Rbm47-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rbm47-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08710

品系全称

C57BL/6JCya-Rbm47em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-245945-Rbm47-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rbm47-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08710) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RNA binding motif protein 47
基因别称
9530077J19Rik
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001127382 | Ensembl: ENSMUST00000167950
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5
敲除长度
~2.1 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2384294Mice homozygous for a gene-trapped allele exhibit partial prenatal lethality. Surviving adults are small and display impaired cytidine to uridine RNA editing.
Rbm47,也称为RNA-binding motif 47,是一种RNA结合蛋白,包含三个RNA识别基序(RRM)结构域,主要在RNA代谢的核处理过程中发挥作用。Rbm47在多种生物学过程中具有重要作用,包括脊椎动物早期发育、RNA编辑和癌症进展等。

在脊椎动物早期发育中,Rbm47对于胚胎内胚层发育至关重要。在斑马鱼胚胎中,Rbm47的缺失会影响头部形态发生,而在小鼠胚胎中,Rbm47的缺失会导致围产期死亡,表明其在脊椎动物早期发育中具有重要作用[2]。

在RNA编辑方面,Rbm47作为APOBEC1的辅助因子,通过替代A1CF在A1CF-APOBEC1编辑体中发挥作用,参与C到U的RNA编辑过程。这种编辑过程对于维持基因组的稳定性和功能至关重要[2]。

在癌症进展中,Rbm47被证明是一种肿瘤抑制因子,通过抑制上皮-间质转化(EMT)和Wnt/β-catenin信号通路发挥重要作用。此外,Rbm47还参与维持免疫稳态,影响细胞功能[2]。

在肠道损伤和肿瘤发生中,Rbm47具有重要作用。研究表明,Rbm47缺失会导致肠道损伤和肿瘤发生。Rbm47缺失的小鼠表现出肠道增殖增加、绒毛形态和细胞异常、肠道器官样变等。此外,Rbm47缺失的小鼠对辐射损伤和化学诱导的结肠炎具有适应性,并表现出抗氧化和Wnt信号通路的上调,以及干细胞和发育基因的表达增加。然而,随着年龄的增长,Rbm47缺失的小鼠会发展成自发性多发性息肉,而Rbm47缺失的ApcMin/+小鼠表现出肠道息肉负担增加。这些发现表明Rbm47在肠道生长、炎症和肿瘤发生过程中具有细胞内修饰作用[1]。

在甲状腺癌中,Rbm47表达下调,过表达Rbm47可以激活自噬并抑制细胞增殖。Rbm47可以促进但不能直接结合到FOXO3,而FOXO3可以激活自噬相关基因3(ATG3)、ATG5和RBM47,形成环路并促进自噬。此外,Rbm47可以直接结合并稳定lncRNA小核仁RNA宿主基因5(SNHG5),以抑制PTC细胞增殖并激活自噬。SNHG5通过招募泛素特异性肽酶21(USP21)抑制FOXO3的泛素化和降解,然后促进FOXO3从细胞质转移到细胞核。这些发现揭示了Rbm47/SNHG5/FOXO3轴在PTC细胞增殖和自噬调节中的作用机制[3]。

在胚胎干细胞分化中,Rbm47具有重要作用。Rbm47的敲低会影响小鼠胚胎干细胞(mESCs)的细胞命运决策,导致原始内胚层(PrE)标志物表达失调和PrE样细胞增加。然而,通过过表达Rbm47或使用FGFR或MEK抑制剂处理敲低mESCs可以逆转PrE失调。此外,Rbm47敲低还会影响mESCs的多谱系分化潜力,导致在NSG小鼠中形成畸胎瘤和在血清诱导的单层分化中分化标志物的偏斜表达。进一步的研究表明,Rbm47对于mESCs向神经外胚层和内胚层命运的正确分化至关重要[4]。

在抗病毒免疫中,Rbm47也发挥着重要作用。研究表明,Rbm47在病毒感染或干扰素刺激下被诱导表达,并具有广谱的抗病毒活性。Rbm47通过结合IFNAR1 mRNA的3'非翻译区(3'UTR),增加mRNA的稳定性,并延缓IFNAR1的降解。这些发现表明Rbm47是一种干扰素诱导的RNA结合蛋白,在增强宿主干扰素下游信号传导中发挥着重要作用[5]。

