Clcc1-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Clcc1-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07287

品系全称

C57BL/6JCya-Clcc1em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-229725-Clcc1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Clcc1-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07287) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
chloride channel CLIC-like 1
基因别称
ERAC1,Mclc
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001177771 | Ensembl: ENSMUST00000029483
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 6~8
敲除长度
~3.8 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2385186Mice homozygous for a spontaneous mutation show strain-dependent cerebellar granule cell death and peripheral motor axon degeneration. The peripheral neuropathy, neurogenic muscular atrophy and mild truncal ataxia observed on the C57BL/6J background are not found on the C3H/HeSnJ background.
CLCC1,也称为氯离子通道CLIC-like 1,是一种编码氯离子通道蛋白的基因。氯离子通道蛋白在细胞内氯离子浓度的调节中发挥着重要作用,而氯离子浓度的平衡对细胞功能至关重要。CLCC1蛋白主要定位于内质网(ER),并参与了多种生理和病理过程。

CLCC1基因的突变与多种疾病相关。研究发现,CLCC1基因的突变与肌萎缩侧索硬化症(ALS)有关。在一项研究中,研究人员通过全外显子测序,在中国中南部的1005名ALS患者和1224名健康对照者中筛选了CLCC1基因的罕见有害变异。他们发现了四个异合子错义变异,这些变异在四个无血缘关系的散发性ALS患者中被发现,并被预测为潜在致病性。这些变异包括c.A275C (p.Q92P)、c.G1139A (p.R380K)、c.C1244T (p.T415M)和c.G1328A (p.R443Q)。这些变异似乎与一组相似的临床特征相关,包括发病年龄较早、进展迅速、脊髓起病和对认知状态的脆弱性。然而,统计结果显示,CLCC1基因与ALS的风险在基因水平或单个变异水平上没有关联。这些发现进一步扩展了CLCC1相关ALS的遗传和临床谱,并为阴离子通道在ALS发病机制中的作用提供了更多遗传证据[1]。

此外,CLCC1基因的突变还与视网膜色素变性(RP)有关。研究发现,一个特定的CLCC1突变c.75C>A (p.D25E)与RP有关。该突变仅在巴基斯坦的患者中发现,并且所有携带该突变的患者都共享一个共同的SNP单倍型,表明这是一个共同的祖先突变。这个突变的年龄估计在2000-5000年前,并且已经传递给巴基斯坦血统的受影响家庭,这些家庭分布在世界上不同的地理位置。这个突变是目前为止在CLCC1中唯一与RP相关的突变,表明CLCC1基因受到高度的限制,这可能是由于在胚胎发育过程中对该基因的功能需求[2]。

CLCC1基因的缺失也与神经退行性疾病有关。研究发现,CLCC1基因的缺失导致内质网应激、错误折叠的蛋白质积累和神经退行性变。在实验中,研究人员发现了一个自发的隐性小鼠突变,导致进行性小脑颗粒细胞死亡和周围运动轴突退行性变。通过定位克隆,他们确定了这个突变位于CLCC1基因中,该基因编码一个定位于ER的假设氯离子通道。此外,研究人员发现,在急性下调CLCC1表达的情况下,细胞对内质网应激的敏感性增加。这些数据表明,ER中氯离子稳态的破坏会破坏ER的蛋白质折叠能力,最终导致神经元死亡[3]。

除了上述疾病,CLCC1基因还与其他生物学过程有关。研究发现,一个名为PIGBOS的线粒体微蛋白可以调节内质网应激反应。PIGBOS定位于线粒体外膜,并在ER-线粒体接触位点上与ER蛋白CLCC1相互作用。功能研究表明,PIGBOS的缺失导致内质网应激反应增强和细胞死亡增加。这项研究揭示了微蛋白在调节ER应激反应中的新作用,并表明微蛋白是细胞器间通讯、稳态和细胞生存中一个被忽视的基因类别[4]。

CLCC1基因还与胆盐摄取有关。研究发现,脂筏成分Stomatin与钠牛磺胆酸共转运蛋白(NTCP)相互作用,并调节胆盐的摄取。通过质谱分析,研究人员发现CLCC1和Stomatin是NTCP的相互作用蛋白。进一步的研究表明,Stomatin的过表达和敲低都会增加NTCP介导的牛磺胆酸的摄取,而NTCP在质膜上的丰度仅在Stomatin耗尽的细胞中增加。这些发现表明Stomatin是NTCP的相互作用蛋白,并且Stomatin的相互作用调节胆盐转运[5]。

