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Snapc4-flox 基因敲除小鼠

Snapc4-flox 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Snapc4-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07091

品系全称

C57BL/6JCya-Snapc4em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-227644-Snapc4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Snapc4-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07091) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
small nuclear RNA activating complex, polypeptide 4
基因别称
5730436L13Rik
染色体号
Chr 2 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_172339.4 | Ensembl: ENSMUST00000035427
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 4~6
敲除长度
~1364 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
SNAPC4，也称为小核RNA-活化复合物多肽4，是SNAPc（小核RNA活化复合物）的一个亚单位，参与snRNA基因的转录过程。SNAPc是一个重要的蛋白质复合物，负责启动snRNA基因的转录，这些snRNA是剪接体的重要组成部分，对于调节和执行剪接反应至关重要。因此，SNAPC4的功能对于维持细胞的正常剪接过程和基因表达调控至关重要。

SNAPC4的变异与多种疾病相关。一项研究发现，SNAPC4的双等位基因变异导致全球选择性剪接失调，进而导致神经退化和进行性痉挛性截瘫。受影响的个体表现出运动发育迟缓，以及一岁后出现发育退化和进行性痉挛，导致步态改变、截瘫和口运动功能障碍。脑MRI显示，大多数个体有大脑、小脑或基底神经节的体积减少。对受影响个体的细胞分析表明，SNAPC4水平降低，这表明双等位基因变异影响了SNAPC4的积累。通过基因组编辑在HeLa细胞系中减少SNAPC4水平导致snRNA表达降低和选择性剪接的全局失调。对受影响个体的成纤维细胞分析也显示snRNA表达降低和选择性剪接的全局失调，与未受影响的细胞相比[1]。

在动物模型中，斑马鱼snapc4突变导致胆管上皮细胞凋亡，进而导致肝内胆管网络的退化。这些突变导致胆管运输荧光脂质到胆囊受阻。Snapc4是调节snRNA转录的蛋白质复合物的最大亚单位。snapc4(s445)突变导致C端截断，从而删除了与Snapc2（SNAP复合物的脊椎动物特异性亚单位）发生特定相互作用的区域。这种突变导致表型减效，因为只有一部分snRNA转录本在snapc4(s445)突变体幼虫中定量改变。snapc2敲低也以类似的方式破坏肝内胆管网络，与snapc4(s445)突变体幼虫中的情况相似。这些数据表明，Snapc2和Snapc4之间的物理相互作用对于表达一组snRNA和斑马鱼胆管上皮细胞存活至关重要[2]。

SNAPC4的变异还与食管梭形细胞鳞状细胞癌（ESS）相关。ESS是一种罕见的双相性肿瘤，由癌成分（CaC）和肉瘤成分（SaC）组成。全外显子测序显示，CaC和SaC具有高度的突变共性，共享相同的突变基因、突变特征和肿瘤突变负荷。SNAPC4是与ESS相关的预后基因之一[3]。

在植物中，拟南芥SNAPc4（AtSNAPc4）是一种4R-MYB型蛋白，具有四个半MYB重复单位。AtSNAPc4作为SNAP复合物的亚单位，参与snRNA基因转录，并且在配子体和合子发育中是必需的。实验证据表明，拟南芥SNAPc亚单位组装成SNAP复合物，并且AtSNAPc4结合到snRNA启动子上。此外，AtSNAPc4的积累与Cajal体相关联，Cajal体在人类中聚集在snRNA基因位点。这些数据表明，snRNA转录起始机制在真核生物进化过程中得到了保守[4]。

SNAPC4的变异还与强直性脊柱炎（AS）相关。一项研究发现，SNAPC4的SNP与AS显著相关。携带SNAPC4 rs11145835 G等位基因与AS风险增加相关，并且与CARD9和SNAPC4在白细胞中的表达降低相关[5]。另一项研究也发现，SNAPC4与AS存在遗传重叠，表明SNAPC4在AS的发病机制中发挥作用[6]。此外，SNAPC4的SNP与伊朗人群中的AS风险相关，支持非MHC致病途径在AS易感性中的作用[7]。

SNAPC4的变异还与炎症性肠病（IBD）相关。一项研究发现，SNAPC4与IBD存在遗传重叠，包括溃疡性结肠炎（UC）和虹膜睫状体炎（IC）。SNAPC4与IBD相关的SNP在m6A修饰位点的附近，表明m6A修饰在IBD的发病机制中可能发挥作用[8]。

综上所述，SNAPC4是一种重要的蛋白质，参与snRNA基因的转录和选择性剪接的调控。SNAPC4的变异与多种疾病相关，包括神经退行性疾病、胆管发育异常、食管癌、强直性脊柱炎和炎症性肠病。SNAPC4的研究有助于深入理解基因表达调控的机制，以及这些机制在疾病发生和发展中的作用。

参考文献：
1. Frost, F Graeme, Morimoto, Marie, Sharma, Prashant, Gahl, William A, Malicdan, May Christine V. 2023. Bi-allelic SNAPC4 variants dysregulate global alternative splicing and lead to neuroregression and progressive spastic paraparesis. In American journal of human genetics, 110, 663-680. doi:10.1016/j.ajhg.2023.03.001. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36965478/
2. Schaub, Madeline, Nussbaum, Justin, Verkade, Heather, Stainier, Didier Y R, Sakaguchi, Takuya F. 2011. Mutation of zebrafish Snapc4 is associated with loss of the intrahepatic biliary network. In Developmental biology, 363, 128-37. doi:10.1016/j.ydbio.2011.12.025. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22222761/
3. Wang, Yulu, Zhu, Qian, Wu, Yaqing, Xiang, Chan, Han, Yuchen. 2024. Multiregion exome sequencing indicates a monoclonal origin of esophageal spindle-cell squamous cell carcinoma. In The Journal of pathology, 264, 55-67. doi:10.1002/path.6324. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39022845/
4. Thiedig, Katharina, Weisshaar, Bernd, Stracke, Ralf. . Functional and evolutionary analysis of the Arabidopsis 4R-MYB protein SNAPc4 as part of the SNAP complex. In Plant physiology, 185, 1002-1020. doi:10.1093/plphys/kiaa067. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33693812/
5. Ma, Xiaochun, Liu, Yongchao, Zhang, Hua, Gong, Yaoqin, Liu, Qiji. 2013. Evidence for genetic association of CARD9 and SNAPC4 with ankylosing spondylitis in a Chinese Han population. In The Journal of rheumatology, 41, 318-24. doi:10.3899/jrheum.130519. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24334645/
6. Liao, Wu, Luo, Qinghua, Zhang, Leichang, Wang, Jiawen, Zuo, Zhengyun. 2024. Genetic overlap between inflammatory bowel disease and iridocyclitis: insights from a genome-wide association study in a European population. In BMC genomic data, 25, 92. doi:10.1186/s12863-024-01274-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39472800/
7. Pointon, J J, Harvey, D, Karaderi, T, Brown, M A, Wordsworth, B P. 2010. Elucidating the chromosome 9 association with AS; CARD9 is a candidate gene. In Genes and immunity, 11, 490-6. doi:10.1038/gene.2010.17. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20463747/
8. Wang, Xiaohui, Wang, Jianfang, Raza, Sayed Haidar Abbas, Almohaimeed, Hailah M, Zan, Linsen. 2022. Identification of the hub genes related to adipose tissue metabolism of bovine. In Frontiers in veterinary science, 9, 1014286. doi:10.3389/fvets.2022.1014286. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36439361/

资料下载

S-CKO-07091_6J_227644_Snapc4_Exon 4~6_A_strategy.pdf
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