Slc27a3-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Slc27a3-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-09627

品系全称

C57BL/6JCya-Slc27a3em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-26568-Slc27a3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Slc27a3-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-09627) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
solute carrier family 27 (fatty acid transporter), member 3
基因别称
Acsvl3,FATP-3,FATP3,Vlcs-3
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011988 | Ensembl: ENSMUST00000029541
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~10
敲除长度
~3.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Slc27a3,也称为脂肪酸转运蛋白3(FATP3),是溶质载体家族27成员之一,编码一种脂肪酸转运蛋白。脂肪酸转运蛋白负责将脂肪酸从细胞外部转运到细胞内部,参与脂肪酸的代谢和利用。Slc27a3在多种组织中表达,包括肝脏、脂肪组织、心脏和脑组织。Slc27a3的表达和活性受到多种因素的调控,包括激素、营养物质和遗传因素等。

在人类遗传学研究中,使用自然变异来理解蛋白质编码基因的改变对表型的后果是一个重要的目标。一项针对454,787名英国生物银行参与者进行的外显子测序研究发现了12百万个编码变异,包括大约100万个功能丧失和大约180万个有害的错义变异。这些变异与3,994个与健康状况相关的特征进行了关联分析,发现了564个与特征相关的基因,其中P值小于等于2.18×10-11。罕见变异的关联在基因组关联研究(GWAS)的位点中富集,但大多数(91%)独立于常见变异的信号。研究发现,SLC27A3与降低哮喘风险有关[1]。

慢性阻塞性肺病(COPD)是一种常见的呼吸系统疾病,其发病机制与免疫细胞浸润密切相关。一项基于机器学习算法的研究发现,SLC27A3和STAU1是COPD的潜在诊断生物标志物,它们与静息NK细胞、浆细胞、嗜酸性粒细胞、活化的肥大细胞、记忆B细胞、CD8+、CD4+和辅助滤泡T细胞相关。SLC27A3和STAU1在COPD模型中的表达上调,免疫细胞浸润激活,而SLC27A3或STAU1的敲低可以减弱吸烟提取物(CSE)对BEAS-2B细胞的影响[2]。

透明细胞肾细胞癌(ccRCC)是一种常见的恶性泌尿系统肿瘤,酪氨酸激酶抑制剂(TKIs)是目前治疗晚期/转移性ccRCC的一线药物。然而,患者在TKI治疗后常常出现耐药性。脂质代谢重编程是肿瘤进展的标志,参与了多种恶性肿瘤的获得性耐药。一项研究发现,SLC27A3在脂质丰富的肿瘤中高表达,与不良预后相关。SLC27A3在帕唑帕尼耐药的786-O细胞(786-O-PR)中表达水平升高,脂滴积累增加。SLC27A3的敲低显著抑制了脂滴积累和自噬,并在体外和体内克服了帕唑帕尼耐药。SLC27A3作为酰基辅酶A连接酶,催化酰基辅酶A的形成,伴随着脂质合成和ROS产生。过度的酰基辅酶A氧化导致线粒体膜电位(MMP)降低和ROS产生增加,从而激活PINK1/Parkin介导的自噬。自噬/ROS负反馈机制维持ROS稳态,并通过消耗CPT1A蛋白抑制脂肪酸β-氧化,迫使酰基辅酶A在脂滴中储存,从而介导ccRCC对帕唑帕尼的耐药性[3]。

SLC27A3基因的SNPs与羊奶的营养价值有关。一项研究发现,在SNP4位点上具有TT基因型的羊的牛奶具有更高的脂肪和干物质含量,而具有GG基因型的羊的牛奶具有更高的不饱和脂肪酸(UFAs)含量。这些发现表明,SLC27A3基因的SNPs可以影响羊奶的脂肪和脂肪酸组成,从而影响其营养价值[4]。

结直肠癌(CRC)是一种常见的消化系统恶性肿瘤,其发生和发展与脂质代谢重编程密切相关。一项研究发现,CRC患者的肿瘤组织中CD36和miR-27a-3p的表达水平下调,而miR-27a-3p与CD36的表达呈负相关。这表明CD36和miR-27a-3p在CRC的发生发展中起着重要作用,并且miR-27a-3p可能参与了CD36的调控[5]。

肥胖是一种常见的代谢性疾病,其发病机制与脂肪组织的扩张和脂肪细胞的肥大有关。一项研究发现,与标准饮食相比,自助餐厅饮食(CD)喂养的雄性Wistar大鼠的腹内脂肪组织中SLC27a3的表达水平升高,而皮下脂肪组织中SLC27a3的表达水平降低。此外,CD喂养的大鼠的SLC27a3基因的DNA甲基化水平降低,这表明SLC27a3的表达受到DNA甲基化的调控[6]。

自闭症谱系障碍(ASD)是一种常见的神经发育障碍,其发病机制与大脑发育异常有关。一项研究发现,SLC27A3和SLC27A4基因在人类神经干细胞中表达,并且SLC27A4基因的一个罕见变异(Ser209)在ASD患者中更频繁地出现。此外,SLC27A4 Ser209变异导致荧光标记的脂肪酸摄取增加,这表明SLC27A4的功能改变可能与ASD的发病机制有关[7]。

