Fhip1a-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Fhip1a-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07249

品系全称

C57BL/6JCya-Fhip1aem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-229488-Fhip1a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Fhip1a-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07249) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
FHF complex subunit HOOK interacting protein 1A
基因别称
9930021J17Rik,Fam160a1
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172682.3 | Ensembl: ENSMUST00000118408
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 7
敲除长度
~580 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2444746Mice homozygous for a knock-out allele exhibit defects in placentation with abnormal trophoblast layer formation, abnormal trophoblast giant cell size and morphology, and complete lethality throughout fetal growth and development.
FHIP1A,也称为FHIP1A-DT,是一种长链非编码RNA(lncRNA)。lncRNA是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA,它们不编码蛋白质,但通过多种机制参与基因表达调控。FHIP1A-DT是通过发散转录产生的,其机制在泛癌和结直肠癌(CRC)中的研究尚不清楚。

FHIP1A-DT在泛癌和结直肠癌中的表达存在差异,并且在结直肠癌中,FHIP1A-DT的表达与临床分期、诊断、预后和免疫特征相关。研究表明,FHIP1A-DT在泛癌中具有优秀的诊断和预后能力。此外,FHIP1A-DT与泛癌的肿瘤突变负荷(TMB)、微卫星不稳定性(MSI)和免疫细胞含量相关。在结直肠癌中,FHIP1A-DT的表达下调,且FHIP1A-DT低表达的结直肠癌患者预后较差。结合FHIP1A-DT表达构建的列线图显示出良好的预后预测能力。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析表明,FHIP1A-DT与表观遗传修饰相关,并调节许多与癌症相关的通路。竞争性内源RNA(ceRNA)网络分析揭示了FHIP1A-DT的潜在基因调控作用。FHIP1A-DT与多种化疗药物敏感性相关,并与CD4记忆静息T细胞、单核细胞、浆细胞、中性粒细胞和M2巨噬细胞等免疫细胞浸润相关。此外,外部数据集GSE17538和GSE39582以及qPCR的结果验证了FHIP1A-DT在结直肠癌中的表达和预后分析。FHIP1A-DT是一种新的与结直肠癌相关的lncRNA,与结直肠癌的诊断、预后和治疗敏感性相关,有望成为结直肠癌的重要生物标志物[1]。

除了在癌症中的作用外,FHIP1A-DT还与血脂性状相关。研究表明,在撒哈拉以南非洲人群中,FHIP1A-DT与低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和甘油三酯水平相关。通过GWAS分析,研究人员在GATB/FHIP1A区域发现了一个新的LDL-C关联信号,并在FHIT基因附近发现了一个新的甘油三酯关联信号。这些发现为血脂性状的遗传结构提供了新的见解,并强调了非洲人群数据在新型发现中的重要性[2]。

综上所述,FHIP1A-DT是一种重要的长链非编码RNA,在癌症和血脂性状中发挥重要作用。FHIP1A-DT的表达与结直肠癌的诊断、预后和治疗敏感性相关,有望成为结直肠癌的重要生物标志物。此外,FHIP1A-DT还与血脂性状相关,参与调节LDL-C和甘油三酯水平。这些发现为FHIP1A-DT的研究提供了新的方向,并为相关疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略[1,2]。

参考文献:
1. Yang, Yongjun, Xiong, Zuming, Li, Wenxin, Huang, Wei, Zhang, Sen. 2023. FHIP1A-DT is a potential novel diagnostic, prognostic, and therapeutic biomarker of colorectal cancer: A pan-cancer analysis. In Biochemical and biophysical research communications, 679, 191-204. doi:10.1016/j.bbrc.2023.08.059. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37703762/
2. Choudhury, Ananyo, Brandenburg, Jean-Tristan, Chikowore, Tinashe, Hazelhurst, Scott, Ramsay, Michèle. 2022. Meta-analysis of sub-Saharan African studies provides insights into genetic architecture of lipid traits. In Nature communications, 13, 2578. doi:10.1038/s41467-022-30098-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35546142/