Podxl2-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Podxl2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10325

品系全称

C57BL/6JCya-Podxl2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-319655-Podxl2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Podxl2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10325) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
podocalyxin-like 2
基因别称
D130074J02Rik,PODLX2
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001347327.2 | Ensembl: ENSMUST00000145944
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1236 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2442488Mice homozygous for a null allele are healthy and exhibit normal kidney morphology and normal nephron lumen and pancreatic lumen formation.
Podxl2(Podocalyxin-like protein 2)是一种重要的细胞表面蛋白,属于podocalyxin家族。Podxl2在多种细胞类型中表达,包括肾脏足细胞、心脏、骨骼肌、上皮细胞和癌细胞等。Podxl2参与细胞粘附、迁移、侵袭和细胞信号传导等生物学过程。

Podxl2在多种癌症中发挥重要作用。例如,在前列腺癌中,Podxl2被证实是一种新的诊断标志物,有助于早期前列腺癌的病理诊断。通过整合分析单细胞和bulk RNA-seq数据,研究人员发现了一个在前列腺癌组织中具有代表性的诊断亚群,并从中提取出24个重叠基因,构建了一个24基因面板。该面板在区分正常和肿瘤前列腺样本方面具有较高的敏感性和特异性,优于目前商业上使用的Oncotype DX基因面板。此外,Podxl2在早期前列腺癌组织中高表达,且比TRPM4和AMACR等病理学上使用的标志物具有更高的敏感性和特异性,因此被认为是一种有前途的新型病理学标志物[1]。

在胆管癌中,Podxl2的表达也与肿瘤的迁移和侵袭能力有关。研究发现,ITGB6基因敲除的胆管癌细胞系中,Podxl2的表达显著下调,细胞迁移和侵袭能力受到抑制。这表明Podxl2可能参与了胆管癌的发生和发展,并可能成为胆管癌的诊断标志物或治疗靶点[2]。

在肺癌中,Podxl2的表达也与患者的预后相关。研究人员通过对肺癌组织样本进行基因组学和转录组学分析,构建了一个包含12个基因的预后签名,其中包括Podxl2。该签名能够预测肺癌患者的预后风险,并为患者分层和治疗提供参考[4]。

此外,Podxl2还与其他基因存在相互作用,共同调控肿瘤的发生和发展。例如,在乳腺癌中,Podxl2与PRLR基因存在DNA甲基化驱动的基因对,与乳腺癌患者的预后相关。此外,Podxl2还与PARP1基因存在突变和拷贝数驱动的基因对,与乳腺癌患者的预后和抗PARP抑制剂治疗敏感性相关[3]。

综上所述,Podxl2是一种重要的细胞表面蛋白,在多种癌症中发挥重要作用。Podxl2的表达与肿瘤的迁移、侵袭和预后相关,并可能成为癌症的诊断标志物或治疗靶点。进一步研究Podxl2的功能机制和与其他基因的相互作用,有助于深入理解癌症的发生和发展,为癌症的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Ma, Xiaoshi, Chen, Lipeng, Chen, Tao, Xiao, Kefeng, Guo, Jinan. 2023. Identification of a 24-gene panel and a novel marker of PODXL2 essential for the pathological diagnosis of early prostate cancer. In Computational and structural biotechnology journal, 21, 5476-5490. doi:10.1016/j.csbj.2023.10.044. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38022698/
2. Soejima, Yurie, Takeuchi, Miho, Miyamoto, Nao, Sawabe, Motoji, Fukusato, Toshio. 2021. ITGB6-Knockout Suppresses Cholangiocarcinoma Cell Migration and Invasion with Declining PODXL2 Expression. In International journal of molecular sciences, 22, . doi:10.3390/ijms22126303. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34208313/
3. Wang, Li, Yu, Lei, Shi, Jian, Ning, Shangwei, Zhao, Hongying. 2022. Functional regulations between genetic alteration-driven genes and drug target genes acting as prognostic biomarkers in breast cancer. In Scientific reports, 12, 10641. doi:10.1038/s41598-022-13835-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35739271/
4. Zengin, Talip, Önal-Süzek, Tuğba. 2020. Analysis of genomic and transcriptomic variations as prognostic signature for lung adenocarcinoma. In BMC bioinformatics, 21, 368. doi:10.1186/s12859-020-03691-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32998690/