Nudt6-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Nudt6-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07234

品系全称

C57BL/6JCya-Nudt6em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-229228-Nudt6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Nudt6-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07234) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
nudix hydrolase 6
基因别称
Asfgf2b
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001291044.1 | Ensembl: ENSMUST00000052645
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~556 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Nudt6(Nudix型基序6)基因是纤维母细胞生长因子-2(FGF2)基因的反义链编码的蛋白质。Nudt6属于细胞质Nudix水解酶家族基因,参与多种生物学过程,包括细胞增殖、炎症反应和神经发生。Nudt6的表达和功能在多种疾病中发挥重要作用,包括抑郁症、肥胖症、癌症和自身免疫性疾病。

根据Uzay等人(2024)的研究,海马体中Nudt6的过度表达导致大鼠出现抑郁样行为,而FGF2水平和下游效应因子Akt和ERK1/2没有改变。Nudt6通过诱导炎症信号通路发挥作用,具体表现为增加S100钙结合蛋白A9(S100A9)水平、激活核因子-κB-p65(NF-κB-p65)以及升高小胶质细胞数量,同时减少神经发生。这些结果表明,Nudt6可能通过诱导促炎状态在抑郁症中发挥重要作用。这是第一份关于反义蛋白通过不同于其同源蛋白的机制起作用的报道[1]。

Sun等人(2011)的研究发现,Nudt6基因在猪的心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏、肌肉和脂肪组织中均有表达。实时PCR结果显示,Nudt6和FGF2在通城猪和约克夏猪的心脏、肝脏、脾脏、肺、肾脏和脂肪组织中的表达模式相反。Nudt6基因中的C/T单核苷酸多态性与肌肉内脂肪百分比和肌肉内脂质含量相关,表明Nudt6可能是猪脂肪沉积的候选基因[2]。

Sukhthankar等人(2009)的研究发现,绿茶中的表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)可以抑制Nudt6的表达。EGCG通过降低Nudt6的RNA稳定性来抑制Nudt6的表达,这一作用至少部分是通过ERK和p38MAPK信号通路介导的。Nudt6过表达的细胞中细胞增殖和细胞生长增加,表明Nudt6是一个潜在的增殖基因。这些发现揭示了绿茶儿茶素抑制增殖基因Nudt6的新机制[3]。

McEachern和Murphy(2014)的研究表明,FGF2和Nudt6之间存在强烈的负相关。敲低Nudt6导致FGF2转录本的增加,包括一个与Nudt6没有序列互补的短FGF2变体,表明转录机制参与了这一过程。组蛋白乙酰化水平的变化会影响Nudt6和FGF2的mRNA水平,表明组蛋白乙酰化和其他染色质修饰因子在决定FGF2和Nudt6的相对水平方面起着重要作用[4]。

Baguma-Nibasheka等人(2012)的研究发现,Nudt6和FGF2在细胞中是共表达的。Nudt6的过表达抑制了细胞中FGF2的积累和细胞周期进展。敲低FGF2或Nudt6的mRNA会导致互补RNA的显著增加,表明这两个转录本是相互调节的。敲低FGF2或Nudt6显著降低了细胞增殖并抑制了血清剥夺后的S期再进入,表明FGF2和Nudt6参与细胞转化和细胞周期进展的调节[5]。

Tian等人(2020)的研究发现,Nudt6是胃癌患者免疫相关基因签名的一部分,与患者生存率相关。这项研究为具有不同微卫星不稳定性状态的胃癌患者提供了新的治疗和免疫治疗靶点[6]。

Wang等人(2012)的研究表明,AtNUDT7和AtNUDT6是SNC1的负调节因子,SNC1是一种TIR-NB-LRR型R基因。nudt6-2 nudt7双突变体表现出由温度调节的自身免疫表型,完全依赖于EDS1。nudt6-2 nudt7突变导致EDS1在自身免疫建立后不久核积累。nudt6-2 nudt7中生长介质中铵/硝酸盐比率的降低导致一氧化氮(NO)的产生增加,NO与EDS1形成正反馈回路以促进自身免疫。低铵/硝酸盐比率还增强了snc1-1和cpr1,两种其他拟南芥自身免疫突变体的自身免疫[7]。

Huo等人(2017)的研究发现,NEK4基因在结直肠癌的不同阶段表达差异显著。此外,Nudt6等11个基因在结直肠癌的不同阶段表达差异显著,这些基因与核小体、DNA包装复合物和蛋白质-DNA相互作用等基因本体术语相关[8]。

