Rab42-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rab42-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08466

品系全称

C57BL/6JCya-Rab42em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-242681-Rab42-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rab42-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08466) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
RAB42, member RAS oncogene family
基因别称
9530096D07Rik,Rab42-ps
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081651.1 | Ensembl: ENSMUST00000040411
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1200 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
RAB42,也称为Ras-related protein 42,是一种小GTPase,负责控制哺乳动物细胞中从内体到反式高尔基网络的囊泡运输。RAB42在多种癌症中显著过表达,尤其是在晚期病理阶段。其过表达与多种癌症的不良生存率相关,并且与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润、免疫调节网络、RNA修饰、通路激活和药物敏感性相关。RAB42过表达不仅与免疫细胞浸润和免疫检查点分子的水平相关,还与免疫细胞浸润弱、免疫调节基因表达和免疫治疗对免疫检查点抑制剂(ICIs)的响应相关。此外,RAB42过表达与m6A RNA甲基化相关基因(MRGs)及其互作基因的表达增强相关。此外,RAB42过表达与某些化疗药物的耐药性相关,并可能成为肝细胞癌(LIHC)的潜在生物标志物。RAB42过表达或激活促进了LIHC的细胞增殖、迁移和侵袭。因此,RAB42过表达可能成为泛癌症,尤其是LIHC中的潜在预后生物标志物和治疗靶点[2]。

RAB42是一种RAS家族的成员。然而,RAB42在肿瘤中的作用及其驱动因素尚不清楚。在一项研究中,使用生物信息学和实验方法对RAB42在肿瘤中的作用和调节机制进行了全面的泛癌症分析。结果显示,RAB42在大多数肿瘤中表达上调,并与不良预后密切相关。富集分析表明,RAB42与多种生物学功能相关,尤其是免疫过程。RAB42表达与免疫细胞浸润和免疫检查点基因表达呈正相关。RAB42对免疫治疗效率具有高预测价值。该研究筛选出对RAB42蛋白敏感的药物,并通过敏感性分析和虚拟筛选。许多关键驱动基因,如TP53,参与了RAB42的表达。DNA甲基化、超级增强子和非编码RNA是肿瘤中RAB42过表达的表观遗传因素。简而言之,RAB42可能成为多种肿瘤类型的诊断和预后生物标志物。RAB42可能是免疫治疗的预测生物标志物和新的治疗靶点。遗传和表观遗传因素对肿瘤中RAB42过表达至关重要[3]。

RAB42在胶质瘤的发生发展中发挥重要作用。一项研究发现,与正常样本相比,RAB42在胶质瘤样本中高表达。RAB42的高表达与GBM组织病理学分级升高相关。高表达RAB42的GBM患者的预后较差。35个通路,如P53通路,在RAB42高表达的GBM样本中显著激活。RAB42的高表达与GBM的发生发展相关,RAB42可能是GBM的潜在预后标志物[1]。

RAB42在胶质瘤的发生发展中发挥作用,与VEGF信号通路相关。一项研究通过RNA测序和临床数据分析发现,RAB42在胶质瘤组织中显著表达,并且在正常组织中未检测到。RAB42激活了VEGF信号通路,并且其机制与自然杀伤细胞介导的细胞毒性、JAK-STAT信号通路和PI3K/AKT介导的凋亡通路相关。体外实验表明,下调RAB42可以抑制胶质瘤细胞的增殖和侵袭。RAB42的致癌机制可能与VEGF信号通路的激活相关。因此,RAB42的过表达是GBM不良预后的独立预后因素,其致癌机制可能与VEGF信号通路的激活相关[4]。

RAB42在肝细胞癌(HCC)中具有潜在的诊断和预后价值。一项研究发现,RAB42在HCC组织中的表达水平高于正常组织。高表达的RAB42与HCC患者的几个临床参数显著相关。此外,RAB42表达升高明显预测了HCC的不良预后。RAB42的基因改变率为5%。HCC组织中RAB42的DNA甲基化水平低于正常组织。在7个DNA甲基化CpG位点中,有两个与HCC的预后相关。基因集富集分析(GSEA)显示,RAB42与HCC中多种免疫细胞和癌相关成纤维细胞浸润相关。同时,RAB42的甲基化与免疫浸润水平、免疫调节剂和趋化因子显著相关。体外实验表明,敲低RAB42抑制了肝癌细胞的增殖、侵袭和迁移。因此,RAB42可能在HCC中发挥致癌作用,促进HCC的进展[5]。

综上所述,RAB42在多种癌症中发挥重要作用,包括胶质瘤和肝细胞癌。RAB42的过表达与不良预后、免疫细胞浸润和化疗耐药性相关。RAB42可能成为这些癌症的潜在预后生物标志物和治疗靶点。此外,RAB42在肿瘤微环境中的作用及其与免疫细胞浸润的关系需要进一步研究。RAB42的研究有助于深入理解肿瘤发生发展的分子机制,为癌症的诊断、预后和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Sun, Liwei, Yan, Tao, Yang, Bing. 2022. The Progression Related Gene RAB42 Affects the Prognosis of Glioblastoma Patients. In Brain sciences, 12, . doi:10.3390/brainsci12060767. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35741652/
2. Wang, Yang, Xie, Youbang, Qian, Luomeng, Zhang, Qing, Zhang, Sihe. 2024. RAB42 overexpression correlates with poor prognosis, immune cell infiltration and chemoresistance. In Frontiers in pharmacology, 15, 1445170. doi:10.3389/fphar.2024.1445170. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39101146/
3. Zheng, Mingzhu, Wang, Wenhao, Bu, Yulan, Li, Jiaqiu, Cai, Jinwei. 2022. Pan-Cancer Analysis of the Roles and Driving Forces of RAB42. In Biomolecules, 13, . doi:10.3390/biom13010043. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36671428/
4. Liu, Baoling, Su, Quanping, Xiao, Bolian, Che, Fengyuan, Heng, Xueyuan. 2021. RAB42 Promotes Glioma Pathogenesis via the VEGF Signaling Pathway. In Frontiers in oncology, 11, 657029. doi:10.3389/fonc.2021.657029. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34912698/
5. Peng, Hao, Du, Xuanlong, Zhang, Yewei. 2022. RAB42 is a Potential Biomarker that Correlates With Immune Infiltration in Hepatocellular Carcinoma. In Frontiers in molecular biosciences, 9, 898567. doi:10.3389/fmolb.2022.898567. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35720121/