Gatb-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Gatb-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07248

品系全称

C57BL/6JCya-Gatbem1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-229487-Gatb-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gatb-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07248) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B
基因别称
9430026F02Rik,Pet112,Pet112l
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_144896.4 | Ensembl: ENSMUST00000127348
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~5
敲除长度
~1257 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Gatb,即Glutaminyl-tRNA amidotransferase B亚基,是一种重要的酶,参与tRNA的修饰过程。在许多生物体中,GatB与GatA亚基形成复合物,共同催化tRNA中谷氨酰基团转移到氨酰基团,从而形成Gln-tRNA,为蛋白质合成提供必要的氨基酸。GatB在不同生物体中具有相似的功能,但其结构和表达模式可能有所不同。

在Wolbachia细菌中,GatB基因被用于进行系统发育分析。例如,在一项关于Wolbachia在新型宿主Ceratozetes thienemanni中的发生的研究中,GatB基因序列被用于构建系统发育树,结果显示这些细菌属于Wolbachia组E,与弹尾目宿主和Gustavia microcephala中的内共生菌具有相似性[1]。这表明GatB基因在Wolbachia细菌的分类和进化研究中具有重要作用。

在Mycoplasma hyopneumoniae中,GatB基因被选为内部参考基因,用于RT-qPCR分析中的数据标准化。通过使用geNorm、BestKeeper和NormFinder软件进行表达稳定性分析,发现GatB基因是不同毒力菌株在不同生长阶段的最佳内部参考基因[2]。这表明GatB基因在Mycoplasma hyopneumoniae基因表达分析中具有重要的参考价值。

在Bacillus siamensis 1021中,GatB_Yqey基因被用于验证基因表达分析的参考基因。通过使用geNorm和Normfinder应用程序分析基因表达稳定性,发现GatB_Yqey基因与其他三个基因(ssb、gyrA和gyrB)的组合最适合用于标准化目标基因ftsZ的表达[3]。这表明GatB基因在Bacillus siamensis 1021基因表达分析中也具有重要的参考价值。

在Bacillus cereus群菌株中,GatB_Yqey基因被选为内部参考基因,用于RT-qPCR分析中的数据标准化。通过使用geNorm和Normfinder软件进行表达稳定性分析,发现GatB_Yqey基因是整个细菌生命周期中最稳定表达的参考基因之一[4]。这表明GatB基因在Bacillus cereus群菌株基因表达分析中也具有重要的参考价值。

在Plasmodium falciparum中,GatB基因与GatA基因共同构成GatAB复合物,参与tRNA的修饰过程。研究表明,GatAB复合物对于红细胞阶段的寄生虫是必需的,因为无法在红细胞阶段寄生虫中删除编码GatA的基因[5]。这表明GatB基因在Plasmodium falciparum中具有重要的生物学功能。

在人类中,GATB基因位于染色体2上,编码GatB蛋白。研究发现,GATB基因与自杀意念和行为(SITB)相关。一项全基因组关联研究(GWAS)发现,GATB基因区域存在与SITB相关的遗传风险位点[6]。这表明GATB基因在人类SITB的发生和发展中可能发挥重要作用。

综上所述,基因Gatb在不同生物体中具有重要的生物学功能,参与tRNA的修饰过程,影响蛋白质合成。GatB基因在Wolbachia细菌的分类和进化研究中具有重要作用,并且在Mycoplasma hyopneumoniae、Bacillus siamensis 1021、Bacillus cereus群菌株和Plasmodium falciparum基因表达分析中具有重要的参考价值。此外,GATB基因与人类SITB的发生和发展也相关。深入研究GatB基因的功能和表达调控机制,有助于更好地理解其在生物体中的重要作用,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Konecka, Edyta, Olszanowski, Ziemowit. 2019. Phylogenetic analysis based on the 16S rDNA, gltA, gatB, and hcpA gene sequences of Wolbachia from the novel host Ceratozetes thienemanni (Acari: Oribatida). In Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases, 70, 175-181. doi:10.1016/j.meegid.2019.01.032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30708135/
2. Li, Shiyang, Zhou, Yanqing, Yuan, Ting, Yu, Yanfei, Yuan, Xiaomin. 2022. Selection of internal reference gene for normalization of reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction analysis in Mycoplasma hyopneumoniae. In Frontiers in veterinary science, 9, 934907. doi:10.3389/fvets.2022.934907. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35937288/
3. Nuwong, Warinya, Kittiwongwattana, Chokchai. . Validation of reference genes for the normalization of RT-qPCR gene expression in Bacillus siamensis 1021 grown in different culture media. In Iranian journal of microbiology, 14, 194-202. doi:10.18502/ijm.v14i2.9188. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35765559/
4. Reiter, Lillian, Kolstø, Anne-Brit, Piehler, Armin P. 2011. Reference genes for quantitative, reverse-transcription PCR in Bacillus cereus group strains throughout the bacterial life cycle. In Journal of microbiological methods, 86, 210-7. doi:10.1016/j.mimet.2011.05.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21620905/
5. Kimbrel, Nathan A, Ashley-Koch, Allison E, Qin, Xue J, Hauser, Elizabeth R, Hauser, Michael A. . Identification of Novel, Replicable Genetic Risk Loci for Suicidal Thoughts and Behaviors Among US Military Veterans. In JAMA psychiatry, 80, 135-145. doi:10.1001/jamapsychiatry.2022.3896. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36515925/
6. Mailu, Boniface M, Li, Ling, Arthur, Jen, Becker, Katja, Gardner, Malcolm J. 2015. Plasmodium Apicoplast Gln-tRNAGln Biosynthesis Utilizes a Unique GatAB Amidotransferase Essential for Erythrocytic Stage Parasites. In The Journal of biological chemistry, 290, 29629-41. doi:10.1074/jbc.M115.655100. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26318454/