Ythdc1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ythdc1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07452

品系全称

C57BL/6JCya-Ythdc1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-231386-Ythdc1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ythdc1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07452) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
YTH domain containing 1
基因别称
A730098D12Rik,mKIAA1966
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_177680 | Ensembl: ENSMUST00000038384
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 5~7
敲除长度
~2.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2443713Mice homozygous for a null allele die between E8.5 and E11.5. Mice homozygous for a cconditional allele activated after embryonic development exhibit infertility with defects in spermatogenesis and oogenesis associated with RNA granules and altered transcription in oocytes.
Ythdc1(YTH domain containing 1)基因编码一种RNA结合蛋白,属于YTH结构域蛋白家族。YTH结构域蛋白是一类具有YTH结构域的RNA结合蛋白,能够识别并结合N6-甲基腺苷(m6A)修饰的RNA。m6A是RNA上的一种重要的表观遗传修饰,广泛存在于真核生物的RNA上,参与调控RNA的稳定性和功能,影响基因表达和生物学过程。

Ythdc1蛋白主要在细胞核中表达,具有多个结构域,包括YTH结构域、RNA识别模体(RRM)结构域和低复杂性区域(LCR)。YTH结构域是Ythdc1蛋白的核心结构域,负责识别并结合m6A修饰的RNA。RRM结构域参与RNA的结合和调控。LCR结构域参与蛋白与蛋白之间的相互作用。

Ythdc1蛋白在多种生物学过程中发挥重要作用,包括:

1. 调控mRNA剪接:Ythdc1蛋白能够识别并结合m6A修饰的mRNA,通过招募和调节mRNA剪接因子,影响mRNA的剪接模式,进而影响蛋白质的表达和功能[1]。

2. 基因表达重编程:Ythdc1蛋白与染色质相关,能够识别并结合m6A修饰的RNA,通过影响基因表达,参与细胞对热应激等刺激的响应[2]。

3. 肿瘤发生和进展:Ythdc1基因的多态性与多种肿瘤的易感性相关,例如神经母细胞瘤和肝母细胞瘤[3,7]。Ythdc1蛋白能够识别并结合m6A修饰的RNA,通过影响基因表达和蛋白质的功能,参与肿瘤的发生和进展。

4. 细胞衰老和纤维化:Ythdc1蛋白能够通过非m6A依赖的方式,激活DNA损伤修复通路,延缓细胞衰老和纤维化的发生[5]。

5. 胚胎干细胞(ES)维持:Ythdc1蛋白能够识别并结合m6A修饰的RNA,通过抑制转座子的活性和组蛋白修饰,维持ES细胞的身份和功能[6]。

6. 卵母细胞发育:Ythdc1蛋白在卵母细胞发育过程中发挥重要作用,通过调节mRNA的剪接和3'端加尾,影响卵母细胞的生长和成熟[8]。

7. 自噬调控:Ythdc1蛋白能够识别并结合m6A修饰的RNA,通过调节SQSTM1蛋白的表达和自噬通量,影响细胞的自噬过程[4]。

综上所述,Ythdc1蛋白是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控mRNA剪接、基因表达、肿瘤发生、细胞衰老、胚胎干细胞维持、卵母细胞发育和自噬等生物学过程。深入研究Ythdc1蛋白的生物学功能和作用机制,有助于揭示RNA表观遗传修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Xiao, Wen, Adhikari, Samir, Dahal, Ujwal, Zhao, Yong-Liang, Yang, Yun-Gui. 2016. Nuclear m(6)A Reader YTHDC1 Regulates mRNA Splicing. In Molecular cell, 61, 507-519. doi:10.1016/j.molcel.2016.01.012. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26876937/
2. Timcheva, Kalina, Dufour, Solenne, Touat-Todeschini, Leila, Seigneurin-Berny, Daphné, Verdel, André. . Chromatin-associated YTHDC1 coordinates heat-induced reprogramming of gene expression. In Cell reports, 41, 111784. doi:10.1016/j.celrep.2022.111784. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36516773/
3. Li, Yong, Lu, Tongyi, Wang, Jian, He, Jing, Li, Aiwu. 2021. YTHDC1 gene polymorphisms and neuroblastoma susceptibility in Chinese children. In Aging, 13, 25426-25439. doi:10.18632/aging.203760. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34897032/
4. Liang, Diefei, Lin, Wei-Jye, Ren, Meng, Yan, Li, Wang, Wei. 2021. m6A reader YTHDC1 modulates autophagy by targeting SQSTM1 in diabetic skin. In Autophagy, 18, 1318-1337. doi:10.1080/15548627.2021.1974175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34657574/
5. Zhang, Canfeng, Chen, Liping, Xie, Chen, Zhao, Yong, Liu, Haiying. 2023. YTHDC1 delays cellular senescence and pulmonary fibrosis by activating ATR in an m6A-independent manner. In The EMBO journal, 43, 61-86. doi:10.1038/s44318-023-00003-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38177310/
6. Liu, Jiadong, Gao, Mingwei, He, Jiangping, Bao, Xichen, Chen, Jiekai. 2021. The RNA m6A reader YTHDC1 silences retrotransposons and guards ES cell identity. In Nature, 591, 322-326. doi:10.1038/s41586-021-03313-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33658714/
7. Chen, Huitong, Li, Yong, Li, Li, Xia, Huimin, He, Jing. 2020. YTHDC1 gene polymorphisms and hepatoblastoma susceptibility in Chinese children: A seven-center case-control study. In The journal of gene medicine, 22, e3249. doi:10.1002/jgm.3249. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32729171/
8. Kasowitz, Seth D, Ma, Jun, Anderson, Stephen J, Schultz, Richard M, Wang, P Jeremy. 2018. Nuclear m6A reader YTHDC1 regulates alternative polyadenylation and splicing during mouse oocyte development. In PLoS genetics, 14, e1007412. doi:10.1371/journal.pgen.1007412. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29799838/