Ccdc169-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ccdc169-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10467

品系全称

C57BL/6JCya-Ccdc169em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-320604-Ccdc169-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ccdc169-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10467) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
coiled-coil domain containing 169
基因别称
A730037C10Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_177203.3 | Ensembl: ENSMUST00000061099
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~734 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
CCDC169,全称为Coiled-coil domain containing 169,是一种在人类基因组中编码的蛋白质。CCDC169基因位于染色体13上,特别是在13q13区域,与一些癌症的预后和血栓形成相关。该基因编码的蛋白质包含卷曲螺旋结构域,这一结构域通常与蛋白质间的相互作用有关,并可能参与多种生物学过程。CCDC169在正常细胞功能和癌症进展中的作用尚不完全清楚,但已有研究揭示了其在特定癌症类型中的重要性。

在胃癌中,CCDC169基因的突变与患者的预后密切相关。一项研究使用两个数据集作为训练和验证队列,建立了预测模型,并利用cBioportal网站提供的背景分析、通路分析和功能分析进行了筛选。通过Fisher精确检验和多变量逻辑回归,研究者筛选出与胃癌复发高度相关的五个基因,包括CCDC169-SOHLH2。ROC曲线分析表明,这五个基因的突变对预测复发的影响显著高于其他因素,如年龄、分期、病史等。此外,Kaplan-Meier生存分析显示,这五个基因的突变与患者生存期呈正相关,突变患者可能比未突变患者拥有更长的生存期。这一五基因面板可能成为评估胃癌预后的实用工具,并为临床医生制定治疗方案提供新的依据[1]。

另一项研究旨在确定与晚期胃癌相关的血栓形成基因。研究者设计了一项巢式病例对照研究,使用AGAMENON国家晚期胃癌登记处的队列数据。在静脉血栓栓塞和未发生血栓栓塞的患者之间进行倾向评分匹配,以调整混杂因素。在劳伦氏亚型中,共确定了15个与血栓形成相关的基因,其中CCDC169在血栓形成患者中表达下调。这些基因的发现为预测晚期胃癌患者的血栓形成风险提供了新的线索,并为未来的临床模型提供了补充[2]。

此外,还有研究表明,在染色体非整倍性的情况下,CCDC169基因的表达会显著上调。通过微细胞介导的染色体转移,研究者使人类结直肠癌细胞系DLD-1获得了额外的染色体13。结果发现,染色体13上基因的表达水平显著上调,特别是位于13q13区域的基因簇,其中包括CCDC169。这表明CCDC169基因的表达可能与染色体的复制数密切相关,并可能影响癌症细胞的整体转录组[3]。

最后,CCDC169基因还被发现与生殖细胞功能相关。在一项关于长期平衡选择的研究中,研究者使用混合模型构建了一系列复合似然比检验统计量,并应用于人类种群基因组数据。结果显示,CCDC169基因与生殖细胞功能相关,并被恢复为之前研究中的候选基因之一。这一发现为进一步研究CCDC169在生殖细胞生物学中的作用提供了依据[4]。

综上所述,CCDC169基因在多种生物学过程中发挥作用,包括癌症预后、血栓形成和生殖细胞功能。在胃癌中,CCDC169基因的突变与患者的预后密切相关,而其表达下调则与血栓形成相关。此外,CCDC169基因的表达还受到染色体非整倍性的影响,并可能参与生殖细胞生物学过程。这些发现为深入研究CCDC169基因的功能和作用机制提供了重要线索,并为相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Li, Shuxin, Mao, Qianqian, Zhang, Zixuan, Chen, Zhenwen, Lu, Jianyi. 2022. Identification of a Five-Gene Panel to Assess Prognosis for Gastric Cancer. In BioMed research international, 2022, 5593619. doi:10.1155/2022/5593619. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35187167/
2. Zaragoza-Huesca, David, Garrido-Rodríguez, Pedro, Jiménez-Fonseca, Paula, Martínez-Martínez, Irene, Carmona-Bayonas, Alberto. 2022. Identification of Thrombosis-Related Genes in Patients with Advanced Gastric Cancer: Data from AGAMENON-SEOM Registry. In Biomedicines, 10, . doi:10.3390/biomedicines10010148. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35052827/
3. Wangsa, Darawalee, Braun, Rüdiger, Stuelten, Christina H, Camps, Jordi, Ried, Thomas. 2019. Induced Chromosomal Aneuploidy Results in Global and Consistent Deregulation of the Transcriptome of Cancer Cells. In Neoplasia (New York, N.Y.), 21, 721-729. doi:10.1016/j.neo.2019.04.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31174021/
4. Cheng, Xiaoheng, DeGiorgio, Michael. . Flexible Mixture Model Approaches That Accommodate Footprint Size Variability for Robust Detection of Balancing Selection. In Molecular biology and evolution, 37, 3267-3291. doi:10.1093/molbev/msaa134. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32462188/