Lsm4在生物学过程和疾病发生中的作用。

参考文献:
1. Caraba, Benedetta, Stirpe, Mariarita, Palermo, Vanessa, Falcone, Claudio, Mazzoni, Cristina. 2023. Yeast Lsm Pro-Apoptotic Mutants Show Defects in Autophagy. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms241813708. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37762007/
2. Agrofoglio, Yamila Carla, Iglesias, María José, Perez-Santángelo, Soledad, Staiger, Dorothee, Mateos, Julieta L. . Arginine methylation of SM-LIKE PROTEIN 4 antagonistically affects alternative splicing during Arabidopsis stress responses. In The Plant cell, 36, 2219-2237. doi:10.1093/plcell/koae051. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38518124/
3. Chen, Liang, Lin, Yun-Hua, Liu, Guo-Qing, Xie, Jia-Heng, Yu, Hong-Zhu. 2022. Clinical Significance and Potential Role of LSM4 Overexpression in Hepatocellular Carcinoma: An Integrated Analysis Based on Multiple Databases. In Frontiers in genetics, 12, 804916. doi:10.3389/fgene.2021.804916. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35096017/
4. Sun, Zeng-Peng, Tan, Zhi-Guo, Peng, Chuang. 2022. Long noncoding RNA LINC01419 promotes hepatocellular carcinoma malignancy by mediating miR-485-5p/LSM4 axis. In The Kaohsiung journal of medical sciences, 38, 826-838. doi:10.1002/kjm2.12566. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35748489/
5. Wang, Shune, Xue, Mei, He, Chan, Zhao, Hongwei, Niu, Dongdong. 2021. AtMC1 Associates With LSM4 to Regulate Plant Immunity Through Modulating Pre-mRNA Splicing. In Molecular plant-microbe interactions : MPMI, 34, 1423-1432. doi:10.1094/MPMI-07-21-0197-R. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34515495/