Ttc39a-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Ttc39a-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07350

品系全称

C57BL/6JCya-Ttc39aem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-230603-Ttc39a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ttc39a-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07350) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tetratricopeptide repeat domain 39A
基因别称
4922503N01Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001145948.1 | Ensembl: ENSMUST00000106618
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 9
敲除长度
~572 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Ttc39a,全称为tetratricopeptide repeat domain protein 39A,是一种结构家族为tetratrico-peptide domain proteins的基因。Ttc39a在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。近年来,Ttc39a在癌症领域的功能研究逐渐受到关注。

在乳腺癌中,Ttc39a antisense RNA 1(TTC39A-AS1)的表达水平升高,与患者的总生存期缩短相关。TTC39A-AS1在乳腺癌细胞中发挥促进肿瘤发生的作用,通过竞争性内源RNA(ceRNA)机制,与microRNA-483-3p(miR-483-3p)结合,从而间接上调MTA2的表达。MTA2是转移相关基因,参与调节细胞增殖、迁移和侵袭。TTC39A-AS1的缺失可以加速细胞凋亡,但保留细胞增殖、迁移和侵袭的能力。抑制miR-483-3p或上调MTA2可以逆转TTC39A-AS1敲低对乳腺癌细胞恶性特征的抑制作用。这一发现揭示了TTC39A-AS1/miR-483-3p/MTA2通路在乳腺癌肿瘤发生中的关键调控作用,为乳腺癌的抗癌治疗提供了新的治疗方向[1]。

此外,Ttc39a的表达与多种癌症的预后和临床特征相关。在33种癌症中,Ttc39a的表达水平普遍高于对应正常组织。对于LGG、LIHC和SKCM三种癌症患者,Ttc39a的高表达预示着更差的总体生存期。Ttc39a的表达与LGG、LIHC和SKCM中某些免疫细胞的免疫浸润相关。此外,Ttc39a的表达水平与某些免疫细胞的免疫浸润水平相结合,可以影响这三种癌症患者的总体生存期。功能富集分析和基因集富集分析(GSEA)表明,Ttc39a可能在多种生物学过程中发挥作用[2]。

在非酒精性脂肪性肝炎(NASH)向肝细胞癌(HCC)的进展过程中,Ttc39a也被证明是一种关键基因。通过转录组分析,Ttc39a被确定为影响HCC预后的四个核心基因之一。这四个核心基因可能作为关键生物标志物,推动NASH向HCC的进展,为NASH进展的诊断和治疗提供了新的靶点[3]。

在2型糖尿病(T2D)的研究中,Ttc39a被确定为Nidd/DBA定量性状位点(QTL)上的候选基因之一。Nidd/DBA QTL与高血糖、低胰岛素水平和β细胞丢失相关。Ttc39a在胰腺胰岛中的表达存在差异,可能是T2D的候选基因。这表明Ttc39a可能在β细胞功能和维持血糖控制方面发挥重要作用[4]。

综上所述,Ttc39a在多种疾病中发挥重要作用,包括乳腺癌、NASH、HCC和T2D。Ttc39a可能通过竞争性内源RNA机制、影响免疫微环境和参与多种生物学过程,影响疾病的发生和发展。进一步研究Ttc39a的生物学功能和机制,有助于深入理解疾病的发生机制,为疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhou, Zhaohui, Yang, Ping, Zhang, Binming, Bai, Haiya, Gong, Xiaojun. 2021. Long Noncoding RNA TTC39A-AS1 Promotes Breast Cancer Tumorigenicity by Sponging MicroRNA-483-3p and Thereby Upregulating MTA2. In Pharmacology, 106, 573-587. doi:10.1159/000515909. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34488224/
2. Li, Jie, Wang, Chao, Wang, Jianguo. . The Role of TTC39A in Modulating the Immune Microenvironment and Its Impact on Cancer Prognosis. In Clinical laboratory, 71, . doi:10.7754/Clin.Lab.2024.240923. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39967535/
3. Fan, Hui, Wang, Rong, Wen, Bin, Xiong, Jing. 2024. Biomarkers and potential therapeutic targets driving progression of non-alcoholic steatohepatitis to hepatocellular carcinoma predicted through transcriptomic analysis. In Frontiers in immunology, 15, 1502263. doi:10.3389/fimmu.2024.1502263. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39697329/
4. Aga, Heja, Hallahan, Nicole, Gottmann, Pascal, Schürmann, Annette, Vogel, Heike. 2020. Identification of Novel Potential Type 2 Diabetes Genes Mediating β-Cell Loss and Hyperglycemia Using Positional Cloning. In Frontiers in genetics, 11, 567191. doi:10.3389/fgene.2020.567191. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33133152/