Taf5-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Taf5-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06908

品系全称

C57BL/6JCya-Taf5em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-226182-Taf5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Taf5-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06908) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TATA-box binding protein associated factor 5
基因别称
6330528C20Rik
染色体号
Chr 19 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_177342.3 | Ensembl: ENSMUST00000026027
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~738 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2442144Mice homozygous for a knock-out allele arrest before progressing to an egg-cylinder stage and show empty deciduae, failure of embryo implantation, aberrant lineage specification within the inner cell mass, and peri-implantation lethality.
Taf5,即TATA结合蛋白相关因子5,是转录起始因子TFIID的一个组成部分,TFIID负责调控真核生物基因的转录。Taf5作为转录共激活因子,在转录过程中扮演着重要的角色,参与调控基因的表达[1][2][3][4][5][6][7][8]。

在植物中,Taf5被发现与对真菌病害的抗性有关。例如,绿豆中的一种Taf5基因(LOC106765332,也称为VrTAF5)与对灰霉病菌引起的叶斑病的抗性有关。通过精细的QTL定位,研究人员发现VrTAF5基因在抗病品种V4718中发生突变,导致蛋白质中氨基酸的改变,从而赋予抗病性。这表明Taf5在植物抗病性中起着重要作用[1]。

在哺乳动物早期发育过程中,Taf5也扮演着重要的角色。小鼠中的Taf5基因突变会导致胚胎死亡,表现为胚胎植入失败和内细胞团谱系分化异常。这表明Taf5在早期胚胎发育和细胞命运决定中起着关键作用[2]。

此外,Taf5的突变与多种人类疾病相关,包括智力障碍、颅面发育不良和先天性心脏病。在斑马鱼中,Taf5和Taf1基因的敲除导致颅面发育不良、心脏发育异常和早期死亡。这些缺陷与TAFopathies相关,表明Taf5在颅面和心脏发育中起着重要作用[3]。

在结构生物学方面,Taf5的结构分析揭示了其具有形成二聚体的能力,这对于TFIID复合物的组装至关重要。此外,Taf5的结构中还包含几个保守的裂隙,这些裂隙可能对于TFIID复合物的组装至关重要[4]。

基因组规模的剪接变异筛选发现,TAF5基因的某些外显子的缺失会影响细胞活力。例如,TAF5基因的第八个外显子的包含对于TFIID转录起始复合物的组装至关重要,进而影响全球基因表达输出。这表明Taf5的不同外显子在细胞活力和基因表达调控中发挥着重要作用[5]。

Taf5也是SAGA转录共激活因子复合物的一个组成部分,SAGA负责调控真核生物基因的转录。SAGA复合物的结构分析揭示了Taf5与Spt20和Spt3形成紧密连接,并与其他Taf亚基相互作用。这些相互作用对于SAGA复合物的结构和功能至关重要[6]。

此外,Taf5还直接与转录激活因子Rap1相互作用,促进酵母核糖蛋白基因的转录。Taf5的Rap1结合域对于细胞活力至关重要,但其对于Taf-Taf相互作用和TFIID稳定性并非必需。这表明Taf5与Rap1的相互作用在核糖蛋白基因转录中发挥着关键作用[7]。

Taf5在转录调控和基因表达中发挥着重要作用,其结构与功能的研究对于深入理解真核生物基因转录机制和调控网络具有重要意义。Taf5的突变与多种疾病相关,包括植物抗病性、哺乳动物早期发育异常、智力障碍和颅面发育不良。这些发现为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Yundaeng, Chutintorn, Somta, Prakit, Chen, Jingbin, Chankaew, Sompong, Chen, Xin. 2020. Fine mapping of QTL conferring Cercospora leaf spot disease resistance in mungbean revealed TAF5 as candidate gene for the resistance. In TAG. Theoretical and applied genetics. Theoretische und angewandte Genetik, 134, 701-714. doi:10.1007/s00122-020-03724-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33188437/
2. He, Xinjian Doris, Phillips, Shelby, Hioki, Kaito, Pobezinsky, Leonid A, Mager, Jesse. 2024. TATA-binding associated factors have distinct roles during early mammalian development. In Developmental biology, 511, 53-62. doi:10.1016/j.ydbio.2024.04.002. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38593904/
3. Leid, Jamison, Gray, Ryan, Rakita, Peter, Solnica-Krezel, Lilianna, Lavine, Kory J. 2023. Deletion of taf1 and taf5 in zebrafish capitulate cardiac and craniofacial abnormalities associated with TAFopathies through perturbations in metabolism. In Biology open, 12, . doi:10.1242/bio.059905. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37746814/
4. Bhattacharya, Suparna, Takada, Shinako, Jacobson, Raymond H. 2007. Structural analysis and dimerization potential of the human TAF5 subunit of TFIID. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 104, 1189-94. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17227857/
5. Xiao, Mei-Sheng, Damodaran, Arun Prasath, Kumari, Bandana, Aregger, Michael, Gonatopoulos-Pournatzis, Thomas. 2024. Genome-scale exon perturbation screens uncover exons critical for cell fitness. In Molecular cell, 84, 2553-2572.e19. doi:10.1016/j.molcel.2024.05.024. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38917794/
6. Wang, Haibo, Dienemann, Christian, Stützer, Alexandra, Cheung, Alan C M, Cramer, Patrick. 2020. Structure of the transcription coactivator SAGA. In Nature, 577, 717-720. doi:10.1038/s41586-020-1933-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31969703/
7. Layer, Justin H, Miller, Scott G, Weil, P Anthony. 2010. Direct transactivator-transcription factor IID (TFIID) contacts drive yeast ribosomal protein gene transcription. In The Journal of biological chemistry, 285, 15489-15499. doi:10.1074/jbc.M110.104810. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20189987/
8. Kolesnikova, Olga, Ben-Shem, Adam, Luo, Jie, Schultz, Patrick, Papai, Gabor. 2018. Molecular structure of promoter-bound yeast TFIID. In Nature communications, 9, 4666. doi:10.1038/s41467-018-07096-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30405110/