Taf2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Taf2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10364

品系全称

C57BL/6JCya-Taf2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-319944-Taf2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Taf2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10364) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA-box binding protein associated factor 2
基因别称
4732460C16Rik,CIF150,TAF2B,TAFII-150,TAFII150
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081288.1 | Ensembl: ENSMUST00000041733
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~661 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Taf2,也称为TBP-associated factor 2,是转录因子II D(TFIID)复合物的一个关键亚基。TFIID是一个多亚基蛋白质复合物,对RNA聚合酶II介导的转录起始至关重要。Taf2与TBP(TATA-box binding protein)结合,并通过与其他TAF亚基(TBP-associated factors)的相互作用,参与转录的调节和基因表达的控制。

根据Klein等人的研究,Taf2在TFIID复合物中具有特定的功能。Taf14是TFIID复合物中的另一个亚基,它与Taf2之间有特定的相互作用。这些相互作用对于TFIID复合物的组装和功能至关重要。具体来说,Taf14的YEATS和ET结构域与Taf2的C端尾部结合,而连接这两个结构域的连接区域具有独特的DNA结合活性。在没有配体的情况下,Taf14的连接区域被周围的域所遮挡,因此Taf14的DNA结合功能被自身抑制。Taf2的结合促进了Taf14的构象重排,从而释放连接区域与DNA和核小体相互作用。遗传学体内的数据表明,Taf14与Taf2以及DNA的结合对于转录调控是必需的。这些发现为解析TFIID亚基在基因转录中的作用提供了基础[1]。

另一项研究表明,Taf2的双等位基因突变与一种称为Mental retardation, autosomal recessive 40综合征的疾病相关。这种综合征的特点是严重的智力障碍、出生后小头畸形、锥体束征和薄胼胝体。这项研究报道了四个个体,他们来自两个不相关的家庭,表现出严重的智力障碍和全面发育迟缓、出生后小头畸形、足部畸形和薄胼胝体,并携带通过外显子测序检测到的TAF2错义变异。这些发现进一步阐明了与TAF2双等位基因突变相关的临床表型[2]。

Cheng等人的研究发现,TAF2在TFIID复合物中调节一小部分蛋白编码基因的表达。尽管TAF2对于大多数蛋白编码基因是必需的,但越来越多的研究表明,TFIID的一些亚基在基因激活中具有启动子特异性功能。这项研究揭示了TAF2对于TFIID结合到一小部分蛋白编码基因的特定调节作用,对于多种癌细胞系的细胞生长至关重要。此外,通过诱导TAF2降解系统,他们发现TAF2的缺失导致TBP/TFIID结合到一些核糖体基因上的减少。因此,TAF2在TFIID复合物中对于TBP/TFIID结合到和表达一小部分蛋白编码基因具有功能性重要性,从而确立了TAF2的先前未被认识的启动子选择性功能[3]。

Shi等人的一项研究旨在建立一个与端粒相关的基因风险模型,以预测急性髓性白血病(AML)的预后和治疗反应。他们发现TAF2是96个与总体生存期显著相关的端粒相关基因之一。TAF2的表达与AML患者的预后和治疗反应相关。这项研究表明,TAF2在AML的预后和治疗反应中可能具有重要作用[4]。

McDonnell等人的研究发现,雌激素受体(ER)的转录激活功能由TAF1和TAF2两个功能区域介导。这些区域在氨基末端和羧基末端分别位于ER上,显示不同的转录功能。在一些启动子上,TAF1和TAF2对于最大转录活性都是必需的,而在其他启动子上,其他与目标启动子结合的因子可以替代TAF1或TAF2的功能。雌激素通过促进TAF1和TAF2之间的功能性协同作用而发挥ER激动剂的作用。相反,4-OH-tamoxifen抑制TAF2活性并作为拮抗剂发挥作用。这些数据表明,细胞中与ER和TAF区域相互作用的蛋白质的表达变化可以显著影响ER调节剂的药理学[5]。

Scheer等人的研究调查了TAF8在TFIID中的功能和作用。TFIID由TBP和13个TAFs组成,分为三个部分,称为A、B和C。TAF8在TFIID中形成了一个组蛋白折叠对,与TAF10相互作用,并参与将B部分连接到C部分。他们发现TAF8中的不同区域对于TFIID B部分的组装和TAF2的相互作用至关重要。此外,他们还发现TAF8中的5TAF核心相互作用区域和与TAF2相互作用的脯氨酸富集区域对于小鼠胚胎干细胞(ESC)的存活至关重要。因此,他们的研究确定了参与连接TFIID B部分到C部分的TAF8区域,这些区域对于TFIID的功能和ESC的存活至关重要[6]。

Feigerle和Weil的研究发现,Taf2的C端介导了亚基Taf14在酵母TFIID复合物中的稳定结合。通过系统性的定点突变,他们发现12个Taf2温度敏感(ts)等位基因。其中两个等位基因表现出生长缺陷,这些缺陷可以通过过量表达酵母特异性TFIID亚基TAF14来抑制,但不能通过过量表达其他TFIID亚基来抑制。他们还确定了Taf2-Taf14相互作用的区域,并发现了一个Taf2分离功能突变体(Taf2-ΔC),它不再与Taf14相互作用,但稳定地结合到TFIID复合物中。此外,他们还研究了Taf14抑制Taf2ts等位基因的机制,揭示了Taf2-Taf14相互作用对TFIID复合物组织的作用,并提出了Taf14在介导TFIID-染色质相互作用中的潜在作用[7]。

