Sowaha-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Sowaha-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07949

品系全称

C57BL/6JCya-Sowahaem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-237761-Sowaha-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Sowaha-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07949) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
sosondowah ankyrin repeat domain family member A
基因别称
A830006N08Rik,Ankrd43
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_183173.2 | Ensembl: ENSMUST00000104955
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1677 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因SOWAHA,也称为Sosondowah ankyrin repeat domain family member A,是一种编码锚蛋白重复结构域家族成员的基因。锚蛋白重复结构域是一种常见的蛋白质结构域,存在于多种蛋白质中,参与多种生物学过程,包括细胞信号转导、细胞骨架组织、基因表达调控等。SOWAHA基因在多种组织和细胞类型中表达,包括胰腺、卵巢和结肠等。SOWAHA基因的功能尚未完全明确,但目前研究表明,SOWAHA基因与肿瘤的发生、发展和预后密切相关。

在胰腺癌中,SOWAHA基因的表达与患者的生存期密切相关。一项基于深度学习的基因选择方法研究表明,SOWAHA基因在胰腺癌患者的预后预测中具有重要价值。该研究使用了13名胰腺导管腺癌患者的癌症组织样本和相邻正常胰腺组织样本,通过RNA测序技术提取基因表达数据。研究人员训练了一个深度学习模型,用于区分癌症组织和正常组织以及预测患者的生存期。研究发现,SOWAHA基因在预测胰腺癌患者的生存期方面表现出良好的性能,与其他基因相比,SOWAHA基因的表达水平与患者的预后密切相关[1]。

在鸡的卵泡选择过程中,SOWAHA基因也发挥着重要作用。一项整合转录组分析研究表明,SOWAHA基因在鸡的小黄色卵泡(SY)中被抑制,抑制SOWAHA基因的表达可以抑制鸡的卵泡选择过程。该研究使用了定量实时聚合酶链反应技术验证了SOWAHA基因的表达水平,并发现SOWAHA基因的表达受到促卵泡激素(FSH)的影响。此外,SOWAHA基因的表达还与Wnt家族成员4(Wnt4)和类固醇生成急性调节蛋白(StAR)的表达水平相关[2]。

在结直肠癌中,SOWAHA基因的表达与微卫星不稳定性(MSI)状态密切相关。一项研究表明,SOWAHA基因的表达与结直肠癌患者的MSI状态和免疫治疗反应相关。该研究使用了低微卫星不稳定性(MSI-L)或微卫星稳定(MSS)结直肠癌患者的基因表达数据,并与60个RNA甲基化调节基因进行了比较。研究发现,SOWAHA基因的表达与结直肠癌患者的预后和免疫治疗反应密切相关,可以作为预测免疫治疗疗效的预后标志物[3]。

在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中,SOWAHA基因的表达与患者的预后也密切相关。一项研究构建了一个基于缺氧-免疫的预后mRNA签名,用于预测OSCC患者的总体生存率。该研究使用了OSCC患者的mRNA表达数据,并使用t-分布随机邻域嵌入(t-SNE)算法确定了缺氧状态。研究发现,SOWAHA基因在缺氧和免疫状态中均表现出显著差异,与患者的预后密切相关[4]。

此外,SOWAHA基因还与鸡蛋蛋黄的含水量相关。一项全基因组关联研究(GWAS)表明,SOWAHA基因的变异与鸡蛋蛋黄的含水量相关。该研究使用了混合线性模型进行GWAS分析,并发现SOWAHA基因的变异与鸡蛋蛋黄的含水量呈显著相关[5]。

综上所述,基因SOWAHA在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括肿瘤的发生、发展和预后,鸡的卵泡选择过程,以及鸡蛋蛋黄的含水量等。SOWAHA基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mori, Yasukuni, Yokota, Hajime, Hoshino, Isamu, Uno, Takashi, Suyari, Hiroki. 2021. Deep learning-based gene selection in comprehensive gene analysis in pancreatic cancer. In Scientific reports, 11, 16521. doi:10.1038/s41598-021-95969-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34389782/
2. Zhong, Conghao, Liu, Zemin, Qiao, Xibo, Sun, Yi, Jiang, Yunliang. 2020. Integrated transcriptomic analysis on small yellow follicles reveals that sosondowah ankyrin repeat domain family member A inhibits chicken follicle selection. In Animal bioscience, 34, 1290-1302. doi:10.5713/ajas.20.0404. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33152230/
3. Yin, Yuehan, Yang, Shangjiu, Huang, Zhijian, Zhang, Changhua, He, Yulong. . RNA methylation-related genes INHBB and SOWAHA are associated with MSI status in colorectal cancer patients and may serve as prognostic markers for predicting immunotherapy efficacy. In Carcinogenesis, 45, 337-350. doi:10.1093/carcin/bgae004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38400766/
4. Lv, Shaohua, Qian, Zhipeng, Li, Jianhao, Piao, Songlin, Li, Jichen. 2022. Identification and Validation of a Hypoxia-Immune-Based Prognostic mRNA Signature for Oral Squamous Cell Carcinoma. In Journal of oncology, 2022, 5286251. doi:10.1155/2022/5286251. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35178089/
5. Zhang, Ruiqi, Yao, Fusheng, Cheng, Xue, Yang, Mengyuan, Ning, Zhonghua. 2023. Identification of candidate genomic regions for egg yolk moisture content based on a genome-wide association study. In BMC genomics, 24, 110. doi:10.1186/s12864-023-09221-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36918797/