Rbm48-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rbm48-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-09822

品系全称

C57BL/6JCya-Rbm48em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-269623-Rbm48-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rbm48-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-09822) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding motif protein 48
基因别称
C030048B08Rik
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172991.4 | Ensembl: ENSMUST00000042753
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~646 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Rbm48,全称为RNA Binding Motif Protein 48,是一种在真核生物中发现的RNA结合蛋白。该基因编码的蛋白在RNA剪接过程中发挥重要作用,特别是在U12型内含子的剪接中。U12型内含子是一类相对较少见的内含子,与常见的U2型内含子不同,它们是由次要剪接体(minor spliceosome)进行剪接的。Rbm48蛋白在次要剪接体中起到稳定催化中心的作用,并参与识别U6atac小核RNA(snRNA)的5'端γ-单甲基磷酸帽结构[1]。

在植物中,例如玉米,Rbm48基因的突变会导致U12型内含子剪接异常,进而影响细胞分化和增殖。研究表明,Rbm48基因与U12型剪接因子Zinc finger CCCH-type、RNA binding motif和Ser/Arg rich 2/Rough endosperm 3(RGH3)共同选择,并形成复合物,以识别内含子。此外,人类Rbm48蛋白与armadillo repeat containing 7(ARMC7)蛋白相互作用,而玉米Rbm48和ARMC7也具有保守的蛋白质-蛋白质相互作用。这些数据表明,Rbm48可能在所有真核生物中参与U12型剪接,并促进玉米胚乳细胞分化[2]。

在人类中,Rbm48基因的突变与U12型内含子剪接缺陷相关。例如,在人类造血干细胞中,U12型剪接缺陷会干扰髓系谱系的正常分化,并可能导致骨髓增生异常综合征,进而增加急性髓系白血病的风险。通过对人类K-562细胞进行CRISPR/Cas9介导的Rbm48基因敲除,研究发现,在Rbm48突变体中,48%含有次要内含子的基因表现出显著的U12型内含子保留。与玉米rbm48突变体相比,确定了在两种物种中都受到影响的次要内含子基因的子集,其中大多数基因的突变在动植物中都已被报道会导致发育缺陷。这些结果提供了遗传证据,表明人类Rbm48突变体的主要缺陷是U12型内含子剪接异常,而人类和玉米的RNA-seq数据比较确定了可能介导U12型剪接缺陷突变表型的候选基因[3]。

此外,Rbm48的表达受到性激素的调控。在小鼠的发育过程中,Rbm48基因的表达在雌性和雄性小鼠的大脑皮层和海马区存在性别差异。研究发现,雌性新生儿中Rbm48的表达受到睾酮丙酸酯(TP)的抑制,而出生后三周给予TP则可增加Rbm48和Tdrd3的mRNA水平。此外,无论性别如何,出生后的大脑皮层和海马区都表现出雄激素受体(Ar)和雌激素受体β(Esr2)含量的显著增加,而雌激素受体α(Esr1)和芳香化酶(Cyp19a1)含量则有所下降。这些结果表明,雄激素调控的性别差异Rbm48表达可能是新生儿和雄激素控制皮质和海马结构与功能性别差异的新分子机制[4]。

除了在U12型剪接中的作用,Rbm48还可能与其他RNA结合蛋白相互作用,参与其他生物学过程。例如,在玉米中,Dek42基因编码一种RRM_RBM48类型的RNA结合蛋白,定位于细胞核中。Dek42突变导致玉米籽粒发育异常,并显著干扰了数千个基因的表达。RNA-seq分析显示,Dek42突变显著改变了表达基因的替代剪接,尤其是U12型内含子保留类型。酵母双杂交筛选发现,SF3a1是DEK42的相互作用蛋白。DEK42还与剪接体组分U1-70K相互作用。这些结果表明,DEK42通过与其他剪接体组分的相互作用参与调控前信使RNA剪接[5]。

此外,全外显子组测序分析表明,Rbm48基因突变可能与某些肾疾病相关。在对疑似肾发育不全的病例进行全外显子组测序时,发现了5个新的候选基因,包括Rbm48,这些基因可能与肾疾病相关。这些发现表明,Rbm48基因的突变可能与肾疾病的发生有关[6]。

综上所述,Rbm48是一种在真核生物中发现的RNA结合蛋白,在U12型内含子剪接中发挥重要作用。Rbm48基因的突变可能导致U12型内含子剪接缺陷,进而影响细胞分化和增殖。此外,Rbm48的表达受到性激素的调控,并可能与其他RNA结合蛋白相互作用,参与其他生物学过程。Rbm48的研究有助于深入理解RNA剪接的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Bai, Rui, Wan, Ruixue, Wang, Lin, Lei, Jianlin, Shi, Yigong. 2021. Structure of the activated human minor spliceosome. In Science (New York, N.Y.), 371, . doi:10.1126/science.abg0879. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33509932/
2. Bai, Fang, Corll, Jacob, Shodja, Donya N, Lal, Shailesh, Settles, A Mark. 2019. RNA Binding Motif Protein 48 Is Required for U12 Splicing and Maize Endosperm Differentiation. In The Plant cell, 31, 715-733. doi:10.1105/tpc.18.00754. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30760564/
3. Siebert, Amy E, Corll, Jacob, Paige Gronevelt, J, Madlambayan, Gerard J, Lal, Shailesh. . Genetic analysis of human RNA binding motif protein 48 (RBM48) reveals an essential role in U12-type intron splicing. In Genetics, 222, . doi:10.1093/genetics/iyac129. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36040194/
4. Franklin, Michael, Armoskus, Chris, Taniguchi, Saori, Milla, Allyson, Tsai, Houng-Wei. 2019. Androgenic regulation of sexually dimorphic expression of RNA binding motif protein 48 in the developing mouse cortex and hippocampus. In International journal of developmental neuroscience : the official journal of the International Society for Developmental Neuroscience, 78, 33-44. doi:10.1016/j.ijdevneu.2019.07.011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31400491/
5. Zuo, Yi, Feng, Fan, Qi, Weiwei, Song, Rentao. 2019. Dek42 encodes an RNA-binding protein that affects alternative pre-mRNA splicing and maize kernel development. In Journal of integrative plant biology, 61, 728-748. doi:10.1111/jipb.12798. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30839161/
6. Braun, Daniela A, Schueler, Markus, Halbritter, Jan, Lifton, Richard P, Hildebrandt, Friedhelm. . Whole exome sequencing identifies causative mutations in the majority of consanguineous or familial cases with childhood-onset increased renal echogenicity. In Kidney international, 89, 468-475. doi:10.1038/ki.2015.317. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26489029/