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Samd5-flox 基因敲除小鼠

Samd5-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Samd5-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10506

品系全称

C57BL/6JCya-Samd5em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-320825-Samd5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Samd5-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10506) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
sterile alpha motif domain containing 5
基因别称
E130306M17Rik
染色体号
Chr 10 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_177271.3 | Ensembl: ENSMUST00000100070
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~719 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
基因SAMD5，也称为Sterile Alpha Motif Domain-Containing 5，是一种编码包含 sterile alpha motif (SAM) 结构域的蛋白质的基因。SAM结构域是一种蛋白质-蛋白质相互作用模块，常见于多种蛋白质中，包括信号转导分子、转录因子和RNA结合蛋白。SAMD5的表达和功能与多种生物学过程有关，包括细胞增殖、分化和凋亡，以及疾病的发生和发展。

在前列腺癌中，SAMD5 mRNA的表达水平升高，并且与术后生化复发（BCR）的风险增加相关[1]。研究发现，SAMD5 mRNA的表达水平可以作为预测术后BCR的独立预后因素，其高表达与不良预后相关。此外，SAMD5 mRNA的表达水平在其他类型的癌症中也存在差异，表明其可能具有更广泛的生物学功能。

在颅底脊索瘤中，SAMD5基因融合（SAMD5-SASH1）首次被发现，并且与脊索瘤的进展相关[2]。脊索瘤是一种罕见的恶性骨源性肿瘤，目前尚无有效的预后或治疗生物标志物。SAMD5-SASH1基因融合的发现为脊索瘤的分子机制研究提供了新的线索，并可能为脊索瘤的治疗提供新的靶点。

在乳腺癌中，SAMD5的表达水平与肿瘤的恶性表型相关，SAMD5的表达水平降低与肿瘤的恶性程度增加相关[3]。SAMD5在乳腺癌中的作用可能与Polo样激酶1（PLK1）和c-Myc信号通路相关，SAMD5的表达水平降低可能导致PLK1和c-Myc信号通路的激活，从而促进肿瘤的发生和发展。

在胶质瘤中，SAMD5是16个与胶质瘤预后相关的基因之一[4]。通过对WHO II/III级胶质瘤患者的基因表达数据进行分析，发现SAMD5的表达水平与胶质瘤的预后相关，SAMD5的表达水平可以作为预测胶质瘤预后的生物标志物。

在神经母细胞瘤中，SAMD5基因融合（SAMD5-SASH1）也被发现，并且与高肿瘤突变负荷（TMB）相关[5]。高TMB与神经母细胞瘤的不良预后相关，因此SAMD5基因融合可能成为神经母细胞瘤治疗的潜在靶点。

在膀胱癌中，SAMD5的表达水平与膀胱癌的进展相关[6]。研究发现，SAMD5的表达水平可以通过miR-3194-3p信号通路进行调控，SAMD5的表达水平升高可以抑制膀胱癌细胞的增殖、迁移和侵袭。

在慢性阻塞性肺病（COPD）中，SAMD5的表达水平与肺功能相关[7]。研究发现，SAMD5的表达水平可以通过RNA结合蛋白AZGP1进行调控，AZGP1的表达水平升高可以抑制SAMD5的表达，从而抑制肺泡上皮细胞的增殖和粘附。

在青光眼的研究中，SAMD5的表达水平与青光眼的发病机制相关[8]。研究发现，SAMD5的表达水平可以通过转录因子PITX2进行调控，PITX2的表达水平降低可以导致SAMD5的表达水平升高，从而影响青光眼的发病机制。

在抑郁症的研究中，SAMD5的表达水平与抑郁症的发生和发展相关[9]。研究发现，SAMD5的表达水平在抑郁症患者中存在差异，SAMD5的表达水平可以作为抑郁症的潜在生物标志物。

综上所述，SAMD5是一种具有多种生物学功能的基因，其表达和功能与多种疾病的发生和发展相关。SAMD5的表达水平可以作为多种癌症的预后生物标志物，其基因融合可能与某些癌症的发生和发展相关。此外，SAMD5的表达水平还与慢性阻塞性肺病、青光眼和抑郁症的发生和发展相关。因此，深入研究SAMD5的功能和作用机制对于理解疾病的发病机制和开发新的治疗方法具有重要意义。

参考文献：
1. Li, Fei, Xu, Yong, Liu, Ran-Lu. 2019. SAMD5 mRNA was overexpressed in prostate cancer and can predict biochemical recurrence after radical prostatectomy. In International urology and nephrology, 51, 443-451. doi:10.1007/s11255-019-02096-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30739268/
2. Sa, Jason K, Lee, In-Hee, Hong, Sang Duk, Kong, Doo-Sik, Nam, Do-Hyun. . Genomic and transcriptomic characterization of skull base chordoma. In Oncotarget, 8, 1321-1328. doi:10.18632/oncotarget.13616. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27901492/
3. Tuo, YouLin, Ye, YiFeng. 2024. Sterile Alpha Motif Domain-Containing 5 Suppresses Malignant Phenotypes and Tumor Growth in Breast Cancer: Regulation of Polo-Like Kinase 1 and c-Myc Signaling in a Xenograft Model. In Cureus, 16, e73259. doi:10.7759/cureus.73259. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39524172/
4. Wu, Ya Meng, Sa, Yu, Guo, Yu, Li, Qi Feng, Zhang, Ning. . Identification of WHO II/III Gliomas by 16 Prognostic-related Gene Signatures using Machine Learning Methods. In Current medicinal chemistry, 29, 1622-1639. doi:10.2174/0929867328666210827103049. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34455959/
5. Lee, Eunjin, Lee, Ji Won, Lee, Boram, Sung, Ki Woong, Park, Woong-Yang. 2020. Genomic profile of MYCN non-amplified neuroblastoma and potential for immunotherapeutic strategies in neuroblastoma. In BMC medical genomics, 13, 171. doi:10.1186/s12920-020-00819-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33172452/
6. Chen, Yong-Sheng, Xu, Yong-Peng, Liu, Wen-Hua, Wang, Huan, Li, Chang-Fu. 2021. Long Noncoding RNA KCNMB2-AS1 Promotes SMAD5 by Targeting miR-3194-3p to Induce Bladder Cancer Progression. In Frontiers in oncology, 11, 649778. doi:10.3389/fonc.2021.649778. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34026626/
7. Yang, Xiaolin, Li, Yanchun, Bao, Dapeng, Liu, Xiaoxi, He, Zihong. 2023. Genotype-Phenotype Models Predicting V̇O 2max Response to High-Intensity Interval Training in Physically Inactive Chinese. In Medicine and science in sports and exercise, 55, 1905-1912. doi:10.1249/MSS.0000000000003204. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37170954/
8. Shen, Wen, Wei, Wei, Wang, Shukun, Wang, Ruili, Tian, Hong. 2024. RNA-binding protein AZGP1 inhibits epithelial cell proliferation by regulating the genes of alternative splicing in COPD. In Gene, 927, 148736. doi:10.1016/j.gene.2024.148736. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38950687/
9. Paylakhi, Seyed Hassan, Fan, Jian-Bing, Mehrabian, Mohadeseh, Ronaghi, Mostafa, Elahi, Elahe. 2011. Effect of PITX2 knockdown on transcriptome of primary human trabecular meshwork cell cultures. In Molecular vision, 17, 1209-21. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21617755/

资料下载

S-CKO-10506_6J_320825_Samd5_Exon 1_A_strategy.pdf
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