Prpf39-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Prpf39-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10559

品系全称

C57BL/6JCya-Prpf39em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-328110-Prpf39-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Prpf39-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10559) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
pre-mRNA processing factor 39
基因别称
Srcs1
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_177806.3 | Ensembl: ENSMUST00000120580
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4
敲除长度
~619 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Prpf39(pre-mRNA processing factor 39)是一种在真核生物中发现的RNA剪接因子,它在剪接体组装和剪接过程中发挥重要作用。Prpf39属于剪接体U1小核核糖核蛋白(snRNP)复合物的一部分,U1 snRNP负责5'剪接位点的识别。在酵母中,Prp39/Prp42异源二聚体是剪接体组装的早期步骤中必不可少的,但在多细胞生物中,Prp42的同源基因不存在,Prpf39以同源二聚体的形式存在。Prpf39的表达受NMD(无义介导的mRNA降解)诱导的替代剪接的控制,这表明它在适应细胞类型特异性需求方面可能发挥着重要作用。此外,进化分析显示,缩短的U1 snRNA和Prp42的缺失与不同真菌中整体剪接复杂性相关,这表明Prpf39可能通过替代Prp39/Prp42异源二聚体,使得具有更高剪接复杂性的生物体能够保持其剪接效率[1]。

Prpf39在多种生物学过程中发挥作用,包括剪接、细胞分化和发育。Prpf39的异常表达与多种疾病的发生发展相关,例如癌症和神经退行性疾病。例如,在膀胱癌中,Prpf39的表达与肿瘤的免疫微环境和免疫治疗密切相关,这表明Prpf39可能是一个潜在的膀胱癌生物标志物[2]。在神经母细胞瘤中,Prpf39的表达上调与不良预后相关,这表明Prpf39可能是一个潜在的神经母细胞瘤生物标志物[3]。

除了剪接之外,Prpf39还可能参与其他生物学过程。例如,研究发现,Prpf39的基因多态性与中国儿童Wilms瘤的易感性降低相关[4]。此外,Prpf39的基因表达变化与多种生物学过程相关,例如细胞周期、细胞死亡、DNA损伤修复和细胞骨架组织[5]。

Prpf39在剪接体组装和剪接过程中发挥重要作用,与多种生物学过程相关,包括剪接、细胞分化和发育。Prpf39的异常表达与多种疾病的发生发展相关,例如癌症和神经退行性疾病。此外,Prpf39还可能参与其他生物学过程,例如基因表达调控和DNA损伤修复。因此,Prpf39是一个重要的生物学研究对象,其研究有助于深入理解剪接和基因表达调控的机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. De Bortoli, Francesca, Neumann, Alexander, Kotte, Ana, Loll, Bernhard, Heyd, Florian. . Increased versatility despite reduced molecular complexity: evolution, structure and function of metazoan splicing factor PRPF39. In Nucleic acids research, 47, 5867-5879. doi:10.1093/nar/gkz243. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30949712/
2. Li, Xinyun, Yang, Lin, Huang, Wei, Jia, Bo, Lai, Yu. 2022. Immunological significance of alternative splicing prognostic signatures for bladder cancer. In Heliyon, 8, e08994. doi:10.1016/j.heliyon.2022.e08994. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35243106/
3. Ye, Fan, Wu, Pingan, Zhu, Yaqiong, Liao, Zhencheng, Guan, Yafeng. 2022. Construction of the prognostic signature of alternative splicing revealed the prognostic predictor and immune microenvironment in head and neck squamous cell carcinoma. In Frontiers in genetics, 13, 989081. doi:10.3389/fgene.2022.989081. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36338975/
4. Cousminer, Diana L, Wagley, Yadav, Pippin, James A, Hankenson, Kurt D, Grant, Struan F A. 2021. Genome-wide association study implicates novel loci and reveals candidate effector genes for longitudinal pediatric bone accrual. In Genome biology, 22, 1. doi:10.1186/s13059-020-02207-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33397451/