在胶质母细胞瘤(GBM)中,Rbm47的表达水平与预后相关。高表达Rbm47的GBM患者预后较差。Rbm47的敲低可以抑制GBM细胞系的集落形成和细胞生长,而Rbm47的过表达则可以恢复和加速这些过程。此外,伤口愈合实验表明Rbm47在促进细胞迁移和侵袭中起着重要作用。机制上,Rbm47通过激活EMT程序增强侵袭能力。在Rbm47敲低细胞中,Vimentin和CD44的表达水平被抑制,而E-钙黏蛋白的水平增加。这些结果表明Rbm47具有肿瘤促进作用,并可能作为GBM的治疗靶点和预后指标[6]。

在周围血管动脉粥样硬化(PVA)中,Rbm47的表达水平也与疾病相关。研究发现,Rbm47是PVA的疾病关键基因之一,与疾病的发生和发展密切相关。Rbm47的表达水平与周围血管动脉粥样硬化的严重程度和炎症程度相关。这些发现为PVA的发病机制提供了新的见解,并为PVA的治疗和预防提供了潜在靶点[7]。

综上所述,Rbm47是一种重要的RNA结合蛋白,参与多种生物学过程,包括脊椎动物早期发育、RNA编辑和癌症进展等。Rbm47在肠道损伤和肿瘤发生、甲状腺癌、胚胎干细胞分化、抗病毒免疫、胶质母细胞瘤和周围血管动脉粥样硬化等方面具有重要作用。深入研究Rbm47的功能和机制有助于理解RNA结合蛋白在疾病发生和发展中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Soleymanjahi, Saeed, Blanc, Valerie, Molitor, Elizabeth A, Rubin, Deborah C, Davidson, Nicholas O. 2023. RBM47 regulates intestinal injury and tumorigenesis by modifying proliferation, oxidative response, and inflammatory pathways. In JCI insight, 8, . doi:10.1172/jci.insight.161118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37014710/
2. Shivalingappa, Pavan Kumar Mysuru, Sharma, Vaishali, Shiras, Anjali, Bapat, Sharmila A. 2021. RNA binding motif 47 (RBM47): emerging roles in vertebrate development, RNA editing and cancer. In Molecular and cellular biochemistry, 476, 4493-4505. doi:10.1007/s11010-021-04256-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34499322/
3. Qin, Yuan, Sun, Wei, Wang, Zhihong, Lv, Chengzhou, Zhang, Hao. 2022. RBM47/SNHG5/FOXO3 axis activates autophagy and inhibits cell proliferation in papillary thyroid carcinoma. In Cell death & disease, 13, 270. doi:10.1038/s41419-022-04728-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35338124/
4. Shivalingappa, Pavan Kumar Mysuru, Singh, Divya Kumari, Sharma, Vaishali, Shiras, Anjali, Bapat, Sharmila A. 2022. RBM47 is a Critical Regulator of Mouse Embryonic Stem Cell Differentiation. In Stem cell reviews and reports, 19, 475-490. doi:10.1007/s12015-022-10441-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35986129/
5. Wang, Kezhen, Huang, Chenxiao, Jiang, Tao, Zhang, Jinyu, Dai, Jianfeng. 2021. RNA-binding protein RBM47 stabilizes IFNAR1 mRNA to potentiate host antiviral activity. In EMBO reports, 22, e52205. doi:10.15252/embr.202052205. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34160127/
6. Xing, Yi-Qi, Zhu, Ting-Zhun. . RNA-Binding Motif Protein RBM47 Promotes Invasiveness of Glioblastoma Through Activation of Epithelial-to-Mesenchymal Transition Program. In Genetic testing and molecular biomarkers, 27, 384-392. doi:10.1089/gtmb.2023.0368. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38156907/
7. Xie, Wei, Chen, Shumin, Luo, Hanqing, Kong, Chuiyu, Wang, Dongjin. 2024. Critical gene signature and immunological characterization in peripheral vascular atherosclerosis: novel insights from mendelian randomization and transcriptomics. In Frontiers in genetics, 15, 1361445. doi:10.3389/fgene.2024.1361445. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38660678/