Hellman-Aharony等人报道了一种由TAF2突变引起的常染色体隐性综合征,该综合征的特点是小头畸形、锥体束征、异常胼胝体和智力障碍。他们发现所有受影响的个体都携带TAF2的两个错义突变,p.Thr186Arg和p.Pro416His。他们认为这种综合征是由更保守的突变p.Thr186Arg引起的,而p.Pro416His突变可能进一步降低了蛋白质的功能。然而,尚不清楚这两个突变中的哪一个,或者可能是两者,代表致病性突变[8]。

Papai等人利用部分缺失启动子结合Taf2亚基的TFIID制备,通过电子断层扫描和冷冻电子显微镜确定了TFIID复合物的构象和生化变化。他们发现TFIID复合物具有广泛的构象灵活性,并确定了TFIID亚群的结构模型。此外,他们还确定了Taf2p结合和缺失的TFIID分子亚群,并推断出Taf2p在TBP和Taf1p附近的位置。这项研究为Taf2p在启动子识别中的作用提供了新的见解[9]。

Tzukerman等人的研究评估了人雌激素受体(ER)的转录激活功能,并发现它由TAF1和TAF2两个功能区域介导。他们发现TAF1和TAF2的功能取决于启动子环境;在一些启动子上,TAF1和TAF2激活剂对于野生型转录活性是必需的,而在其他启动子上,TAF1和TAF2激活剂可以独立发挥作用。他们还发现,三苯乙烯衍生的抗雌激素(如他莫昔芬)的拮抗活性源于其内在地不能激活ER TAF2功能。然而,在一些启动子上,这些抗雌激素可以有效地激活基因转录。这些数据表明,ER的TAF1功能可能是主要的转录激活剂,而TAF2功能作为转录促进剂。在一些不需要ER的TAF2功能的启动子环境下,TAF2功能可能由与启动子结合的其他转录因子提供[10]。

综上所述,Taf2在TFIID复合物中具有多种功能。它与TBP结合,并通过与其他TAF亚基的相互作用,参与转录的调节和基因表达的控制。Taf2与Taf14的相互作用对于TFIID复合物的组装和功能至关重要。此外,Taf2的双等位基因突变与一种称为Mental retardation, autosomal recessive 40综合征的疾病相关,而Taf2在TFIID复合物中调节一小部分蛋白编码基因的表达。TAF2的表达与AML患者的预后和治疗反应相关。TAF1和TAF2在人ER中的转录激活功能具有不同的特点。这些研究为我们深入理解Taf2的功能和作用提供了重要的信息,并为进一步研究Taf2在基因转录和疾病发生中的作用奠定了基础。

参考文献:
1. Klein, Brianna J, Feigerle, Jordan T, Zhang, Jibo, Anthony Weil, P, Kutateladze, Tatiana G. 2022. Taf2 mediates DNA binding of Taf14. In Nature communications, 13, 3177. doi:10.1038/s41467-022-30937-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35676274/
2. Lesieur-Sebellin, Marion, Capri, Yline, Grisval, Margot, Faivre, Laurence, Keren, Boris. 2021. Phenotype associated with TAF2 biallelic mutations: A clinical description of four individuals and review of the literature. In European journal of medical genetics, 64, 104323. doi:10.1016/j.ejmg.2021.104323. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34474177/
3. Cheng, I-Hsin, Pi, Wen-Chieh, Hsu, Chung-Hao, Roeder, Robert G, Chen, Wei-Yi. 2024. TAF2, within the TFIID complex, regulates the expression of a subset of protein-coding genes. In Cell death discovery, 10, 244. doi:10.1038/s41420-024-02017-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38773077/
4. Shi, Hui-Zhong, Wang, Ming-Wei, Huang, Yu-Song, Li, Ling, Wan, Li-Ping. 2024. A telomere-related gene risk model for predicting prognosis and treatment response in acute myeloid leukemia. In Heliyon, 10, e31705. doi:10.1016/j.heliyon.2024.e31705. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38845982/
5. McDonnell, D P, Dana, S L, Hoener, P A, Imhof, M O, Stein, R B. . Cellular mechanisms which distinguish between hormone- and antihormone-activated estrogen receptor. In Annals of the New York Academy of Sciences, 761, 121-37. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/7625716/
6. Scheer, Elisabeth, Luo, Jie, Bernardini, Andrea, Ranish, Jeff, Tora, László. 2021. TAF8 regions important for TFIID lobe B assembly or for TAF2 interactions are required for embryonic stem cell survival. In The Journal of biological chemistry, 297, 101288. doi:10.1016/j.jbc.2021.101288. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34634302/
7. Feigerle, Jordan T, Weil, P Anthony. 2016. The C Terminus of the RNA Polymerase II Transcription Factor IID (TFIID) Subunit Taf2 Mediates Stable Association of Subunit Taf14 into the Yeast TFIID Complex. In The Journal of biological chemistry, 291, 22721-22740. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27587401/
8. Hellman-Aharony, Shlomit, Smirin-Yosef, Pola, Halevy, Ayelet, Shohat, Mordechai, Basel-Vanagaite, Lina. 2013. Microcephaly thin corpus callosum intellectual disability syndrome caused by mutated TAF2. In Pediatric neurology, 49, 411-416.e1. doi:10.1016/j.pediatrneurol.2013.07.017. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24084144/
9. Papai, Gabor, Tripathi, Manish K, Ruhlmann, Christine, Weil, P Anthony, Schultz, Patrick. . Mapping the initiator binding Taf2 subunit in the structure of hydrated yeast TFIID. In Structure (London, England : 1993), 17, 363-73. doi:10.1016/j.str.2009.01.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19278651/
10. Tzukerman, M T, Esty, A, Santiso-Mere, D, Pike, J W, McDonnell, D P. . Human estrogen receptor transactivational capacity is determined by both cellular and promoter context and mediated by two functionally distinct intramolecular regions. In Molecular endocrinology (Baltimore, Md.), 8, 21-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8152428/