Farp2-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Farp2-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-07058

品系全称

C57BL/6JCya-Farp2em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-227377-Farp2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Farp2-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-07058) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
FERM, RhoGEF and pleckstrin domain protein 2
基因别称
D030026M03Rik,Fir,mKIAA0793
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145519.2 | Ensembl: ENSMUST00000120301
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 7
敲除长度
~615 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2385126Mice homozygous for a knock-out allele exhibit slight increase in bone volumetrics and reduced osteoclast differentiation from BMDMs cultured with M-CSF and RANKL
FARP2,也称为FERM, RhoGEF和pleckstrin域蛋白2,是一种编码具有FERM、RhoGEF和pleckstrin域的蛋白质的基因。FARP2蛋白在细胞骨架组织、细胞迁移、信号转导和细胞增殖等生物学过程中发挥重要作用。FERM域参与细胞与细胞外基质的相互作用,RhoGEF域参与调节Rho家族GTP酶的活性,pleckstrin域参与细胞信号转导和细胞骨架组织。

FARP2基因在多种疾病中发挥重要作用,包括高密度脂蛋白胆固醇(HDL)水平、癌症、自闭症、高近视、牙本质再生和神经系统发育。

FARP2基因与HDL水平相关。在一项研究中,研究人员通过生物信息学工具和基因型分析将高密度脂蛋白胆固醇(HDL) QTL Hdlq14缩小到两个基因,FARP2和Stk25[1]。FARP2基因具有一个重要的plekstrin域中的氨基酸多态性,而Stk25基因在亲本品系之间存在显著的表达差异。这些发现表明,FARP2和Stk25基因可能对HDL水平有显著影响。

FARP2基因与癌症风险相关。在一项研究中,研究人员使用生物信息学流程分析了Orang Asli和马来人的全基因组序列数据库,以确定可能增加癌症风险的致病SNPs。他们发现FARP2基因中的rs757978是最具破坏性的癌症致病突变之一。这些突变改变蛋白质的界面并改变相应的蛋白质的变构位点。FARP2基因在细胞增殖、分化、生长和细胞存活等细胞过程中发挥重要作用,因此蛋白质功能的任何损害都可能涉及癌症的发展[2]。

FARP2基因与自闭症相关。在一项研究中,研究人员描述了一名患有自闭症和brachymetaphalangy的患者,符合2q37删除综合征的2q37删除综合征(也称为Albright遗传性骨营养不良样综合征或Brachydactyly-Mental Retardation综合征)的标准。他们的分子细胞遗传学研究表明,de novo删除的范围在2q37.3上的3.5 Mb区域。删除区域包括FARP2、HDLBP和PASK等基因,这些基因与骨骼或神经分化过程有关。基因表达分析显示,FARP2、HDLBP和PASK基因在患者细胞系中显著下调。研究人员假设这些基因的半合子不足可能导致了患者的临床表型[3]。

FARP2基因与高近视相关。在一项研究中,研究人员分析了18名患有高近视的波兰儿童和18名对照儿童的DNA甲基化模式。他们发现FARP2基因的启动子区域内的CG二核苷酸在患有高近视的儿童中甲基化水平显著降低。此外,他们还发现FARP2基因簇中的基因,包括ADAM20、ZFAND6、ETS1、ABHD13、SBSPON、SORBS2、LMOD3、ATXN1和FARP2,在患有高近视的儿童中甲基化水平降低。这些发现表明,FARP2基因的甲基化水平降低可能与早发性高近视有关[4]。

FARP2基因与牙本质再生相关。在一项研究中,研究人员研究了Sema3A对人牙髓干细胞(DPSCs)的影响。他们发现Sema3A诱导DPSC克隆的细胞迁移、趋化、增殖和成牙本质细胞分化。此外,Sema3A处理DPSC克隆增加了β-连环蛋白的核积累,上调了FARP2基因的表达,并激活了DPSC克隆中的Rac1。这些发现表明,Sema3A可能通过经典Wnt/β-连环蛋白信号通路在牙本质再生中发挥重要作用[5]。

