Dytn-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Dytn-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08330

品系全称

C57BL/6JCya-Dytnem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-241073-Dytn-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Dytn-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08330) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
dystrotelin
基因别称
Gm215
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001081658.1 | Ensembl: ENSMUST00000090313
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 7~8
敲除长度
~945 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Dytn是Paracoccus denitrificans DYTN-1菌株中的一个关键基因。Paracoccus denitrificans是一种具有异养硝化-好氧反硝化能力(HN-AD)的细菌,表现出强大的反硝化能力。DYTN-1菌株是从活性污泥中分离出来的,它展示了卓越的氮去除能力和遗传可编辑性,这使得P. denitrificans DYTN-1成为合成生物学工程中有望的底盘细胞,具有多功能的污染物降解能力[1]。

然而,DYTN-1菌株在质粒接合转移效率(PCTE)方面的低稳定性限制了基因编辑的效力。这种低效率归因于菌株的限制修饰系统(R-M系统)。为了克服这一限制,研究者们对DYTN-1菌株中的R-M系统进行了表征,并确定了13种DNA甲基化酶和一种HNH内切酶[1]。随后,他们开发了一种质粒人工修饰方法来提高接合转移效率,结果使单菌落产量显著提高了44倍,并且阳性菌落的频率从33.3%增加到100%[1]。

研究者们还克隆、表达和表征了这种推测的HNH内切酶,它能够在30°C下无特异性切割位点偏好地降解未甲基化的DNA。值得注意的是,他们发现了DNA甲基酶M9对质粒的修饰对HNH内切酶切割效率的显著影响,显著阻碍了HNH内切酶的切割效率[1]。

这些发现揭示了P. denitrificans中一个新的R-M系统,并揭示了其对抗外源DNA入侵的保护机制。这些研究结果为未来的工程努力提供了道路,旨在提高P. denitrificans的DNA可编辑性,从而为合成生物学工程和环境修复等领域提供更多可能性[1]。

综上所述,基因Dytn在P. denitrificans DYTN-1菌株中发挥着重要作用。通过研究和理解Dytn及其相关的R-M系统,我们可以提高菌株的质粒接合转移效率,从而提高基因编辑的效力。这些发现不仅有助于我们更好地理解P. denitrificans的生物学特性,还为合成生物学和环境修复等领域提供了新的研究方向和应用可能性。

参考文献:
1. Shi, Yunpeng, Cao, Wenyan, Zheng, Zhiping, Zhou, Shenghu, Deng, Yu. 2024. Identification and Characterization of an R-M System in Paracoccus denitrifican DYTN-1 to Improve the Plasmid Conjugation Transfer Efficiency. In Journal of microbiology and biotechnology, 34, 1826-1835. doi:10.4014/jmb.2402.02041. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39155392/