Krtap5-4-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Krtap5-4-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-11389

品系全称

C57BL/6JCya-Krtap5-4em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-50775-Krtap5-4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Krtap5-4-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-11389) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
keratin associated protein 5-4
基因别称
-
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_015809.2 | Ensembl: ENSMUST00000061403
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1510 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Krtap5-4,也称为Keratin-associated protein 5-4,是羊毛纤维中的一种主要结构成分——角蛋白相关蛋白(KAPs)家族中的一员。KAPs与角蛋白纤维结合,对羊毛的物理性质,如细度、光泽、弹性和抗张强度等,具有重要影响。Krtap5-4基因的变异可能导致KAPs结构的改变,从而影响羊毛的特性。

在研究Krtap5-4基因的变异方面,有研究利用PCR-SSCP技术分析了绵羊KRTAP5-4基因的变异情况。研究发现,在250只绵羊中,检测到了5种不同的PCR-SSCP模式。每只羊要么表现出一种模式,要么是两种模式的组合,这与这些羊在该位点要么是纯合子要么是杂合子相一致。DNA测序表明,这些模式代表了5种不同的DNA序列。其中一种序列与已发表的绵羊KRTAP5-4序列相同。其余四种序列是独特的,但与已发表的绵羊KRTAP5-4序列具有高度同源性,表明这些序列代表KRTAP5-4的等位基因变异体。这些序列中总共有六个单核苷酸多态性(SNPs)和一个长度多态性。在编码区发现的五个SNPs中,有四个是非同义SNPs,这将导致氨基酸的改变。长度多态性会影响推定的肽中的半胱氨酸含量,这与SNPs一起可能影响KAP5-4的结构,从而影响羊毛性状[1]。

除了对Krtap5-4基因的变异研究,还有研究探讨了长链非编码RNA(lncRNA)在羊毛生长和细度调节中的作用。研究发现,在甘肃高山细毛羊中,细毛型羊毛纤维的鳞片分布更规则,鳞片间距较大,边缘光滑,而粗毛型羊毛纤维的鳞片排列更不规则,边缘相对较粗糙,羊毛鳞片的密度也大于细毛型羊毛。此外,研究还发现,与粗毛型和细毛型羊毛相关的皮肤组织中,有164个差异表达的lncRNAs和146个与之相关的潜在靶基因。功能富集分析表明,一些靶基因可能与羊毛细度的改善有关,如FOXN1、LIPK、LOC101116068、LOC101106296、KRTAP5.4、KRT71、KRT82、DNASE1L2,这些基因与毛囊发育、组氨酸代谢、表皮细胞分化和氧化磷酸化过程相关。此外,lncRNA-mRNA的互作网络表明,某些lncRNAs可能在羊毛生长和细度改善过程中发挥重要作用[2]。

除了羊毛特性,Krtap5-4基因在其他生物学过程中也具有重要意义。例如,研究发现,血清外泌体中的长RNA(包括mRNA和lncRNA)在结直肠癌的诊断中具有潜在的应用价值。在结直肠癌患者和健康受试者的血清中,检测到了79种癌症相关长RNA,其中包括KRTAP5-4。研究发现,外泌体中的mRNA和lncRNA可以作为结直肠癌的潜在生物标志物。此外,KRTAP5-4与其他基因如MAGEA3和BCAR4的组合,可能成为检测结直肠癌的潜在候选基因[3]。

综上所述,Krtap5-4基因作为羊毛纤维中的一种重要结构成分,其变异对羊毛的特性具有重要影响。同时,Krtap5-4基因在其他生物学过程中也具有重要意义,如参与毛囊发育、组氨酸代谢等过程。因此,深入研究Krtap5-4基因的功能和调控机制,对于改善羊毛性状和探索其在其他生物学过程中的作用具有重要意义。

参考文献:
1. Gong, Hua, Zhou, Huitong, Plowman, Jeffrey E, Dyer, Jolon M, Hickford, Jon G H. . Analysis of variation in the ovine ultra-high sulphur keratin-associated protein KAP5-4 gene using PCR-SSCP technique. In Electrophoresis, 31, 3545-7. doi:10.1002/elps.201000301. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20872415/
2. He, Zhaohua, Zhao, Fangfang, Sun, Hongxian, Liu, Feiyan, Li, Shaobin. 2025. Screened of long non-coding RNA related to wool development and fineness in Gansu alpine fine-wool sheep. In BMC genomics, 26, 8. doi:10.1186/s12864-024-11195-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39762742/
3. Dong, Lei, Lin, Wanrun, Qi, Peng, Zhou, Xiaoyan, Du, Xiang. 2016. Circulating Long RNAs in Serum Extracellular Vesicles: Their Characterization and Potential Application as Biomarkers for Diagnosis of Colorectal Cancer. In Cancer epidemiology, biomarkers & prevention : a publication of the American Association for Cancer Research, cosponsored by the American Society of Preventive Oncology, 25, 1158-66. doi:10.1158/1055-9965.EPI-16-0006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27197301/