Pigs-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Pigs-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-10057

品系全称

C57BL/6JCya-Pigsem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-276846-Pigs-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Pigs-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-10057) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis, class S
基因别称
Gm393,Gm689
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_201406.1 | Ensembl: ENSMUST00000048073
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1309 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Pigs,即猪基因,是研究猪遗传学、繁殖育种和疾病防控的重要对象。猪是重要的经济动物,在人类食品供应中占有重要地位。近年来,随着分子生物学和基因组学技术的快速发展,猪基因的研究取得了显著进展,为猪的育种改良和疾病防控提供了新的思路和策略。

在猪基因研究中,HHEX基因被认为是一个重要的候选基因。HHEX基因编码的蛋白质在胚胎发育和器官形成中发挥重要作用。研究发现,HHEX基因启动子区域存在两个单核苷酸多态性(SNPs)位点,分别为rs80901185和rs80934526。在猪中,HHEX基因的表达与体型长度有关,其中Yorkshire猪(TA单倍型)的表达水平显著高于Wuzhishan猪(CG单倍型)。此外,HHEX基因启动子区域的-586至-1bp区域具有最高的活性,TA单倍型的活性显著高于CG单倍型。这些结果表明,HHEX基因可能对猪的体型长度性状有贡献[1]。

BCL2L2基因是B细胞淋巴瘤-2样2基因,在细胞凋亡中发挥重要作用。研究发现,猪BCL2L2基因存在9种选择性剪接(AS)转录本,其中V2和V3转录本在5'非编码区(UTR)与V1转录本存在差异。BCL2L2基因的核心启动子区域位于-1102至-759bp,其中包含多个功能性顺式作用元件,如SP1和C/EBPα结合位点。选择性剪接在5'UTR区域参与基因表达的调控,5'UTR的二级结构可能是V1-3转录本表达差异的原因。此外,每个5'UTR区域存在一个上游开放阅读框(ORF),被发现可以抑制主要ORF的表达。这些结果表明,猪BCL2L2基因的表达调控机制复杂,涉及选择性剪接、顺式作用元件和上游ORF等多种因素[2]。

猪基因组中存在大量的非编码和调控区域,这些区域对猪的复杂性状形成具有重要影响。研究发现,在猪的胚胎和成体组织中,H3K27ac修饰标记了18,521个启动子和82,769个增强子,其中包括在所有组织和发育阶段都活跃的峰和特定于组织和发育阶段的峰。这些增强子可能参与调控猪的复杂性状形成。此外,研究发现,H3K27ac和DNA甲基化在XIST基因启动子区域的修饰可能参与X染色体失活。这些研究结果为揭示猪基因的调控模式和复杂性状形成的遗传机制提供了重要线索[3]。

基因编辑技术在猪的育种改良和疾病防控中具有巨大潜力。研究发现,通过基因编辑技术使猪对流感A病毒产生抗性的模拟结果表明,基因编辑程序的长度与猪的遗传进展呈负相关。如果基因编辑效率更高,则达到抗性等位基因固定的时间会减少。此外,研究发现,基因编辑相关的嵌合现象对达到抗性等位基因固定的时间和猪群的遗传进展有更大的影响。这些研究结果为猪基因编辑的商业实施提供了重要的经济和遗传学分析[4]。

DNA甲基化是基因表达调控的重要机制。研究发现,猪FUT3基因启动子区域的DNA甲基化水平与mRNA表达呈负相关。进一步研究发现,FUT3基因启动子区域的mC-9位点的甲基化抑制了转录因子Sp1的结合,从而调控FUT3基因的表达。这些结果表明,DNA甲基化可能通过抑制转录因子结合来调控猪FUT3基因的表达,为猪的疾病防控提供了新的思路[5]。

猪的抗体库生成过程中,λ和κ轻链同种型的利用程度几乎相等。研究发现,猪IGLV基因在部分动物中具有高表达,而在其他动物中完全缺失。这些结果可能解释了个体间抗体反应的差异,为猪的免疫学和疾病防控研究提供了重要线索[6]。

猪的免疫能力与基因表达和基因多态性有关。研究发现,高免疫能力猪的巨噬细胞中,与免疫功能和转录因子活性相关的基因表达水平显著高于非高免疫能力猪。进一步研究发现,RNASEL基因启动子区域的特定基因型与高免疫能力猪的吞噬活性增加相关。这些结果表明,RNASEL基因启动子区域的基因型可以作为猪的免疫能力选择的DNA标记[7]。

