Edc4-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Edc4-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07757

品系全称

C57BL/6JCya-Edc4em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-234699-Edc4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Edc4-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07757) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
enhancer of mRNA decapping 4
基因别称
-
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001301100 | Ensembl: ENSMUST00000040254
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~0.7 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
EDC4(Enhancer of Decapping 4)是一种重要的RNA代谢调节因子,主要参与mRNA的脱帽和降解过程。EDC4是脱帽复合物DCP1/2的一个关键组成部分,该复合物负责从mRNA的5'端移除7-甲基鸟苷帽子,从而启动mRNA的降解。此外,EDC4还与其他RNA结合蛋白相互作用,如DDX6和MARF1,共同调节mRNA的稳定性和翻译。EDC4在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。

在急性髓系白血病(AML)中,EDC4基因的异常表达与疾病的进展和预后密切相关。例如,研究发现,KMT2A::EDC4基因融合在初发AML患者中存在,这种融合可能导致EDC4功能的改变,进而影响mRNA的代谢和白血病细胞的生长[1]。此外,EDC4还与RNA剪接和转录后调控有关,这些过程在AML的发生发展中起着重要作用。

EDC4在细胞命运决定和细胞塑形中也发挥着重要作用。研究发现,抑制EDC4可以赋予人源和鼠源多能干细胞(ESC)一种分化抵抗、超多能状态,这种状态可以重新编程为类似于植入前胚胎的原始状态[2]。EDC4还参与调节P小体(P-body)的稳态,P小体是细胞质中的一种RNA代谢和降解的场所。研究发现,EDC4的缺失会导致P小体的溶解和释放,进而影响细胞的命运决定[3]。

EDC4还与肿瘤的发生发展密切相关。研究发现,P小体可以抑制肿瘤细胞的迁移和侵袭,而EDC4和DDX6的沉默可以激活肿瘤细胞上皮-间质转化(EMT)的标志性特征,从而增强肿瘤细胞的迁移和侵袭能力[4]。此外,EDC4还可以通过调节mRNA的稳定性和翻译来影响肿瘤细胞的生长和存活。

EDC4在胚胎发育中也发挥着重要作用。研究发现,EDC4和EDC-3是DCAP-2脱帽支架蛋白,在胚胎发育过程中调节mRNA的降解和生物分子凝聚体的特化[5]。EDC-4可以与GID(CTLH)复合物相互作用,促进母体到合子的转变(MZT),从而影响胚胎的发育和生长。

EDC4还可以与其他信号通路相互作用,如IKK和NF-κB。研究发现,IKK可以与EDC4相互作用并磷酸化EDC4,从而影响mRNA的稳定性和翻译[6]。此外,EDC4和Dcp1a的组装对于IL-6的翻译调控至关重要[7]。

综上所述,EDC4是一种重要的RNA代谢调节因子,参与调节mRNA的脱帽、降解和翻译。EDC4在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。深入研究EDC4的生物学功能和调控机制,有助于我们更好地理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[8]。

参考文献:
1. Hu, De-Yuan, Wang, Man, Shen, Kai, Yin, Jia, Chen, Su-Ning. 2023. A new breakpoint fusion gene involving KMT2A::EDC4 rearrangement in de novo acute myeloid leukemia. In International journal of laboratory hematology, 45, 596-598. doi:10.1111/ijlh.14038. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36811287/
2. Di Stefano, Bruno, Luo, En-Ching, Haggerty, Chuck, Yeo, Gene W, Hochedlinger, Konrad. 2019. The RNA Helicase DDX6 Controls Cellular Plasticity by Modulating P-Body Homeostasis. In Cell stem cell, 25, 622-638.e13. doi:10.1016/j.stem.2019.08.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31588046/
3. Fang, Liang, Zhang, Li, Wang, Mengran, Hu, Yuhui, Chen, Wei. . Pooled CRISPR Screening Identifies P-Bodies as Repressors of Cancer Epithelial-Mesenchymal Transition. In Cancer research, 84, 659-674. doi:10.1158/0008-5472.CAN-23-1693. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38190710/
4. Vidya, Elva, Duchaine, Thomas F. 2022. Eukaryotic mRNA Decapping Activation. In Frontiers in genetics, 13, 832547. doi:10.3389/fgene.2022.832547. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35401681/
5. Brothers, William R, Hebert, Steven, Kleinman, Claudia L, Fabian, Marc R. 2020. A non-canonical role for the EDC4 decapping factor in regulating MARF1-mediated mRNA decay. In eLife, 9, . doi:10.7554/eLife.54995. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32510323/
6. Vidya, Elva, Jami-Alahmadi, Yasaman, Mayank, Adarsh K, Vera, Maria, Duchaine, Thomas F. 2024. EDC-3 and EDC-4 regulate embryonic mRNA clearance and biomolecular condensate specialization. In Cell reports, 43, 114781. doi:10.1016/j.celrep.2024.114781. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39331503/
7. Mikuda, Nadine, Kolesnichenko, Marina, Beaudette, Patrick, Hinz, Michael, Scheidereit, Claus. 2018. The IκB kinase complex is a regulator of mRNA stability. In The EMBO journal, 37, . doi:10.15252/embj.201798658. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30467221/
8. Seto, Eri, Yoshida-Sugitani, Reiko, Kobayashi, Toshihiko, Toyama-Sorimachi, Noriko. 2015. The Assembly of EDC4 and Dcp1a into Processing Bodies Is Critical for the Translational Regulation of IL-6. In PloS one, 10, e0123223. doi:10.1371/journal.pone.0123223. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25970328/