Sec31b-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Sec31b-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-08285

品系全称

C57BL/6JCya-Sec31bem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-240667-Sec31b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Sec31b-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-08285) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SEC31 homolog B, COPII coat complex component
基因别称
Gm341,Sec31l2
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001033343.1 | Ensembl: ENSMUST00000063632
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 17~18
敲除长度
~1411 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Sec31b,也称为Sec31-like 2或secretory pathway component Sec31B-1,是一种外被蛋白复合物II(COPII)的组成部分,参与介导从内质网到高尔基体的正向运输。Sec31b在哺乳动物中广泛表达,并在脑部和睾丸中富集。其基因位于人类染色体10q24,包含29个外显子,并表现出广泛的mRNA选择性剪接,生成全长和截断的蛋白质形式[2]。全长Sec31b(Sec31B-F)与酵母Sec31p和Sec31A具有高度相似性,并具有保守的WD重复序列和富含脯氨酸的C末端区域,这些区域分别与Sec13和Sec23/24相互作用。截断形式的Sec31B(Sec31B-T)保留了WD重复序列,但缺乏C末端区域,其功能尚不明确[2]。

在植物中,Sec31b也发挥着重要作用。例如,在拟南芥中,Sec31b对于花粉壁的发育至关重要。Atsec31b突变体表现出严重的花粉和种子败育,花粉外壁形成受损[3]。Sec31b的功能与调节绒毡层细胞的分泌途径有关,绒毡层细胞在花粉壁发育中起着关键作用。Sec31b的缺失会导致绒毡层细胞中的内质体-高尔基体蛋白转运受阻,并影响绒毡层的结构[3]。

Sec31b在生殖过程中也发挥着重要作用。Sec31a和Sec31b在拟南芥中的功能研究表明,它们对于配子发生是必需的。Sec31a和Sec31b在花粉中的共定位率很高,但在生长的花粉管中较低。sec31a单突变体表现出正常生长,而sec31b突变体则导致花粉败育和不育。Sec31a的表达可以挽救sec31b突变体中的花粉败育和不育表型。sec31a和sec31b的双突变体由于sec31a和sec31b配子体的致死性而无法获得。电镜观察显示,sec31a-1/+sec31b-3/+植株中有四分之一的雄性配子发生停滞在单核微孢子阶段,而共聚焦激光扫描显微镜观察显示,sec31a-1/+sec31b-3/+植株中有四分之一的雌性配子体发育停滞在功能大孢子阶段[1]。

此外,Sec31b还与心脏功能相关。一项使用Exome Chip进行的心率相关位点研究发现,Sec31b基因中的变异与心率显著相关,并影响Sec31b在心脏和胫神经组织中的表达[4]。这表明Sec31b可能参与调节心脏的生理功能。

Sec31b还与前列腺癌相关疲劳有关。一项研究通过构建预测模型和实验验证,确定了与前列腺癌相关疲劳相关的诊断生物标志物。在筛选出的关键基因中,Sec31b与CXCL信号通路相关,并被认为是一个有希望的生物标志物,用于前列腺癌相关疲劳的诊断[5]。

Sec31b还与视网膜发育中的细胞存活有关。Sec13蛋白是COPII外被蛋白复合物的核心成分,同时也是核孔复合物(NPC)的成分。Sec13在视网膜发育中发挥重要作用,其COPII功能和NPC功能分别参与调节视网膜的分层和细胞存活。Sec31a和Sec31b的基因敲低或brefeldin A处理导致消化器官缺陷,但并不影响视网膜的分层,这表明Sec13在视网膜发育中的功能与其在消化器官发育中的功能不同。Sec13突变体视网膜细胞中核孔形成异常,导致mRNA在核内积累,并激活p53依赖的凋亡途径,导致视网膜缺陷。Nup107的缺失也导致视网膜分层缺陷,这表明Sec13的NPC功能对于视网膜发育至关重要[6]。

Sec31b还与脑胶质瘤的生存相关。一项研究系统地鉴定了与脑胶质瘤生存相关的选择性剪接事件和剪接因子。研究发现,Sec31b是三个与患者生存相关的剪接因子之一,并参与调节脑胶质瘤的生物学过程[7]。

Sec31b还与增强子RNA(eRNA)在脑胶质瘤中的作用有关。一项研究通过整合分析确定了与脑胶质瘤预后相关的关键eRNA,并发现Sec31b是潜在的目标基因之一,参与调节脑胶质瘤的生物学过程[8]。

综上所述,Sec31b是一种重要的COPII外被蛋白复合物成分,参与介导从内质网到高尔基体的正向运输。Sec31b在植物和哺乳动物中发挥着重要作用,包括花粉壁发育、生殖过程、心脏功能和视网膜发育。Sec31b还与前列腺癌相关疲劳、脑胶质瘤的生存和增强子RNA在脑胶质瘤中的作用有关。Sec31b的研究有助于深入理解COPII外被蛋白复合物的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Liu, Xiaoyu, Tong, Mengjuan, Zhang, Aiwei, Guo, Yi, Li, Rui. 2021. COPII genes SEC31A/B are essential for gametogenesis and interchangeable in pollen development in Arabidopsis. In The Plant journal : for cell and molecular biology, 105, 1600-1614. doi:10.1111/tpj.15136. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33340171/
2. Stankewich, Michael C, Stabach, Paul R, Morrow, Jon S. . Human Sec31B: a family of new mammalian orthologues of yeast Sec31p that associate with the COPII coat. In Journal of cell science, 119, 958-69. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16495487/
3. Zhao, Bingchun, Shi, Haidan, Wang, Wanlei, Li, Rui, Guo, Yi. 2016. Secretory COPII Protein SEC31B Is Required for Pollen Wall Development. In Plant physiology, 172, 1625-1642. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27634427/
4. van den Berg, Marten E, Warren, Helen R, Cabrera, Claudia P, Stricker, Bruno H, Munroe, Patricia B. . Discovery of novel heart rate-associated loci using the Exome Chip. In Human molecular genetics, 26, 2346-2363. doi:10.1093/hmg/ddx113. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28379579/
5. Chen, Ming, Zhou, Siqi, He, Xiongwei, Wen, Haiyan. 2024. Identification of diagnostic biomarkers in prostate cancer-related fatigue by construction of predictive models and experimental validation. In British journal of cancer, 132, 283-294. doi:10.1038/s41416-024-02922-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39676131/
6. Niu, Xubo, Hong, Jian, Zheng, Xiaofeng, Meng, Anming, Peng, Jinrong. 2014. The nuclear pore complex function of Sec13 protein is required for cell survival during retinal development. In The Journal of biological chemistry, 289, 11971-11985. doi:10.1074/jbc.M114.547190. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24627485/
7. Peng, Tao, Liu, Zhe, Zhang, Yu, Song, Xinqiang, Wang, Lei. 2024. The systematic identification of survival-related alternative splicing events and splicing factors in glioblastoma. In Annals of human genetics, 88, 320-335. doi:10.1111/ahg.12550. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38369937/
8. Lin, Han, Yang, Yong, Hou, Chongxian, Wang, Peng, Zhou, Dong. 2021. An integrated analysis of enhancer RNAs in glioma and a validation of their prognostic values. In American journal of translational research, 13, 8611-8631. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34539983/