猪的攻击性行为与基因表达和基因多态性有关。研究发现,SLC6A4基因的特定SNPs与猪的攻击性行为相关。其中,rs345058216和rs332335871分别影响转录因子MAZ和miR-671-5p的结合,从而调控SLC6A4基因的表达。这些结果表明,SLC6A4基因的特定SNPs可以作为猪攻击性行为选择的分子标记[8]。

猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)是一种新兴的猪冠状病毒,可引起猪的腹泻和脱水等症状。研究发现,PDCoV的重组膜蛋白(M)具有良好的抗原性和免疫原性,可用于检测PDCoV血清阳性猪。这些结果表明,PDCoV的重组膜蛋白可以作为猪PDCoV检测的候选抗原[9]。

猪的产仔性状与基因多态性有关。研究发现,ESR基因的特定基因型与猪的产仔性状(产仔数、断奶数、产仔重和断奶重)相关。这些结果表明,ESR基因可以作为猪产仔性状选择的候选标记[10]。

综上所述,猪基因的研究在猪的育种改良和疾病防控中具有重要意义。通过深入研究猪基因的表达调控机制、基因多态性与性状的相关性,可以为猪的育种改良和疾病防控提供新的思路和策略。此外,基因编辑技术的应用也为猪的育种改良和疾病防控提供了新的可能性。未来,随着猪基因研究的不断深入,猪的育种改良和疾病防控将取得更大的进展。

参考文献:
1. Luo, Yabiao, Xu, Qiao, Xue, Mingming, Chao, Zhe, Fang, Meiying. 2023. Novel Haplotype in the HHEX Gene Promoter Associated with Body Length in Pigs. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14020511. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36833438/
2. Zhang, Dong-Jie, Du, Fang-Fang, Jing, Xiao-Yan, Liu, Di, Yang, Xiu-Qin. 2022. Sequence and expression regulation of the BCL2L2 gene in pigs. In Gene, 851, 146992. doi:10.1016/j.gene.2022.146992. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36272652/
3. Zhu, Yaling, Zhou, Zhimin, Huang, Tao, Yang, Bin, Huang, Lusheng. 2022. Mapping and analysis of a spatiotemporal H3K27ac and gene expression spectrum in pigs. In Science China. Life sciences, 65, 1517-1534. doi:10.1007/s11427-021-2034-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35122624/
4. Salvesen, Hamish A, Byrne, Timothy J, Whitelaw, C Bruce A, Hely, Fiona S. 2022. Simulating the Commercial Implementation of Gene-Editing for Influenza A Virus Resistance in Pigs: An Economic and Genetic Analysis. In Genes, 13, . doi:10.3390/genes13081436. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36011347/
5. Yang, Li, Liu, Lili, Cheng, Jinhua, Bao, Wenbin, Wu, Shenglong. 2022. Association analysis of DNA methylation and the tissue/developmental expression of the FUT3 gene in Meishan pigs. In Gene, 851, 147016. doi:10.1016/j.gene.2022.147016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36374642/
6. Schwartz, John C, Murtaugh, Michael P. 2014. Characterization of a polymorphic IGLV gene in pigs (Sus scrofa). In Immunogenetics, 66, 507-11. doi:10.1007/s00251-014-0785-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24934119/
7. Shinkai, Hiroki, Takahagi, Yoichi, Matsumoto, Toshimi, Suzuki, Keiichi, Uenishi, Hirohide. 2021. A specific promoter-type in ribonuclease L gene is associated with phagocytic activity in pigs. In The Journal of veterinary medical science, 83, 1407-1415. doi:10.1292/jvms.21-0142. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34321379/
8. Guo, Yanli, Zhao, Jing, Xu, Qinglei, Schinckel, Allan P, Zhou, Bo. . Identification of functional single nucleotide polymorphisms in the porcine SLC6A4 gene associated with aggressive behavior in weaned pigs after mixing. In Journal of animal science, 100, . doi:10.1093/jas/skac131. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35419600/
9. Castañeda-Montes, Francisco Jesus, Cerriteño-Sánchez, José Luis, Castañeda-Montes, María Azucena, Cuevas-Romero, Julieta Sandra, Mendoza-Elvira, Susana. 2023. A Candidate Antigen of the Recombinant Membrane Protein Derived from the Porcine Deltacoronavirus Synthetic Gene to Detect Seropositive Pigs. In Viruses, 15, . doi:10.3390/v15051049. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37243136/
10. Rahman, Mokidur, Phookan, Arundhati, Zaman, Galib Uz, Choudhury, Hitu, Sarma, Lopa M. 2021. Allelic variability of estrogen receptor (ESR) gene and its effect on litter traits of Doom pigs. In Tropical animal health and production, 53, 316. doi:10.1007/s11250-021-02756-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33977374/