FARP2基因与神经系统发育相关。在一项研究中,研究人员使用原位杂交技术研究了成年章鱼Sepia officinalis的脑中FARP2基因的表达模式。他们发现FARP2基因在色素细胞叶、血管运动叶和垂直叶中表达最强烈。此外,他们还在鳍叶、臂叶、前色素细胞叶、前、背和侧基叶、下前叶和上叶以及视叶中发现阳性染色。FARP2基因的表达模式表明,它可能参与色素细胞调节、摄食行为和学习记忆[6]。

FARP2基因与头颈部癌相关。在一项研究中,研究人员使用融合基因缺失的Sendai病毒(SeV/ΔF)作为非传递性载体,评估了FIR对头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的抗肿瘤作用。他们发现,使用编码FIR的SeV/ΔF(FIR-SeV/ΔF)载体处理后,FIR的表达显著抑制了c-Myc的表达,并诱导了HNSCC细胞中的细胞凋亡。这些发现表明,SeV/ΔF载体介导的FIR基因治疗可能是一种新的治疗HNSCC的策略[7]。

综上所述,FARP2基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞骨架组织、细胞迁移、信号转导和细胞增殖。FARP2基因在多种疾病中发挥重要作用,包括高密度脂蛋白胆固醇(HDL)水平、癌症、自闭症、高近视、牙本质再生和神经系统发育。FARP2基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Su, Zhiguang, Cox, Allison, Shen, Yuan, Stylianou, Ioannis M, Paigen, Beverly. 2008. Farp2 and Stk25 are candidate genes for the HDL cholesterol locus on mouse chromosome 1. In Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 29, 107-13. doi:10.1161/ATVBAHA.108.178384. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18988887/
2. Khoruddin, Nurul Ain, Noorizhab, Mohd NurFakhruzzaman, Teh, Lay Kek, Mohd Yusof, Farida Zuraina, Salleh, Mohd Zaki. 2021. Pathogenic nsSNPs that increase the risks of cancers among the Orang Asli and Malays. In Scientific reports, 11, 16158. doi:10.1038/s41598-021-95618-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34373545/
3. Felder, Bärbel, Radlwimmer, Bernhard, Benner, Axel, Lichter, Peter, Poustka, Annemarie. . FARP2, HDLBP and PASK are downregulated in a patient with autism and 2q37.3 deletion syndrome. In American journal of medical genetics. Part A, 149A, 952-9. doi:10.1002/ajmg.a.32779. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19365831/
4. Swierkowska, Joanna, Karolak, Justyna A, Vishweswaraiah, Sangeetha, Radhakrishna, Uppala, Gajecka, Marzena. . Decreased Levels of DNA Methylation in the PCDHA Gene Cluster as a Risk Factor for Early-Onset High Myopia in Young Children. In Investigative ophthalmology & visual science, 63, 31. doi:10.1167/iovs.63.9.31. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36036911/
5. Yoshida, S, Wada, N, Hasegawa, D, Hamano, S, Maeda, H. 2016. Semaphorin 3A Induces Odontoblastic Phenotype in Dental Pulp Stem Cells. In Journal of dental research, 95, 1282-90. doi:10.1177/0022034516653085. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27302880/
6. Zhang, Zhuobin, Tublitz, Nathan J. 2013. Expression of the SOFaRP2 gene in the central nervous system of the adult cuttlefish Sepia officinalis. In Neuropeptides, 47, 149-55. doi:10.1016/j.npep.2013.01.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23465584/
7. Tanaka, N, Araki, K, Mizokami, D, Shimada, H, Shiotani, A. 2015. Sendai virus-mediated gene transfer of the c-myc suppressor far-upstream element-binding protein-interacting repressor suppresses head and neck cancer. In Gene therapy, 22, 297-304. doi:10.1038/gt.2014.123. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25588744/