Bend3-flox 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Bend3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10734

品系全称

C57BL/6JCya-Bend3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-331623-Bend3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Bend3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10734) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
BEN domain containing 3
基因别称
mKIAA1553
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_199028 | Ensembl: ENSMUST00000167488
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
BEND3是一种含有四个BEN(BANP, E5R和Nac1)结构域的蛋白质,在哺乳动物基因表达调控中发挥着重要作用。BEND3能够与异染色质结合,并作为转录抑制因子发挥作用。在多能性细胞中,BEND3的表达水平较高,而在分化过程中则会被下调。BEND3通过与分化相关基因的启动子结合,并通过增强H3K27me3修饰来抑制这些基因的表达,从而维护细胞的多能性并防止分化[4]。此外,BEND3还能够与多梳抑制复合物2(PRC2)相互作用,共同调控基因表达和染色质组织[6]。

研究表明,BEND3在细胞分化过程中发挥着关键作用。BEND3能够结合到含有CpG岛(CGI)的调节元件上,并且其与DNA结合的结构基础已经通过共晶体结构得到了揭示[1]。在BEND3缺失的小鼠胚胎干细胞(ESCs)中,数百个含有CGI的二价基因被过早激活,这表明BEND3对于维持H3K27me3的高水平在ESCs中具有重要作用,以防止这些基因在发育阶段的过早激活[1]。BEND3还能够通过与PRC2的结合,稳定PRC2在二价基因上的存在,进一步抑制基因的表达[1]。

除了直接调控基因表达外,BEND3还参与了全局DNA甲基化的调节。BEND3的缺失会导致全基因组DNA甲基化的增加,特别是在通常由TET酶保护的区域。在BEND3突变的细胞中,DNA羟甲基化水平降低,这可能是因为基因表达的改变导致α-酮戊二酸的产生减少,从而降低TET酶的活性[2]。

BEND3还与rDNA的转录抑制有关。BEND3能够定位到核仁,并与rRNA基因启动子结合,帮助抑制rRNA基因的转录。BEND3与核仁重塑复合物(NoRC)相关联,并通过与去泛素化酶USP21的相互作用稳定NoRC成分TTF-1相互作用蛋白5,从而协调rDNA沉默的建立[5]。

在癌症发展中,BEND3的作用也引起了研究者的关注。BEND3可能作为肿瘤抑制因子或致癌基因发挥作用,并且其与p21的相互作用可能在其致癌作用中发挥重要作用[3]。此外,BEND3与染色质修饰因子NuRD和NoRC的相互作用以及其在PRC2招募中的作用也表明其在癌症发展中的潜在作用[3]。

综上所述,BEND3是一种重要的转录因子,参与调控基因表达、染色质组织和DNA甲基化。BEND3在细胞分化、发育和癌症发展等生物学过程中发挥着重要作用。对于BEND3的深入研究将有助于我们更好地理解基因表达调控的机制,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhang, Jing, Zhang, Yan, You, Qinglong, Xu, Rui-Ming, Zhu, Bing. 2022. Highly enriched BEND3 prevents the premature activation of bivalent genes during differentiation. In Science (New York, N.Y.), 375, 1053-1058. doi:10.1126/science.abm0730. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35143257/
2. Yakhou, Lounis, Azogui, Anaelle, Gupta, Nikhil, Ito, Takashi, Defossez, Pierre-Antoine. . A genetic screen identifies BEND3 as a regulator of bivalent gene expression and global DNA methylation. In Nucleic acids research, 51, 10292-10308. doi:10.1093/nar/gkad719. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37650637/
3. Naiyer, Sarah, Dwivedi, Lalita, Singh, Nishant, Mohan, Vijay, Kamran, Mohammad. 2023. Role of Transcription Factor BEND3 and Its Potential Effect on Cancer Progression. In Cancers, 15, . doi:10.3390/cancers15143685. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37509346/
4. Kurniawan, Fredy, Chetlangia, Neha, Kamran, Mohammad, Prasanth, Kannanganattu V, Prasanth, Supriya G. . BEND3 safeguards pluripotency by repressing differentiation-associated genes. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 119, . doi:10.1073/pnas.2107406119. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35217604/
5. Khan, Abid, Giri, Sumanprava, Wang, Yating, Prasanth, Kannanganattu V, Prasanth, Supriya G. 2015. BEND3 represses rDNA transcription by stabilizing a NoRC component via USP21 deubiquitinase. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112, 8338-43. doi:10.1073/pnas.1424705112. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26100909/
6. Kurniawan, Fredy, Prasanth, Supriya G. 2022. A BEN-domain protein and polycomb complex work coordinately to regulate transcription. In Transcription, 13, 82-87. doi:10.1080/21541264.2022.2105128. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35904285/