Yang等人(2023)的研究发现,Nudt6是骨肉瘤免疫相关预后签名的一部分,与患者生存率相关。Nudt6与其他4个免疫相关基因一起构建了一个预后签名模型,该模型在骨肉瘤中具有显著的预后价值。不同基因水平的组间免疫浸润和免疫治疗反应存在显著差异[9]。

Dzafic等人(2014)的研究发现,与骨髓来源的间充质干细胞(BM-MSCs)和成纤维细胞相比,从无生育能力妇女的卵泡抽吸物中获得的卵泡抽吸细胞(AFCs)中Nudt6的表达下调。Nudt6下调的AFCs在体外成功分化为脂肪细胞、成骨细胞和胰腺样细胞,表明AFCs中存在具有特定干细胞特性的亚群[10]。

综上所述,Nudt6基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、炎症反应和神经发生。Nudt6的表达和功能在多种疾病中发挥重要作用,包括抑郁症、肥胖症、癌症和自身免疫性疾病。Nudt6的研究有助于深入理解反义RNA的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Uzay, Burak, Bahadır-Varol, Aslıhan, Hökelekli, Fatma Özlem, Dalkara, Turgay, Eren-Koçak, Emine. 2024. FGF2 gene's antisense protein, NUDT6, plays a depressogenic role by promoting inflammation and suppressing neurogenesis without altering FGF2 signalling. In The Journal of physiology, 602, 1427-1442. doi:10.1113/JP285479. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38468384/
2. Sun, Ling, Yu, Shaobo, Wang, Hongyang, Fan, Bin, Liu, Bang. 2011. NUDT6, the FGF-2's antisense gene, showed associations with fat deposition related traits in pigs. In Molecular biology reports, 39, 4119-26. doi:10.1007/s11033-011-1194-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21786158/
3. Sukhthankar, Mugdha, Choi, Chang K, English, Anthony, Kim, Jong-Sik, Baek, Seung Joon. 2009. A potential proliferative gene, NUDT6, is down-regulated by green tea catechins at the posttranscriptional level. In The Journal of nutritional biochemistry, 21, 98-106. doi:10.1016/j.jnutbio.2008.11.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19157820/
4. McEachern, Lori A, Murphy, Paul R. 2014. Chromatin-remodeling factors mediate the balance of sense-antisense transcription at the FGF2 locus. In Molecular endocrinology (Baltimore, Md.), 28, 477-89. doi:10.1210/me.2013-1220. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24552587/
5. Baguma-Nibasheka, Mark, Macfarlane, Leigh Ann, Murphy, Paul R. 2012. Regulation of fibroblast growth factor-2 expression and cell cycle progression by an endogenous antisense RNA. In Genes, 3, 505-20. doi:10.3390/genes3030505. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24704982/
6. Tian, Ruyue, Hu, Jiexuan, Ma, Xiao, Liang, Lei, Guo, Shuilong. 2020. Immune-related gene signature predicts overall survival of gastric cancer patients with varying microsatellite instability status. In Aging, 13, 2418-2435. doi:10.18632/aging.202271. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33316777/
7. Wang, Hai, Lu, Yuqing, Liu, Pei, Ge, Xiaochun, Xia, Yiji. 2012. The ammonium/nitrate ratio is an input signal in the temperature-modulated, SNC1-mediated and EDS1-dependent autoimmunity of nudt6-2 nudt7. In The Plant journal : for cell and molecular biology, 73, 262-75. doi:10.1111/tpj.12032. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23004358/
8. Huo, Tianyao, Canepa, Ronald, Sura, Andrei, Modave, François, Gong, Yan. 2017. Colorectal cancer stages transcriptome analysis. In PloS one, 12, e0188697. doi:10.1371/journal.pone.0188697. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29182684/
9. Yang, Li, Long, Yi, Xiao, Shengshi. 2023. Osteosarcoma-Associated Immune Genes as Potential Immunotherapy and Prognosis Biomarkers. In Biochemical genetics, 62, 798-813. doi:10.1007/s10528-023-10444-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37452172/
10. Dzafic, Edo, Stimpfel, Martin, Novakovic, Srdjan, Cerkovnik, Petra, Virant-Klun, Irma. 2014. Expression of mesenchymal stem cells-related genes and plasticity of aspirated follicular cells obtained from infertile women. In BioMed research international, 2014, 508216. doi:10.1155/2014/508216. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24724084/