Rrp36-flox 基因敲除小鼠

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产品名称

Rrp36-flox 基因敲除小鼠

产品编号

S-CKO-06786

品系全称

C57BL/6JCya-Rrp36em1flox/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

CKOCMP-224823-Rrp36-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rrp36-flox 基因敲除小鼠 mice (Strain S-CKO-06786) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
cKO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ribosomal RNA processing 36
基因别称
-
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_144857.2 | Ensembl: ENSMUST00000233136
修饰方式
条件性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~1012 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Rrp36,也称为Ribosomal RNA Processing 36,是一种在真核生物中参与核糖体生物合成的关键基因。在核糖体生物合成过程中,Rrp36蛋白在细胞核仁中发挥作用,与90S和前40S前核糖体颗粒相互作用。Rrp36蛋白的缺乏会影响35S前rRNA的早期切割,导致成熟的18S rRNA水平迅速下降。Rrp36蛋白是90S前核糖体的一种新成分,其组装过程被认为是逐步整合几个模块的结果,包括tUTP/UTP-A、PWP2/UTP-B和UTP-C亚复合物。研究表明,Rrp36蛋白的缺乏不会影响这些亚复合物和U3小核仁RNA的整合到前核糖体中。相反,UTP-A或UTP-B模块成分的缺乏,而不是Rrp5p,会阻止Rrp36蛋白的招募并降低其积累水平。此外,人类Rrp36蛋白在HeLa细胞中的功能在进化过程中在真核生物中得到了保守[1]。

研究表明,来自不同细胞来源的细胞外囊泡(exosomes)对骨髓间充质干细胞(BMSCs)分化为雪旺细胞(SCs)的影响不同。与雪旺细胞来源的细胞外囊泡(SC-exos)和神经干细胞来源的细胞外囊泡(NSC-exos)相比,成纤维细胞来源的细胞外囊泡(Fb-exos)在诱导BMSCs分化为SCs方面没有明显的诱导作用。研究通过RNA测序比较了三种细胞来源的细胞外囊泡对BMSCs分化为SCs的诱导作用,并进一步缩小了目标基因和相关基因通路的范围,以研究其相关机制。结果表明,SC-exos和NSC-exos表现出显著的分化效率,而RSC96-exos在三种细胞来源的细胞外囊泡中表现出最高的分化效率。此外,研究还发现,SC-exos和NSC-exos中存在两个共同上调的基因,分别是核黄素激酶(RFK)和核糖体RNA处理36(Rrp36)。此外,90个GO术语与神经和轴突相关,并且三种类型的细胞外囊泡共鉴定出13个差异表达通路[2]。

SLC24A2基因被鉴定为与空腹血糖(FPG)强烈相关的关键基因。研究通过多组学整合分析发现,SLC24A2可能与2型糖尿病(T2D)和癌症之间存在潜在联系。SLC24A2在胰岛β细胞中表达,并在17种癌症中表现出异常表达,与10种癌症的预后显著相关。SLC24A2相关的基因,包括Rrp36,在真核生物的核糖体生物合成中发挥重要作用。研究还发现,SLC24A2与T2D和FPG相关的基因富集在癌症相关通路中。此外,SLC24A2与T2D和FPG相关的基因被分为8个功能模块,其中灰模块与T2D和FPG呈负相关,并显著参与核糖体生物合成。SLC24A2相关基因的LASSO模型准确预测了T2D的发生(AUC = 0.841)。这些结果表明,SLC24A2可能通过影响胰岛β细胞的核糖体功能来连接T2D和癌症,并在不同癌症中发挥不同的预后作用[3]。

综上所述,Rrp36是一种在真核生物中参与核糖体生物合成的关键基因。Rrp36蛋白在细胞核仁中发挥作用,与90S和前40S前核糖体颗粒相互作用。Rrp36蛋白的缺乏会影响35S前rRNA的早期切割,导致成熟的18S rRNA水平迅速下降。此外,Rrp36蛋白的缺乏不会影响tUTP/UTP-A、PWP2/UTP-B和UTP-C亚复合物以及U3小核仁RNA的整合到前核糖体中。人类Rrp36蛋白在HeLa细胞中的功能在进化过程中在真核生物中得到了保守。细胞外囊泡在BMSCs分化为SCs中发挥重要作用,其中SC-exos和NSC-exos表现出显著的分化效率。Rrp36蛋白在细胞外囊泡的诱导作用中发挥作用,与SC-exos和NSC-exos中共同上调的基因RFK和Rrp36相关。SLC24A2基因可能与2型糖尿病和癌症之间存在潜在联系,Rrp36作为SLC24A2相关基因之一,在核糖体生物合成中发挥重要作用。这些研究为进一步理解核糖体生物合成和疾病发生机制提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Gérus, Marie, Bonnart, Chrystelle, Caizergues-Ferrer, Michèle, Henry, Yves, Henras, Anthony K. 2009. Evolutionarily conserved function of RRP36 in early cleavages of the pre-rRNA and production of the 40S ribosomal subunit. In Molecular and cellular biology, 30, 1130-44. doi:10.1128/MCB.00999-09. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20038530/
2. Zhang, Xianxiang, Zhang, Weiwei, Sun, Hao, Wang, Hui. 2024. The effects of exosomes originating from different cell sources on the differentiation of bone marrow mesenchymal stem cells into schwann cells. In Journal of nanobiotechnology, 22, 220. doi:10.1186/s12951-024-02450-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38698449/
3. Bian, Qin, Li, Haijun, Wang, Xiaoyi, Liang, Tingting, Zhang, Kai. 2022. Multiomics Integrated Analysis Identifies SLC24A2 as a Potential Link between Type 2 Diabetes and Cancer. In Journal of diabetes research, 2022, 4629419. doi:10.1155/2022/4629419. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35601016/