Scaf1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Scaf1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07634

品系全称

C57BL/6JCya-Scaf1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-233208-Scaf1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Scaf1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07634) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SR-related CTD-associated factor 1
基因别称
SR-A1
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001008422 | Ensembl: ENSMUST00000085383
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Scaf1(SR-related C-terminal domain-associated factor 1)是一种人类SR(Ser/Arg-rich)超家族的成员,是RNA聚合酶II(RNAPII)C端结构域(CTD)相关因子,与pre-mRNA剪接有关[6]。SCAF1基因编码的蛋白质在多种生物学过程中发挥作用,包括RNA合成、剪接、稳定性和细胞代谢[1,2,3,4,5,6,7,8]。

在自闭症研究中,Scaf1被确定为新的中度风险基因之一。研究发现,Scaf1中的罕见基因变异与自闭症风险相关,且与中度效应一致[1]。此外,Scaf1基因变异与自闭症患者的认知障碍程度相关,携带中度风险基因变异的自闭症患者的认知障碍程度较轻[1]。

在FSGS(局灶节段性肾小球硬化症)的研究中,Scaf1也被确定为新的候选基因之一。研究发现,Scaf1中的罕见基因变异在FSGS患者中富集,提示Scaf1可能与FSGS的发生发展相关[2]。

在胰腺癌研究中,Scaf1被确定为肿瘤抑制因子。研究发现,Scaf1缺失导致TNFα、TGF-β和IL6等炎症反应降低,以及PARP抑制和吉西他滨敏感性增加[3]。此外,Scaf1缺失还导致USP15的截短、失活型增多,影响USP15的功能[3]。

在胃癌研究中,Scaf1与SOX13共同参与铁死亡抵抗。研究发现,SOX13通过直接激活SCAF1,促进电子传递链(ETC)复合物的组装,增加线粒体呼吸和代谢效率,从而增强胃癌细胞的化疗和免疫抵抗[4]。

在斑马鱼研究中,Scaf1促进呼吸链超复合物(SCs)的组装,调节氧化磷酸化(OXPHOS)效率和代谢资源优化。研究发现,scaf1-/-斑马鱼表现出OXPHOS活性降低、体型变小、脂肪沉积异常和雌性生育能力下降等生理表型[5]。

在乳腺癌研究中,SCAF1基因的拷贝数变异和基因表达水平与乳腺癌亚型相关。研究发现,SCAF1在基底型乳腺癌中表达上调,可能作为该亚型的生物标志物[7]。

在RNA合成研究中,SCAF1被确定为RNA聚合酶II延伸和全局转录的关键激活剂。研究发现,SCAF1的缺失导致RNA合成减少、RNAPII停滞和泛素降解机制介入,影响细胞转录和生长[8]。

在病毒性肝炎研究中,Scaf1基因多态性与肝硬化的发生发展相关。研究发现,rs12104272位点的A等位基因与肝硬化风险降低相关[9]。

在呼吸链超复合物形成研究中,SCAF1蛋白被提出是线粒体超复合物组装因子,对于呼吸体(包含复合物I、III和IV的超复合物)的形成至关重要。研究发现,SCAFI蛋白的缺失会影响呼吸链超复合物的形成,但与Bcs1l突变小鼠的疾病进展无关,提示其他遗传因素也参与其中[10]。

综上所述,Scaf1基因及其编码的蛋白质在多种生物学过程中发挥作用,包括RNA合成、剪接、稳定性和细胞代谢。Scaf1基因变异与自闭症、FSGS、胰腺癌、胃癌、乳腺癌、病毒性肝炎等多种疾病相关,提示Scaf1可能是这些疾病的潜在治疗靶点。此外,Scaf1在呼吸链超复合物形成中也发挥作用,但其具体机制和功能仍需进一步研究。

参考文献:
1. Zhou, Xueya, Feliciano, Pamela, Shu, Chang, Shen, Yufeng, Chung, Wendy K. 2022. Integrating de novo and inherited variants in 42,607 autism cases identifies mutations in new moderate-risk genes. In Nature genetics, 54, 1305-1319. doi:10.1038/s41588-022-01148-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35982159/
2. Wang, Minxian, Chun, Justin, Genovese, Giulio, Mane, Shrikant, Pollak, Martin R. 2019. Contributions of Rare Gene Variants to Familial and Sporadic FSGS. In Journal of the American Society of Nephrology : JASN, 30, 1625-1640. doi:10.1681/ASN.2019020152. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31308072/
3. Martinez, Sebastien, Wu, Shifei, Geuenich, Michael, Elling, Ulrich, Schramek, Daniel. 2024. In vivo CRISPR screens reveal SCAF1 and USP15 as drivers of pancreatic cancer. In Nature communications, 15, 5266. doi:10.1038/s41467-024-49450-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38902237/
4. Yang, Hui, Li, Qingqing, Chen, Xingxing, Sun, Yangbai, Ma, Mingzhe. 2024. Targeting SOX13 inhibits assembly of respiratory chain supercomplexes to overcome ferroptosis resistance in gastric cancer. In Nature communications, 15, 4296. doi:10.1038/s41467-024-48307-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38769295/
5. García-Poyatos, Carolina, Cogliati, Sara, Calvo, Enrique, Mercader, Nadia, Enríquez, José Antonio. 2020. Scaf1 promotes respiratory supercomplexes and metabolic efficiency in zebrafish. In EMBO reports, 21, e50287. doi:10.15252/embr.202050287. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32496654/
6. Adamopoulos, Panagiotis G, Raptis, Georgios D, Kontos, Christos K, Scorilas, Andreas. 2018. Discovery and expression analysis of novel transcripts of the human SR-related CTD-associated factor 1 (SCAF1) gene in human cancer cells using Next-Generation Sequencing. In Gene, 670, 155-165. doi:10.1016/j.gene.2018.05.044. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29787824/
7. Cava, Claudia, Pisati, Mirko, Frasca, Marco, Castiglioni, Isabella. 2021. Identification of Breast Cancer Subtype-Specific Biomarkers by Integrating Copy Number Alterations and Gene Expression Profiles. In Medicina (Kaunas, Lithuania), 57, . doi:10.3390/medicina57030261. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33809336/
8. Bhandare, Pranjali, Narain, Ashwin, Hofstetter, Julia, Erhard, Florian, Wolf, Elmar. . Phenotypic screens identify SCAF1 as critical activator of RNAPII elongation and global transcription. In Nucleic acids research, 53, . doi:10.1093/nar/gkae1219. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39698826/
9. Real, Luis M, Caruz, Antonio, Rivero-Juarez, Antonio, Macías, Juan, Pineda, Juan A. 2013. A polymorphism linked to RRAS, SCAF1, IRF3 and BCL2L12 genes is associated with cirrhosis in hepatitis C virus carriers. In Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver, 34, 558-66. doi:10.1111/liv.12330. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24131527/
10. Davoudi, Mina, Kotarsky, Heike, Hansson, Eva, Kallijärvi, Jukka, Fellman, Vineta. 2016. COX7A2L/SCAFI and Pre-Complex III Modify Respiratory Chain Supercomplex Formation in Different Mouse Strains with a Bcs1l Mutation. In PloS one, 11, e0168774. doi:10.1371/journal.pone.0168774. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27997587/