除了与疾病相关,CLCC1基因的表达还受到RNA编辑的影响。研究发现,基于A-to-I RNA编辑的评分可以预测肺鳞状细胞癌(LUSC)患者的总生存期。研究人员分析了LUSC患者的RNA编辑谱、基因表达数据和相应的临床信息。他们发现,七个RNA编辑位点与较差的总生存期相关,包括CLCC1基因上的一个编辑位点。这表明RNA编辑在LUSC的生存预测中发挥作用,并且基于RNA编辑的模型可能成为LUSC生存预测的新工具[6]。

此外,CLCC1基因的表达还受到基因多态性的影响。研究发现,CLCC1基因的SNP rs12305038与阿片类药物治疗的癌症患者的恶心和呕吐强度相关。这项研究结果表明,基因因素与阿片类药物治疗的癌症患者的恶心和呕吐有关,但单个多态性的作用可能较弱[7]。

CLCC1基因的表达还受到基因组拷贝数变异(CNV)的影响。研究发现,CLCC1基因所在的基因组区域与抗炭疽疫苗吸附的抗体反应相关。这项研究结果表明,基因组CNV可能对免疫反应有影响[8]。

综上所述,CLCC1基因编码的氯离子通道蛋白在细胞内氯离子浓度的调节中发挥着重要作用,并参与了多种生理和病理过程。CLCC1基因的突变与ALS、RP和神经退行性疾病有关,而CLCC1基因的表达受到RNA编辑和基因多态性的影响。此外,CLCC1基因还与其他生物学过程有关,包括内质网应激反应和胆盐摄取。CLCC1基因的研究有助于深入理解氯离子通道的功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Tang, Linxin, Tang, Xuxiong, Zhao, Qianqian, Yuan, Yanchun, Wang, Junling. 2023. Mutation and clinical analysis of the CLCC1 gene in amyotrophic lateral sclerosis patients from Central South China. In Annals of clinical and translational neurology, 11, 79-88. doi:10.1002/acn3.51934. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37916886/
2. Ma, Yan, Wang, Xun, Shoshany, Nadav, Crosby, Andrew H, Hejtmancik, J Fielding. 2022. CLCC1 c. 75C>A Mutation in Pakistani Derived Retinitis Pigmentosa Families Likely Originated With a Single Founder Mutation 2,000-5,000 Years Ago. In Frontiers in genetics, 13, 804924. doi:10.3389/fgene.2022.804924. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35391798/
3. Jia, Yichang, Jucius, Thomas J, Cook, Susan A, Ackerman, Susan L. . Loss of Clcc1 results in ER stress, misfolded protein accumulation, and neurodegeneration. In The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience, 35, 3001-9. doi:10.1523/JNEUROSCI.3678-14.2015. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25698737/
4. Chu, Qian, Martinez, Thomas F, Novak, Sammy Weiser, Manor, Uri, Saghatelian, Alan. 2019. Regulation of the ER stress response by a mitochondrial microprotein. In Nature communications, 10, 4883. doi:10.1038/s41467-019-12816-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31653868/
5. Appelman, Monique D, Robin, Marion J D, Vogels, Esther W M, Burgering, Boudewijn M T, Van de Graaf, Stan F J. 2020. The Lipid Raft Component Stomatin Interacts with the Na+ Taurocholate Cotransporting Polypeptide (NTCP) and Modulates Bile Salt Uptake. In Cells, 9, . doi:10.3390/cells9040986. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32316189/
6. Liu, Li, Liu, Jun, Deng, Xiaoliang, Xie, Chenli, Yang, Lei. 2022. A nomogram based on A-to-I RNA editing predicting overall survival of patients with lung squamous carcinoma. In BMC cancer, 22, 715. doi:10.1186/s12885-022-09773-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35768804/
7. Colombo, Francesca, Pintarelli, Giulia, Galvan, Antonella, Gambacorti-Passerini, Carlo, Caraceni, Augusto Tommaso. 2020. Identification of genetic polymorphisms modulating nausea and vomiting in two series of opioid-treated cancer patients. In Scientific reports, 10, 542. doi:10.1038/s41598-019-57358-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31953506/
8. Falola, Michael I, Wiener, Howard W, Wineinger, Nathan E, Tang, Jianming, Shrestha, Sadeep. 2013. Genomic copy number variants: evidence for association with antibody response to anthrax vaccine adsorbed. In PloS one, 8, e64813. doi:10.1371/journal.pone.0064813. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23741398/