Iffo1-flox 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Iffo1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10479

品系全称

C57BL/6JCya-Iffo1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-320678-Iffo1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Iffo1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10479) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
intermediate filament family orphan 1
基因别称
4733401N06Rik,A930037G23Rik,HOM-TES-103,Iffo
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001039669 | Ensembl: ENSMUST00000117675
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
IFFO1,全称为Integrator Subunit 12,是一种在细胞核中表达的蛋白质。它属于整合子复合物的一部分,整合子复合物是一个多亚基的核糖核蛋白复合物,在转录后调控过程中发挥着关键作用,包括前体信使RNA(pre-mRNA)的剪接和3'端加工。IFFO1在细胞核中与多种蛋白质相互作用,参与调节基因表达和维持基因组稳定性。它在DNA损伤修复、细胞周期调控和染色质重塑等方面发挥着重要作用[6]。

在肝癌研究中,IFFO1被确定为一种关键的差异表达基因(DEG)。研究发现,在肝癌组织与正常组织之间,IFFO1的表达水平存在显著差异。基于机器学习分析框架,研究者们构建了基于这5个关键DEGs的分类器,该分类器在识别肝癌方面表现出了近乎完美的性能[1]。这一发现为肝癌的早期诊断和治疗提供了新的思路和策略。

此外,研究发现IFFO1在DNA损伤修复过程中发挥重要作用。IFFO1能够与XRCC4蛋白形成异源四聚体,并被招募到DNA损伤位点。它通过促进DNA双链断裂的修复,在肿瘤发生过程中抑制染色体易位。当IFFO1或其与XRCC4的相互作用被抑制时,断裂末端的移动性增加,染色体易位的发生频率也增加[2]。这表明IFFO1在维持基因组稳定性和抑制肿瘤发生方面发挥着重要作用。

在卵巢癌研究中,IFFO1启动子甲基化(IFFO1-M)被发现是一种潜在的血液生物标志物。研究发现,IFFO1-M在卵巢癌组织中频繁发生甲基化,而在正常对照样本中很少检测到。当在卵巢癌患者中测试IFFO1-M时,其表达水平与血清CA-125水平呈显著相关性,表明IFFO1-M可能是一种敏感的卵巢癌检测生物标志物[3]。

此外,在阿尔茨海默病(AD)研究中,IFFO1的罕见变异与神经元损伤和炎症相关。研究发现,IFFO1的罕见变异与AD中神经元损伤和炎症的生物标志物(如NfL和YKL-40)相关。这表明IFFO1在AD的发病机制中可能发挥着重要作用,并可能通过改变细胞骨架结构和免疫活动抑制来增加痴呆风险[4]。

在Keloid研究中,IFFO1被发现是Keloid组织与正常皮肤组织之间差异甲基化的基因之一。研究发现,Keloid组织中IFFO1的表达水平较正常皮肤组织降低。这表明IFFO1在Keloid的发生和发展过程中可能发挥着重要作用[5]。

在非小细胞肺癌(NSCLC)研究中,IFFO1被发现是DNA甲基化与长链非编码RNA(lncRNA)/mRNA表达相关的基因之一。研究发现,IFFO1的甲基化水平与基因表达呈显著相关性。这表明IFFO1的甲基化可能影响NSCLC中的基因表达和生物学过程[9]。

在子宫内膜癌(EC)研究中,IFFO1被发现与免疫浸润水平相关。研究发现,IFFO1的表达水平与多种免疫细胞类型的浸润水平呈显著相关性,并可能影响EC的预后。这表明IFFO1在EC的免疫微环境中发挥着重要作用,并可能成为潜在的免疫治疗靶点[7]。

在非功能性非侵袭性垂体腺瘤(NFPAs)研究中,IFFO1被发现与肿瘤的侵袭性和预后相关。研究发现,IFFO1的表达水平与非侵袭性NFPAs患者的预后相关。这表明IFFO1在NFPAs的发生和发展过程中可能发挥着重要作用,并可能成为潜在的预后标志物和治疗方法[8]。

综上所述,IFFO1在多种癌症和神经退行性疾病中发挥着重要作用。它在DNA损伤修复、细胞周期调控、染色质重塑和免疫微环境等方面发挥着重要作用。IFFO1的研究有助于深入理解这些生物学过程和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Yongjun, Zhang, Heping, Xu, Yuqing, Yeh, Matthew M, Zhang, Zhengjun. 2023. Five Critical Gene-Based Biomarkers With Optimal Performance for Hepatocellular Carcinoma. In Cancer informatics, 22, 11769351231190477. doi:10.1177/11769351231190477. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37577174/
2. Li, Wen, Bai, Xiuzhen, Li, Jun, Liu, Yingfang, Xu, Dongyi. 2019. The nucleoskeleton protein IFFO1 immobilizes broken DNA and suppresses chromosome translocation during tumorigenesis. In Nature cell biology, 21, 1273-1285. doi:10.1038/s41556-019-0388-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31548606/
3. Campan, Mihaela, Moffitt, Melissa, Houshdaran, Sahar, Pearce, Celeste L, Laird, Peter W. 2011. Genome-scale screen for DNA methylation-based detection markers for ovarian cancer. In PloS one, 6, e28141. doi:10.1371/journal.pone.0028141. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22163280/
4. Neumann, Alexander, Küçükali, Fahri, Bos, Isabelle, van Broeckhoven, Christine, Sleegers, Kristel. 2022. Rare variants in IFFO1, DTNB, NLRC3 and SLC22A10 associate with Alzheimer's disease CSF profile of neuronal injury and inflammation. In Molecular psychiatry, 27, 1990-1999. doi:10.1038/s41380-022-01437-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35173266/
5. Jones, Lamont R, Greene, Joshua, Chen, Kang Mei, Datta, Indrani, Worsham, Maria J. 2016. Biological significance of genome-wide DNA methylation profiles in keloids. In The Laryngoscope, 127, 70-78. doi:10.1002/lary.26063. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27312686/
6. Cabello-Lobato, Maria Jose, Jenner, Matthew, Cisneros-Aguirre, Metztli, Cliff, Matthew J, Schmidt, Christine K. . Microarray screening reveals two non-conventional SUMO-binding modules linked to DNA repair by non-homologous end-joining. In Nucleic acids research, 50, 4732-4754. doi:10.1093/nar/gkac237. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35420136/
7. Guo, Chengbin, Tang, Yuqin, Zhang, Yongqiang, Li, Gen. 2021. Mining TCGA Data for Key Biomarkers Related to Immune Microenvironment in Endometrial cancer by Immune Score and Weighted Correlation Network Analysis. In Frontiers in molecular biosciences, 8, 645388. doi:10.3389/fmolb.2021.645388. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33869285/
8. Aydin, Busra, Arga, Kazim Yalcin. 2019. Co-expression Network Analysis Elucidated a Core Module in Association With Prognosis of Non-functioning Non-invasive Human Pituitary Adenoma. In Frontiers in endocrinology, 10, 361. doi:10.3389/fendo.2019.00361. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31244774/
9. Feng, Nannan, Wang, Yu, Zheng, Min, Garmire, Lana, Qian, Biyun. 2017. Genome-wide analysis of DNA methylation and their associations with long noncoding RNA/mRNA expression in non-small-cell lung cancer. In Epigenomics, , . doi:10.2217/epi-2016-0120. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28111977/