GATAD2B基因的微缺失与18型智力障碍(MRD18)相关,MRD18是一种常染色体显性遗传病,表现为发育迟缓和语言障碍。一项研究发现,一个11岁的女孩患有MRD18,并具有典型的临床特征。染色体微阵列分析(CMA)发现了一个新的CNV,其中包括了SLC27A3基因的完全缺失。这表明SLC27A3基因的缺失可能与MRD18的发病机制有关[8]。

糖尿病肾病(DKD)是糖尿病的主要并发症之一,其发病机制与DNA甲基化异常有关。一项研究发现,SLC27A3基因的CpG位点上的DNA甲基化异常与DKD的发生和发展有关。此外,一些药物已被批准用于靶向DNA甲基化,但尚未有针对DKD的药物获批。这表明DNA甲基化是DKD发病机制中的一个重要因素,靶向DNA甲基化可能为DKD的治疗提供新的思路和策略[9]。

在牛的BTA3染色体上,SLC27A3基因被认为是一个重要的候选基因,与牛奶的脂肪含量相关。一项研究发现,SLC27A3基因的SNPs与牛奶的脂肪和脂肪酸组成有关,其中SNP1和SNP3位点的GG基因型与牛奶中UFAs含量的增加相关[10]。

综上所述,基因Slc27a3在多种生物学过程中发挥重要作用,包括脂肪酸代谢、脂质沉积、免疫细胞浸润、肿瘤耐药性、牛奶的营养价值和神经发育等。SLC27A3的表达和活性受到多种因素的调控,包括DNA甲基化、激素和遗传因素等。SLC27A3基因的变异和表达异常与多种疾病的发生和发展有关,包括肥胖、COPD、ccRCC、CRC和ASD等。靶向SLC27A3基因可能为这些疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Backman, Joshua D, Li, Alexander H, Marcketta, Anthony, Abecasis, Gonçalo R, Ferreira, Manuel A R. 2021. Exome sequencing and analysis of 454,787 UK Biobank participants. In Nature, 599, 628-634. doi:10.1038/s41586-021-04103-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34662886/
2. Zhang, Yuepeng, Xia, Rongyao, Lv, Meiyu, Jiang, Yanan, Jin, Shoude. 2022. Machine-Learning Algorithm-Based Prediction of Diagnostic Gene Biomarkers Related to Immune Infiltration in Patients With Chronic Obstructive Pulmonary Disease. In Frontiers in immunology, 13, 740513. doi:10.3389/fimmu.2022.740513. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35350787/
3. Lu, Dingheng, Li, Yuxiao, Niu, Xinyang, Ma, Xueyou, Liu, Ben. 2024. STAT2/SLC27A3/PINK1-Mediated Mitophagy Remodeling Lipid Metabolism Contributes to Pazopanib Resistance in Clear Cell Renal Cell Carcinoma. In Research (Washington, D.C.), 7, 0539. doi:10.34133/research.0539. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39600540/
4. Pecka-Kiełb, Ewa, Kowalewska-Łuczak, Inga, Czerniawska-Piątkowska, Ewa, Zielak-Steciwko, Anna E. 2020. Effects of Single Nucleotide Polymorphisms in the SLC27A3 Gene on the Nutritional Value of Sheep Milk. In Animals : an open access journal from MDPI, 10, . doi:10.3390/ani10040562. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32230821/
5. Niculae, Andrei Marian, Dobre, Maria, Herlea, Vlad, Milanesi, Elena, Hinescu, Mihail Eugen. 2022. Lipid Handling Protein Gene Expression in Colorectal Cancer: CD36 and Targeting miRNAs. In Life (Basel, Switzerland), 12, . doi:10.3390/life12122127. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36556492/
6. Viraragavan, Amsha, Willmer, Tarryn, Patel, Oelfah, Johnson, Rabia, Pheiffer, Carmen. . Cafeteria diet induces global and Slc27a3-specific hypomethylation in male Wistar rats. In Adipocyte, 10, 108-118. doi:10.1080/21623945.2021.1886697. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33570456/
7. Maekawa, Motoko, Iwayama, Yoshimi, Ohnishi, Tetsuo, Mori, Norio, Yoshikawa, Takeo. 2015. Investigation of the fatty acid transporter-encoding genes SLC27A3 and SLC27A4 in autism. In Scientific reports, 5, 16239. doi:10.1038/srep16239. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26548558/
8. Trubnykova, Milana, Bazalar Montoya, Jeny, La Serna-Infantes, Jorge, Castro Mujica, María Del Carmen, Abarca Barriga, Hugo Hernán. 2019. GATAD2B Gene Microdeletion Causing Intellectual Disability Autosomal Dominant Type 18: Case Report and Review of the Literature. In Molecular syndromology, 10, 186-194. doi:10.1159/000499209. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31602190/
9. Akhouri, Vivek, Majumder, Syamantak, Gaikwad, Anil Bhanudas. 2023. Targeting DNA methylation in diabetic kidney disease: A new perspective. In Life sciences, 335, 122256. doi:10.1016/j.lfs.2023.122256. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37949210/
10. Calvo, J H, Martínez-Royo, A, Silveri, L, Marcos-Carcavilla, A, Serrano, M. . Isolation, mapping and identification of SNPs for four genes (ACP6, CGN, ANXA9, SLC27A3) from a bovine QTL region on BTA3. In Cytogenetic and genome research, 114, 39-43. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16717448/