Pgbd1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pgbd1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10272

品系全称

C57BL/6JCya-Pgbd1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-319207-Pgbd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pgbd1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10272) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
piggyBac transposable element derived 1
基因别称
4921509E05Rik
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001162919.1 | Ensembl: ENSMUST00000099719
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~1120 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
PGBD1,即PiggyBac转座元件衍生的1,是一个独特的哺乳动物基因,由PiggyBac转座元件衍生而来。PGBD1基因在人类大脑某些区域中高度表达,其表达模式表明其与大脑功能有关,并且可能与精神疾病有关,例如精神分裂症。PGBD1基因的序列保留了原始DNA转座子的大部分,同时还捕获了SCAN和KRAB结构域。尽管保留了基因本体,但PGBD1已经失去了转座能力,因此转座酶功能不存在。PGBD1不再识别PiggyBac转座子样反向重复序列,但PGBD1具有DNA结合活性。基因组规模分析表明,PGBD1结合位点在神经元发育相关基因及其周围富集,并与组蛋白激活和抑制标记相关。研究人员关注其中一个被抑制的基因,即长非编码RNA NEAT1,该基因在精神分裂症中失调,是paraspeckles的核心结构RNA。DNA结合实验证实PGBD1在NEAT1启动子和基因本体中具有特异性结合。在神经祖细胞(NPCs)中耗尽PGBD1导致NEAT1/paraspeckles和分化增加。研究人员得出结论,PGBD1已进化为核心调节功能,以维持NPCs。由于paraspeckles是哺乳动物特有的结构,此处呈现的结果展示了罕见的新型基因与同期新结构共同进化的例子[1]。

PGBD1基因在食管癌和肺癌的遗传关联中发挥了作用。研究发现,食管癌和肺癌之间存在显著的遗传相关性。进一步的分析确定了共有的基因位点,包括PGBD1、ZNF323和WNK1。该研究为肺癌和食管癌之间的复杂遗传联系提供了重要见解,并为进一步阐明这两种癌症的遗传基础以及开发预防和治疗策略提供了新的线索和目标[2]。

PGBD1基因在精神分裂症和双相情感障碍的遗传基础中也有所涉及。研究发现,在精神分裂症和双相情感障碍的GWAS中,PGBD1基因区域的遗传标记与疾病存在显著关联。这些发现表明PGBD1基因可能在精神疾病的发病机制中发挥作用,并为理解神经精神疾病提供了新的线索[3]。

PGBD1基因在阿尔茨海默病(AD)的遗传关联中也有所涉及。研究发现,PGBD1基因区域的遗传标记与AD存在显著关联。这些发现表明PGBD1基因可能在AD的发病机制中发挥作用,并为理解AD提供了新的线索[4]。

PGBD1基因在遗传性血色病中的免疫学参数和临床表现中也发挥了作用。研究发现,PGBD1基因区域的单核苷酸多态性(SNPs)与CD8+ T淋巴细胞数量和血色病的严重程度相关。这些发现表明PGBD1基因可能在血色病的发病机制中发挥作用,并为理解血色病提供了新的线索[5]。

综上所述,PGBD1基因在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括神经元发育、精神疾病和遗传性血色病。PGBD1基因的表达和功能与多种疾病的发生和发展相关,包括精神分裂症、双相情感障碍和阿尔茨海默病。此外,PGBD1基因的遗传变异还与血色病的免疫学参数和临床表现相关。这些发现表明PGBD1基因是一个重要的生物学调节因子,在多种疾病的发生和发展中发挥着关键作用。进一步研究PGBD1基因的功能和机制,有助于深入理解这些疾病的发病机制,并为开发新的治疗策略提供重要的理论基础和实验依据。

参考文献:
1. Raskó, Tamás, Pande, Amit, Radscheit, Kathrin, Hurst, Laurence D, Izsvák, Zsuzsanna. . A Novel Gene Controls a New Structure: PiggyBac Transposable Element-Derived 1, Unique to Mammals, Controls Mammal-Specific Neuronal Paraspeckles. In Molecular biology and evolution, 39, . doi:10.1093/molbev/msac175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36205081/
2. Zhang, Dengfeng, Li, Jing, Lu, Tianxing, Li, Shujun, Li, Jianhang. 2024. Illuminating Shared Genetic Associations Between Oesophageal Carcinoma and Pulmonary Carcinoma Risk. In Journal of Cancer, 15, 2412-2423. doi:10.7150/jca.92899. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38495498/
3. Prata, Diana P, Costa-Neves, Bernardo, Cosme, Gonçalo, Vassos, Evangelos. 2019. Unravelling the genetic basis of schizophrenia and bipolar disorder with GWAS: A systematic review. In Journal of psychiatric research, 114, 178-207. doi:10.1016/j.jpsychires.2019.04.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31096178/
4. Bertram, Lars, Tanzi, Rudolph E. . Genome-wide association studies in Alzheimer's disease. In Human molecular genetics, 18, R137-45. doi:10.1093/hmg/ddp406. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19808789/
5. Barton, James C, Barton, J Clayborn, Cruz, Eugénia, Guimarães, João T, Porto, Graça. 2020. Chromosome 6p SNP microhaplotypes and IgG3 levels in hemochromatosis probands with HFE p.C282Y homozygosity. In Blood cells, molecules & diseases, 85, 102461. doi:10.1016/j.bcmd.2020.102461. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32623342/