Xrn1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Xrn1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08352

品系全称

C57BL/6JCya-Xrn1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-24127-Xrn1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Xrn1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08352) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
5'-3' exoribonuclease 1
基因别称
Dhm2,exo,mXrn1
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_011916 | Ensembl: ENSMUST00000034981
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~0.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Xrn1,是一种在真核细胞中高度保守的酶,负责降解去帽后的mRNA。它不仅参与RNA周转,还涉及无义介导的mRNA降解以及被小干扰RNA(siRNA)或微小RNA(miRNA)靶向的mRNA降解。Xrn1在细胞内通常与处理体(P bodies)中的其他蛋白质,如DCP2和RNA解旋酶DHH1(Me31B)共存,参与5'→3'降解途径。Xrn1对特定5'单磷酸化RNA的降解缺乏特异性,但在体内突变时表现出对特定RNA的降解作用。此外,Xrn1在细胞生长、转录调控、翻译调控和细胞死亡等方面发挥重要作用。在果蝇中,Xrn1的同源基因pacman的突变会导致伤口愈合、上皮闭合和睾丸干细胞更新的缺陷。Xrn1可能通过miRNA和/或RNA结合蛋白与RNA中的不稳定性元件结合,引导RNA到5'核心降解装置进行调控性降解[5]。

研究发现,Xrn1在多种生物学过程中发挥关键作用,包括细胞生长和发育。例如,在酵母中,Xrn1的缺失会显著影响细胞生长速率,但并非必需基因。当将Xrn1基因重新引入缺失的酵母细胞中时,生长缺陷得到纠正[4]。此外,Xrn1还与转录调控相关。研究表明,Xrn1的缺失会影响RNA聚合酶II(RNA pol II)的转录延长过程,导致RNA pol II在基因体中的分布和染色质构象发生改变[2]。

Xrn1在免疫反应中也发挥着重要作用。在癌细胞中,Xrn1的缺失可以激活干扰素信号通路,从而诱导细胞死亡。干扰素信号通路是宿主细胞对病毒感染做出反应的重要途径,Xrn1的缺失导致细胞内双链RNA(dsRNA)水平的升高,从而激活dsRNA传感器蛋白激酶R(PKR)和线粒体抗病毒信号蛋白,最终导致癌细胞死亡。研究还发现,Xrn1的缺失会导致内源性互补的正义/反义RNA积累,这些RNA可能作为PKR的配体发挥作用[1]。此外,Xrn1的缺失还可以通过激活干扰素信号通路和病毒防御途径来增强癌症免疫治疗的疗效[6]。

在病毒感染中,Xrn1也扮演着重要角色。例如,在黄病毒感染中,Xrn1的缺失可以导致细胞内RNA水平的改变,从而影响病毒的复制和细胞病理变化。研究发现,在感染严重但非温和黄病毒株的情况下,神经元死亡率很高,而在感染温和株的情况下,星形胶质细胞没有死亡。差异表达和剪接分析表明,黄病毒感染导致神经细胞和星形胶质细胞中的转录组发生了显著改变,包括炎症和免疫反应通路、神经系统的发育和有丝分裂的调节[3]。

综上所述,Xrn1作为一种关键的5'→3'外切核酸酶,在RNA代谢、细胞生长、转录调控、翻译调控、细胞死亡和免疫反应等方面发挥重要作用。Xrn1的缺失或功能障碍可能导致多种生物学过程的异常,从而影响细胞生长和发育,参与疾病的发生和发展。因此,深入研究Xrn1的功能和调控机制对于理解细胞生物学过程和疾病发生机制具有重要意义,也为开发新型癌症治疗方法提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Zou, Tao, Zhou, Meng, Gupta, Akansha, Cherniack, Andrew D, Meyerson, Matthew. 2024. XRN1 deletion induces PKR-dependent cell lethality in interferon-activated cancer cells. In Cell reports, 43, 113600. doi:10.1016/j.celrep.2023.113600. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38261514/
2. Begley, Victoria, Jordán-Pla, Antonio, Peñate, Xenia, Pérez-Ortín, José E, Chávez, Sebastián. 2020. Xrn1 influence on gene transcription results from the combination of general effects on elongating RNA pol II and gene-specific chromatin configuration. In RNA biology, 18, 1310-1323. doi:10.1080/15476286.2020.1845504. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33138675/
3. Selinger, Martin, Věchtová, Pavlína, Tykalová, Hana, Štěrba, Ján, Grubhoffer, Libor. 2022. Integrative RNA profiling of TBEV-infected neurons and astrocytes reveals potential pathogenic effectors. In Computational and structural biotechnology journal, 20, 2759-2777. doi:10.1016/j.csbj.2022.05.052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35685361/
4. Larimer, F W, Stevens, A. . Disruption of the gene XRN1, coding for a 5'----3' exoribonuclease, restricts yeast cell growth. In Gene, 95, 85-90. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1979303/
5. Jones, Christopher Iain, Zabolotskaya, Maria Vasilyevna, Newbury, Sarah Faith. 2012. The 5' → 3' exoribonuclease XRN1/Pacman and its functions in cellular processes and development. In Wiley interdisciplinary reviews. RNA, 3, 455-68. doi:10.1002/wrna.1109. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22383165/
6. Ran, Xue-Bin, Ding, Ling-Wen, Sun, Qiao-Yang, Jha, Sudhakar, Koeffler, H Phillip. . Targeting RNA Exonuclease XRN1 Potentiates Efficacy of Cancer Immunotherapy. In Cancer research, 83, 922-938. doi:10.1158/0008-5472.CAN-21-3052. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36638333/